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global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
RIP RIP 'RIBOSE(PYRANOSE FORM) ' pyranose 20 10 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_RIP
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
RIP C1 C CH1 0.000 0.000 0.000 0.000
RIP H1 H H 0.000 -0.137 1.090 -0.017
RIP O1 O OH1 0.000 1.034 -0.362 -0.917
RIP HO1 H H 0.000 1.859 0.073 -0.660
RIP O5 O O2 0.000 0.365 -0.411 1.316
RIP C5 C CH2 0.000 -0.599 0.121 2.219
RIP H51 H H 0.000 -0.692 1.197 2.053
RIP H52 H H 0.000 -0.271 -0.060 3.244
RIP C4 C CH1 0.000 -1.954 -0.551 1.988
RIP H4 H H 0.000 -1.855 -1.636 2.133
RIP C3 C CH1 0.000 -2.417 -0.265 0.555
RIP H3 H H 0.000 -3.329 -0.840 0.340
RIP O3 O OH1 0.000 -2.683 1.130 0.407
RIP HO3 H H 0.000 -3.385 1.390 1.019
RIP C2 C CH1 0.000 -1.305 -0.682 -0.413
RIP H2 H H 0.000 -1.176 -1.773 -0.376
RIP O2 O OH1 0.000 -1.652 -0.287 -1.741
RIP HO2 H H 0.000 -0.946 -0.547 -2.349
RIP O4 O OH1 0.000 -2.910 -0.031 2.913
RIP HO4 H H 0.000 -2.578 -0.230 3.800
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
RIP C1 n/a O5 START
RIP H1 C1 . .
RIP O1 C1 HO1 .
RIP HO1 O1 . .
RIP O5 C1 . END
RIP C5 O5 C4 .
RIP H51 C5 . .
RIP H52 C5 . .
RIP C4 C5 O4 .
RIP H4 C4 . .
RIP C3 C4 C2 .
RIP H3 C3 . .
RIP O3 C3 HO3 .
RIP HO3 O3 . .
RIP C2 C3 O2 .
RIP H2 C2 . .
RIP O2 C2 HO2 .
RIP HO2 O2 . .
RIP O4 C4 . .
RIP HO4 O4 . .
RIP C1 C2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
RIP C1 C2 single 1.524 0.020
RIP O1 C1 single 1.432 0.020
RIP O5 C1 single 1.426 0.020
RIP H1 C1 single 1.099 0.020
RIP C2 C3 single 1.524 0.020
RIP O2 C2 single 1.432 0.020
RIP H2 C2 single 1.099 0.020
RIP C3 C4 single 1.524 0.020
RIP O3 C3 single 1.432 0.020
RIP H3 C3 single 1.099 0.020
RIP C4 C5 single 1.524 0.020
RIP O4 C4 single 1.432 0.020
RIP H4 C4 single 1.099 0.020
RIP C5 O5 single 1.426 0.020
RIP H51 C5 single 1.092 0.020
RIP H52 C5 single 1.092 0.020
RIP HO1 O1 single 0.967 0.020
RIP HO2 O2 single 0.967 0.020
RIP HO3 O3 single 0.967 0.020
RIP HO4 O4 single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
RIP H1 C1 O1 109.470 3.000
RIP H1 C1 O5 109.470 3.000
RIP O1 C1 O5 109.470 3.000
RIP H1 C1 C2 108.340 3.000
RIP O1 C1 C2 109.470 3.000
RIP O5 C1 C2 109.470 3.000
RIP C1 O1 HO1 109.470 3.000
RIP C1 O5 C5 111.800 3.000
RIP O5 C5 H51 109.470 3.000
RIP O5 C5 H52 109.470 3.000
RIP O5 C5 C4 109.470 3.000
RIP H51 C5 H52 107.900 3.000
RIP H51 C5 C4 109.470 3.000
RIP H52 C5 C4 109.470 3.000
RIP C5 C4 H4 108.340 3.000
RIP C5 C4 C3 111.000 3.000
RIP C5 C4 O4 109.470 3.000
RIP H4 C4 C3 108.340 3.000
RIP H4 C4 O4 109.470 3.000
RIP C3 C4 O4 109.470 3.000
RIP C4 C3 H3 108.340 3.000
RIP C4 C3 O3 109.470 3.000
RIP C4 C3 C2 111.000 3.000
RIP H3 C3 O3 109.470 3.000
RIP H3 C3 C2 108.340 3.000
RIP O3 C3 C2 109.470 3.000
RIP C3 O3 HO3 109.470 3.000
RIP C3 C2 H2 108.340 3.000
RIP C3 C2 O2 109.470 3.000
RIP C3 C2 C1 111.000 3.000
RIP H2 C2 O2 109.470 3.000
RIP H2 C2 C1 108.340 3.000
RIP O2 C2 C1 109.470 3.000
RIP C2 O2 HO2 109.470 3.000
RIP C4 O4 HO4 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
RIP var_1 O5 C1 O1 HO1 -59.972 20.000 1
RIP var_2 C1 O5 C5 C4 60.000 20.000 1
RIP var_3 O5 C5 C4 O4 180.000 20.000 3
RIP var_4 C5 C4 C3 C2 60.000 20.000 3
RIP var_5 C4 C3 O3 HO3 -60.786 20.000 1
RIP var_6 C4 C3 C2 O2 180.000 20.000 3
RIP var_7 C3 C2 C1 O5 60.000 20.000 3
RIP var_8 C3 C2 O2 HO2 179.696 20.000 1
RIP var_1 C5 O5 C1 C2 0.000 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
RIP chir_01 C1 C2 O1 O5 positiv
RIP chir_02 C2 C1 C3 O2 negativ
RIP chir_03 C3 C2 C4 O3 negativ
RIP chir_04 C4 C3 C5 O4 negativ
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