File: RO4.cif

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global_
_lib_name         ?
_lib_version      ?
_lib_update       ?
# ------------------------------------------------
#
# ---   LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
RO4      RO4 '"[[1-[N-HYDROXY-ACETAMIDYL]-3-METHYL' non-polymer        63  28 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_RO4
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 RO4           O29    O    O        -0.500      0.000    0.000    0.000
 RO4           C28    C    C         0.000     -0.102   -0.299   -1.210
 RO4           O30    O    O2       -0.500      0.924   -0.541   -1.883
 RO4           C31    C    CH2       0.000      2.308   -0.493   -1.309
 RO4           H311   H    H         0.000      2.356   -1.209   -0.486
 RO4           H312   H    H         0.000      2.476    0.515   -0.923
 RO4           C32    C    CH3       0.000      3.384   -0.830   -2.343
 RO4           H323   H    H         0.000      3.222   -1.808   -2.720
 RO4           H322   H    H         0.000      3.340   -0.135   -3.143
 RO4           H321   H    H         0.000      4.342   -0.783   -1.891
 RO4           C14    C    CH1       0.000     -1.461   -0.368   -1.858
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 RO4           C27    C    CH3       0.000     -1.529    0.637   -3.010
 RO4           H273   H    H         0.000     -0.784    0.404   -3.727
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 RO4           N7     N    NH1       0.000     -2.491   -0.045   -0.868
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 RO4           H20    H    H         0.000     -6.677   -0.801    1.872
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 RO4           H222   H    H         0.000     -5.995    0.815    3.653
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 RO4           C21    C    CH3       0.000     -5.627   -1.828    3.455
 RO4           H213   H    H         0.000     -5.858   -2.792    3.081
 RO4           H212   H    H         0.000     -4.657   -1.840    3.882
 RO4           H211   H    H         0.000     -6.334   -1.559    4.197
 RO4           N5     N    NH1       0.000     -6.103   -0.413   -0.557
 RO4           HN5    H    H         0.000     -6.360   -1.290   -0.988
 RO4           C11    C    C         0.000     -6.979    0.610   -0.538
 RO4           O3     O    O         0.000     -6.664    1.667   -0.034
 RO4           C10    C    CH1       0.000     -8.349    0.442   -1.142
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 RO4           C15    C    CH2       0.000     -8.236    0.437   -2.668
 RO4           H151   H    H         0.000     -7.199    0.621   -2.956
 RO4           H152   H    H         0.000     -8.872    1.222   -3.082
 RO4           C16    C    CH1       0.000     -8.684   -0.922   -3.208
 RO4           H16    H    H         0.000     -9.714   -1.124   -2.882
 RO4           C18    C    CH3       0.000     -7.756   -2.014   -2.673
 RO4           H183   H    H         0.000     -7.845   -2.070   -1.619
 RO4           H182   H    H         0.000     -8.024   -2.947   -3.099
 RO4           H181   H    H         0.000     -6.754   -1.785   -2.930
 RO4           C17    C    CH3       0.000     -8.627   -0.907   -4.736
 RO4           H173   H    H         0.000     -9.269   -0.151   -5.107
 RO4           H172   H    H         0.000     -7.634   -0.712   -5.052
 RO4           H171   H    H         0.000     -8.937   -1.848   -5.111
 RO4           C9     C    CH2       0.000     -9.246    1.601   -0.702
 RO4           H91    H    H         0.000     -8.812    2.545   -1.039
 RO4           H92    H    H         0.000     -9.325    1.607    0.387
 RO4           C8     C    C         0.000    -10.616    1.433   -1.306
 RO4           O1     O    O         0.000    -10.852    0.481   -2.019
 RO4           N6     N    NH1       0.000    -11.581    2.341   -1.055
 RO4           HN6    H    H         0.000    -11.384    3.135   -0.462
 RO4           O2     O    OH1       0.000    -12.868    2.183   -1.622
 RO4           HO2    H    H         0.000    -13.566    2.834   -1.445
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
 RO4      O29    n/a    C28    START
 RO4      C28    O29    C14    .
 RO4      O30    C28    C31    .
 RO4      C31    O30    C32    .
 RO4      H311   C31    .      .
 RO4      H312   C31    .      .
 RO4      C32    C31    H321   .
 RO4      H323   C32    .      .
 RO4      H322   C32    .      .
 RO4      H321   C32    .      .
 RO4      C14    C28    N7     .
 RO4      H14    C14    .      .
 RO4      C27    C14    H271   .
 RO4      H273   C27    .      .
 RO4      H272   C27    .      .
 RO4      H271   C27    .      .
 RO4      N7     C14    C13    .
 RO4      HN7    N7     .      .
 RO4      C13    N7     C12    .
 RO4      O4     C13    .      .
 RO4      C12    C13    N5     .
 RO4      H12    C12    .      .
 RO4      C19    C12    C20    .
 RO4      H191   C19    .      .
 RO4      H192   C19    .      .
 RO4      C20    C19    C21    .
 RO4      H20    C20    .      .
 RO4      C22    C20    H221   .
 RO4      H223   C22    .      .
 RO4      H222   C22    .      .
 RO4      H221   C22    .      .
 RO4      C21    C20    H211   .
 RO4      H213   C21    .      .
 RO4      H212   C21    .      .
 RO4      H211   C21    .      .
 RO4      N5     C12    C11    .
 RO4      HN5    N5     .      .
