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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
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#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
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_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
SUD SUD '4-DIPHOSPHOCYTIDYL-2-C-METHYL-D-ERYT' non-polymer 59 37 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
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#
loop_
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_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
SUD O37 n/a P34 START
SUD P34 O37 O31 .
SUD O35 P34 . .
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SUD H322 C32 . .
SUD H321 C32 . .
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SUD H33 O33 . .
SUD C1 C27 O2B .
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SUD H12 C1 . .
SUD O2B C1 PB .
SUD PB O2B O3A .
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SUD O3B PB . .
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SUD O1A PA . .
SUD O2A PA . .
SUD "O5'" PA "C5'" .
SUD "C5'" "O5'" "C4'" .
SUD "H5'1" "C5'" . .
SUD "H5'2" "C5'" . .
SUD "C4'" "C5'" "O4'" .
SUD "H4'" "C4'" . .
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SUD "H3'" "C3'" . .
SUD "O3'" "C3'" H2 .
SUD H2 "O3'" . .
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SUD "H2'" "C2'" . .
SUD "O2'" "C2'" H1 .
SUD H1 "O2'" . .
SUD "O4'" "C4'" "C1'" .
SUD "C1'" "O4'" N1 .
SUD "H1'" "C1'" . .
SUD N1 "C1'" C6 .
SUD C6 N1 C5 .
SUD H6 C6 . .
SUD C5 C6 C4 .
SUD H5 C5 . .
SUD C4 C5 N3 .
SUD N4 C4 HN41 .
SUD HN42 N4 . .
SUD HN41 N4 . .
SUD N3 C4 C3 .
SUD C3 N3 O8 .
SUD O8 C3 . END
SUD N1 C3 . ADD
SUD "C1'" "C2'" . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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_chem_comp_angle.comp_id
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SUD O3A PA O1A 108.200 3.000
SUD O3A PA O2A 108.200 3.000
SUD O3A PA "O5'" 102.600 3.000
SUD O1A PA O2A 119.900 3.000
SUD O1A PA "O5'" 108.200 3.000
SUD O2A PA "O5'" 108.200 3.000
SUD PA "O5'" "C5'" 120.500 3.000
SUD "O5'" "C5'" "H5'1" 109.470 3.000
SUD "O5'" "C5'" "H5'2" 109.470 3.000
SUD "O5'" "C5'" "C4'" 109.470 3.000
SUD "H5'1" "C5'" "H5'2" 107.900 3.000
SUD "H5'1" "C5'" "C4'" 109.470 3.000
SUD "H5'2" "C5'" "C4'" 109.470 3.000
SUD "C5'" "C4'" "H4'" 108.340 3.000
SUD "C5'" "C4'" "C3'" 111.000 3.000
SUD "C5'" "C4'" "O4'" 109.470 3.000
SUD "H4'" "C4'" "C3'" 108.340 3.000
SUD "H4'" "C4'" "O4'" 109.470 3.000
SUD "C3'" "C4'" "O4'" 109.470 3.000
SUD "C4'" "C3'" "H3'" 108.340 3.000
SUD "C4'" "C3'" "O3'" 109.470 3.000
SUD "C4'" "C3'" "C2'" 111.000 3.000
SUD "H3'" "C3'" "O3'" 109.470 3.000
SUD "H3'" "C3'" "C2'" 108.340 3.000
SUD "O3'" "C3'" "C2'" 109.470 3.000
SUD "C3'" "O3'" H2 109.470 3.000
SUD "C3'" "C2'" "H2'" 108.340 3.000
SUD "C3'" "C2'" "O2'" 109.470 3.000
SUD "C3'" "C2'" "C1'" 111.000 3.000
SUD "H2'" "C2'" "O2'" 109.470 3.000
SUD "H2'" "C2'" "C1'" 108.340 3.000
