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501
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|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
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loop_
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_chem_comp.three_letter_code
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_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
SCR SCR 'SUCROSE OCTASULFATE ' pyranose 77 55 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_SCR
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
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SCR H54 H H 0.000 -4.021 -1.176 6.273
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SCR H34 H H 0.000 -0.941 -4.108 -3.336
SCR O32 O OS 0.000 1.059 -5.432 -2.110
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SCR H2 H H 0.000 1.858 -0.974 -0.521
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SCR S2 S ST 0.000 1.826 -0.391 -2.742
SCR O22 O OS 0.000 1.559 -0.239 -4.130
SCR O23 O OS 0.000 2.224 0.653 -1.863
SCR O24 O OH1 0.000 2.915 -1.450 -2.645
SCR H24 H H 0.000 3.779 -1.241 -2.982
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
SCR C1 n/a O5 START
SCR H1 C1 . .
SCR O1 C1 C12 .
SCR C12 O1 O10 .
SCR C11 C12 O81 .
SCR H111 C11 . .
SCR H112 C11 . .
SCR O81 C11 S11 .
SCR S11 O81 O82 .
SCR O83 S11 . .
SCR O84 S11 H84 .
SCR H84 O84 . .
SCR O82 S11 . .
SCR O10 C12 C15 .
SCR C15 O10 C14 .
SCR H15 C15 . .
SCR C16 C15 O51 .
SCR H161 C16 . .
SCR H162 C16 . .
SCR O51 C16 S14 .
SCR S14 O51 O52 .
SCR O53 S14 . .
SCR O54 S14 H54 .
SCR H54 O54 . .
SCR O52 S14 . .
SCR C14 C15 C13 .
SCR H14 C14 . .
SCR O71 C14 S13 .
SCR S13 O71 O72 .
SCR O73 S13 . .
SCR O74 S13 H74 .
SCR H74 O74 . .
SCR O72 S13 . .
SCR C13 C14 O91 .
SCR H13 C13 . .
SCR O91 C13 S12 .
SCR S12 O91 O93 .
SCR O92 S12 . .
SCR O94 S12 H94 .
SCR H94 O94 . .
SCR O93 S12 . .
SCR O5 C1 . END
SCR C5 O5 C4 .
SCR H5 C5 . .
SCR C6 C5 O6 .
SCR H61 C6 . .
SCR H62 C6 . .
SCR O6 C6 S6 .
SCR S6 O6 O62 .
SCR O63 S6 . .
SCR O64 S6 H64 .
SCR H64 O64 . .
SCR O62 S6 . .
SCR C4 C5 C3 .
SCR H4 C4 . .
SCR O4 C4 S4 .
SCR S4 O4 O42 .
SCR O43 S4 . .
SCR O44 S4 H44 .
SCR H44 O44 . .
SCR O42 S4 . .
SCR C3 C4 C2 .
SCR H3 C3 . .
SCR O3 C3 S3 .
SCR S3 O3 O32 .
SCR O33 S3 . .
SCR O34 S3 H34 .
SCR H34 O34 . .
SCR O32 S3 . .
SCR C2 C3 O2 .
SCR H2 C2 . .
SCR O2 C2 S2 .
SCR S2 O2 O24 .
SCR O22 S2 . .
SCR O23 S2 . .
SCR O24 S2 H24 .
SCR H24 O24 . .
SCR C1 C2 . ADD
SCR C12 C13 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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SCR O1 C1 single 1.426 0.020
SCR O5 C1 single 1.426 0.020
SCR H1 C1 single 1.099 0.020
SCR C2 C3 single 1.524 0.020
SCR O2 C2 single 1.426 0.020
SCR H2 C2 single 1.099 0.020
SCR C3 C4 single 1.524 0.020
SCR O3 C3 single 1.426 0.020
SCR H3 C3 single 1.099 0.020
SCR C4 C5 single 1.524 0.020
SCR O4 C4 single 1.426 0.020
SCR H4 C4 single 1.099 0.020
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SCR H5 C5 single 1.099 0.020
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SCR H62 C6 single 1.092 0.020
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SCR O22 S2 double 1.436 0.020
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SCR H24 O24 single 0.967 0.020
SCR S3 O3 single 1.535 0.020
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SCR O34 S3 single 1.635 0.020
SCR H34 O34 single 0.967 0.020
SCR S4 O4 single 1.535 0.020
SCR O42 S4 double 1.436 0.020
SCR O43 S4 double 1.436 0.020
SCR O44 S4 single 1.635 0.020
SCR H44 O44 single 0.967 0.020
SCR S6 O6 single 1.535 0.020
SCR O62 S6 double 1.436 0.020
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SCR O52 S14 double 1.436 0.020
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loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
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_chem_comp_chir.volume_sign
SCR chir_01 C1 C2 O1 O5 negativ
SCR chir_02 C2 C1 C3 O2 negativ
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