 RO4      C11    N5     C10    .
 RO4      O3     C11    .      .
 RO4      C10    C11    C9     .
 RO4      H10    C10    .      .
 RO4      C15    C10    C16    .
 RO4      H151   C15    .      .
 RO4      H152   C15    .      .
 RO4      C16    C15    C17    .
 RO4      H16    C16    .      .
 RO4      C18    C16    H181   .
 RO4      H183   C18    .      .
 RO4      H182   C18    .      .
 RO4      H181   C18    .      .
 RO4      C17    C16    H171   .
 RO4      H173   C17    .      .
 RO4      H172   C17    .      .
 RO4      H171   C17    .      .
 RO4      C9     C10    C8     .
 RO4      H91    C9     .      .
 RO4      H92    C9     .      .
 RO4      C8     C9     N6     .
 RO4      O1     C8     .      .
 RO4      N6     C8     O2     .
 RO4      HN6    N6     .      .
 RO4      O2     N6     HO2    .
 RO4      HO2    O2     .      END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
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_chem_comp_bond.type
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 RO4      H173   C17    H172    109.470    3.000
 RO4      H173   C17    H171    109.470    3.000
 RO4      H172   C17    H171    109.470    3.000
 RO4      C10    C9     H91     109.470    3.000
 RO4      C10    C9     H92     109.470    3.000
 RO4      C10    C9     C8      109.470    3.000
 RO4      H91    C9     H92     107.900    3.000
 RO4      H91    C9     C8      109.470    3.000
 RO4      H92    C9     C8      109.470    3.000
 RO4      C9     C8     O1      120.500    3.000
 RO4      C9     C8     N6      116.500    3.000
 RO4      O1     C8     N6      123.000    3.000
 RO4      C8     N6     HN6     120.000    3.000
 RO4      C8     N6     O2      120.000    3.000
 RO4      HN6    N6     O2      120.200    3.000
 RO4      N6     O2     HO2     120.000    3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 RO4      var_1    O29    C28    O30    C31       -0.036   20.000   1
 RO4      var_2    C28    O30    C31    C32     -179.993   20.000   1
 RO4      var_3    O30    C31    C32    H321    -179.950   20.000   3
 RO4      var_4    O29    C28    C14    N7         0.041   20.000   3
 RO4      var_5    C28    C14    C27    H271     -59.997   20.000   3
 RO4      var_6    C28    C14    N7     C13     -149.988   20.000   3
 RO4      CONST_1  C14    N7     C13    C12      180.000    0.000   0
 RO4      var_7    N7     C13    C12    N5       153.892   20.000   3
 RO4      var_8    C13    C12    C19    C20      176.712   20.000   3
 RO4      var_9    C12    C19    C20    C21      175.054   20.000   3
 RO4      var_10   C19    C20    C22    H221     -55.227   20.000   3
 RO4      var_11   C19    C20    C21    H211    -179.986   20.000   3
 RO4      var_12   C13    C12    N5     C11     -124.892   20.000   3
 RO4      CONST_2  C12    N5     C11    C10      180.000    0.000   0
 RO4      var_13   N5     C11    C10    C9       166.509   20.000   3
 RO4      var_14   C11    C10    C15    C16      116.464   20.000   3
 RO4      var_15   C10    C15    C16    C17      177.646   20.000   3
 RO4      var_16   C15    C16    C18    H181     -56.159   20.000   3
 RO4      var_17   C15    C16    C17    H171     179.993   20.000   3
 RO4      var_18   C11    C10    C9     C8       180.000   20.000   3
 RO4      var_19   C10    C9     C8     N6      -179.998   20.000   3
 RO4      CONST_3  C9     C8     N6     O2       180.000    0.000   0
 RO4      var_20   C8     N6     O2     HO2      179.975   20.000   1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 RO4      chir_01  C10    C11    C9     C15       negativ
 RO4      chir_02  C12    N5     C13    C19       positiv
 RO4      chir_03  C14    N7     C28    C27       positiv
 RO4      chir_04  C16    C15    C17    C18       negativ
 RO4      chir_05  C20    C19    C21    C22       negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 RO4      plan-1    N6        0.020
 RO4      plan-1    O2        0.020
 RO4      plan-1    C8        0.020
 RO4      plan-1    HN6       0.020
 RO4      plan-2    N7        0.020
 RO4      plan-2    C13       0.020
 RO4      plan-2    C14       0.020
 RO4      plan-2    HN7       0.020
 RO4      plan-3    N5        0.020
 RO4      plan-3    C11       0.020
 RO4      plan-3    C12       0.020
 RO4      plan-3    HN5       0.020
 RO4      plan-4    C8        0.020
 RO4      plan-4    O1        0.020
 RO4      plan-4    N6        0.020
 RO4      plan-4    C9        0.020
 RO4      plan-4    HN6       0.020
 RO4      plan-5    C11       0.020
 RO4      plan-5    O3        0.020
 RO4      plan-5    N5        0.020
 RO4      plan-5    C10       0.020
 RO4      plan-5    HN5       0.020
 RO4      plan-6    C13       0.020
 RO4      plan-6    O4        0.020
 RO4      plan-6    N7        0.020
 RO4      plan-6    C12       0.020
 RO4      plan-6    HN7       0.020
 RO4      plan-7    C28       0.020
 RO4      plan-7    O29       0.020
 RO4      plan-7    O30       0.020
 RO4      plan-7    C14       0.020
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