SUD "O2'" "C2'" "C1'" 109.470 3.000
SUD "C2'" "O2'" H1 109.470 3.000
SUD "C4'" "O4'" "C1'" 111.800 3.000
SUD "O4'" "C1'" "H1'" 109.470 3.000
SUD "O4'" "C1'" N1 109.470 3.000
SUD "O4'" "C1'" "C2'" 109.470 3.000
SUD "H1'" "C1'" N1 109.470 3.000
SUD "H1'" "C1'" "C2'" 108.340 3.000
SUD N1 "C1'" "C2'" 109.470 3.000
SUD "C1'" N1 C6 120.000 3.000
SUD "C1'" N1 C3 120.000 3.000
SUD C6 N1 C3 120.000 3.000
SUD N1 C6 H6 120.000 3.000
SUD N1 C6 C5 120.000 3.000
SUD H6 C6 C5 120.000 3.000
SUD C6 C5 H5 120.000 3.000
SUD C6 C5 C4 120.000 3.000
SUD H5 C5 C4 120.000 3.000
SUD C5 C4 N4 120.000 3.000
SUD C5 C4 N3 120.000 3.000
SUD N4 C4 N3 120.000 3.000
SUD C4 N4 HN42 120.000 3.000
SUD C4 N4 HN41 120.000 3.000
SUD HN42 N4 HN41 120.000 3.000
SUD C4 N3 C3 120.000 3.000
SUD N3 C3 O8 120.000 3.000
SUD N3 C3 N1 120.000 3.000
SUD O8 C3 N1 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
SUD var_1 O37 P34 O31 C28 -172.046 20.000 1
SUD var_2 P34 O31 C28 C27 -160.388 20.000 1
SUD var_3 O31 C28 C32 H321 -172.835 20.000 1
SUD var_4 O31 C28 C29 O30 60.693 20.000 1
SUD var_5 C28 C29 O30 H30 179.995 20.000 1
SUD var_6 O31 C28 C27 C1 65.035 20.000 1
SUD var_7 C28 C27 O33 H33 -60.010 20.000 1
SUD var_8 C28 C27 C1 O2B -175.035 20.000 3
SUD var_9 C27 C1 O2B PB 179.992 20.000 1
SUD var_10 C1 O2B PB O3A 175.047 20.000 1
SUD var_11 O2B PB O3A PA -159.989 20.000 1
SUD var_12 PB O3A PA "O5'" 165.011 20.000 1
SUD var_13 O3A PA "O5'" "C5'" -175.016 20.000 1
SUD var_14 PA "O5'" "C5'" "C4'" 179.950 20.000 1
SUD var_15 "O5'" "C5'" "C4'" "O4'" 66.713 20.000 3
SUD var_16 "C5'" "C4'" "C3'" "C2'" -120.000 20.000 3
SUD var_17 "C4'" "C3'" "O3'" H2 176.178 20.000 1
SUD var_18 "C4'" "C3'" "C2'" "O2'" -150.000 20.000 3
SUD var_19 "C3'" "C2'" "O2'" H1 -67.328 20.000 1
SUD var_20 "C5'" "C4'" "O4'" "C1'" 150.000 20.000 1
SUD var_21 "C4'" "O4'" "C1'" N1 -150.000 20.000 1
SUD var_22 "O4'" "C1'" "C2'" "C3'" 30.000 20.000 3
SUD var_23 "O4'" "C1'" N1 C6 -126.454 20.000 1
SUD CONST_1 "C1'" N1 C3 N3 180.000 0.000 0
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SUD CONST_3 N1 C6 C5 C4 0.000 0.000 0
SUD CONST_4 C6 C5 C4 N3 0.000 0.000 0
SUD CONST_5 C5 C4 N4 HN41 -0.035 0.000 0
SUD CONST_6 C5 C4 N3 C3 0.000 0.000 0
SUD CONST_7 C4 N3 C3 O8 180.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
SUD chir_01 "C1'" N1 "C2'" "O4'" negativ
SUD chir_02 "C2'" "C1'" "O2'" "C3'" positiv
SUD chir_03 "C3'" "C2'" "C4'" "O3'" negativ
SUD chir_04 "C4'" "C3'" "O4'" "C5'" positiv
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SUD chir_06 C28 C27 C29 O31 positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
SUD plan-1 N1 0.020
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SUD plan-1 C6 0.020
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SUD plan-1 O8 0.020
SUD plan-1 N4 0.020
SUD plan-1 H5 0.020
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SUD plan-2 N4 0.020
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SUD plan-2 HN41 0.020
SUD plan-2 HN42 0.020
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