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global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
TSD TSD '3-TRIMETHYLSILYL-PROPIONATE-2,2,3,3,' non-polymer 30 13 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_TSD
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
TSD O13 O OC -0.500 0.000 0.000 0.000
TSD C1 C C 0.000 -1.082 -0.477 -0.410
TSD O12 O OC -0.500 -1.147 -1.623 -0.906
TSD C2 C CT 0.000 -2.353 0.370 -0.318
TSD D21 N NH2 0.000 -2.080 1.412 -0.416
TSD H212 H H 0.000 -1.140 1.549 -0.456
TSD H211 H H 0.000 -2.832 1.993 -0.443
TSD D22 N NH2 0.000 -3.011 0.093 -1.128
TSD H222 H H 0.000 -2.621 -0.534 -1.727
TSD H221 H H 0.000 -3.855 0.528 -1.089
TSD C3 C CT 0.000 -3.113 0.174 1.034
TSD D31 N NH2 0.000 -2.456 0.495 1.830
TSD H312 H H 0.000 -1.587 0.733 1.524
TSD H311 H H 0.000 -2.870 0.480 2.685
TSD D32 N NH2 0.000 -3.300 -0.883 1.153
TSD H322 H H 0.000 -3.034 -1.396 0.397
TSD H321 H H 0.000 -3.694 -1.099 1.990
TSD SI4 SI SI 0.000 -4.691 1.057 1.201
TSD C6 C CH3 0.000 -4.384 2.829 1.087
TSD H63 H H 0.000 -3.736 3.125 1.870
TSD H62 H H 0.000 -3.935 3.049 0.155
TSD H61 H H 0.000 -5.301 3.351 1.170
TSD C5 C CH3 0.000 -5.409 0.653 2.802
TSD H53 H H 0.000 -5.346 -0.392 2.962
TSD H52 H H 0.000 -4.878 1.161 3.563
TSD H51 H H 0.000 -6.424 0.952 2.817
TSD C4 C CH3 0.000 -5.794 0.532 -0.124
TSD H43 H H 0.000 -6.161 1.384 -0.633
TSD H42 H H 0.000 -5.262 -0.084 -0.800
TSD H41 H H 0.000 -6.604 -0.011 0.288
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
TSD O13 n/a C1 START
TSD C1 O13 C2 .
TSD O12 C1 . .
TSD C2 C1 C3 .
TSD D21 C2 H211 .
TSD H212 D21 . .
TSD H211 D21 . .
TSD D22 C2 H221 .
TSD H222 D22 . .
TSD H221 D22 . .
TSD C3 C2 SI4 .
TSD D31 C3 H311 .
TSD H312 D31 . .
TSD H311 D31 . .
TSD D32 C3 H321 .
TSD H322 D32 . .
TSD H321 D32 . .
TSD SI4 C3 C4 .
TSD C6 SI4 H61 .
TSD H63 C6 . .
TSD H62 C6 . .
TSD H61 C6 . .
TSD C5 SI4 H51 .
TSD H53 C5 . .
TSD H52 C5 . .
TSD H51 C5 . .
TSD C4 SI4 H41 .
TSD H43 C4 . .
TSD H42 C4 . .
TSD H41 C4 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
TSD O12 C1 deloc 1.250 0.020
TSD C1 O13 deloc 1.250 0.020
TSD C2 C1 single 1.507 0.020
TSD C3 C2 single 1.524 0.020
TSD D21 C2 single 1.462 0.020
TSD D22 C2 single 1.462 0.020
TSD SI4 C3 single 1.812 0.020
TSD D31 C3 single 1.462 0.020
TSD D32 C3 single 1.462 0.020
TSD C4 SI4 single 1.812 0.020
TSD C5 SI4 single 1.812 0.020
TSD C6 SI4 single 1.812 0.020
TSD H41 C4 single 1.059 0.020
TSD H42 C4 single 1.059 0.020
TSD H43 C4 single 1.059 0.020
TSD H51 C5 single 1.059 0.020
TSD H52 C5 single 1.059 0.020
TSD H53 C5 single 1.059 0.020
TSD H61 C6 single 1.059 0.020
TSD H62 C6 single 1.059 0.020
TSD H63 C6 single 1.059 0.020
TSD H311 D31 single 1.010 0.020
TSD H312 D31 single 1.010 0.020
TSD H321 D32 single 1.010 0.020
TSD H322 D32 single 1.010 0.020
TSD H211 D21 single 1.010 0.020
TSD H212 D21 single 1.010 0.020
TSD H221 D22 single 1.010 0.020
TSD H222 D22 single 1.010 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
TSD O13 C1 O12 123.000 3.000
TSD O13 C1 C2 118.500 3.000
TSD O12 C1 C2 118.500 3.000
TSD C1 C2 D21 109.500 3.000
TSD C1 C2 D22 109.500 3.000
TSD C1 C2 C3 111.000 3.000
TSD D21 C2 D22 109.500 3.000
TSD D21 C2 C3 109.500 3.000
TSD D22 C2 C3 109.500 3.000
TSD C2 D21 H212 120.000 3.000
TSD C2 D21 H211 120.000 3.000
TSD H212 D21 H211 120.000 3.000
TSD C2 D22 H222 120.000 3.000
TSD C2 D22 H221 120.000 3.000
TSD H222 D22 H221 120.000 3.000
TSD C2 C3 D31 109.500 3.000
TSD C2 C3 D32 109.500 3.000
TSD C2 C3 SI4 109.500 3.000
TSD D31 C3 D32 109.500 3.000
TSD D31 C3 SI4 109.500 3.000
TSD D32 C3 SI4 109.500 3.000
TSD C3 D31 H312 120.000 3.000
TSD C3 D31 H311 120.000 3.000
TSD H312 D31 H311 120.000 3.000
TSD C3 D32 H322 120.000 3.000
TSD C3 D32 H321 120.000 3.000
TSD H322 D32 H321 120.000 3.000
TSD C3 SI4 C6 109.500 3.000
TSD C3 SI4 C5 109.500 3.000
TSD C3 SI4 C4 109.500 3.000
TSD C6 SI4 C5 109.500 3.000
TSD C6 SI4 C4 109.500 3.000
TSD C5 SI4 C4 109.500 3.000
TSD SI4 C6 H63 109.500 3.000
TSD SI4 C6 H62 109.500 3.000
TSD SI4 C6 H61 109.500 3.000
TSD H63 C6 H62 109.470 3.000
TSD H63 C6 H61 109.470 3.000
TSD H62 C6 H61 109.470 3.000
TSD SI4 C5 H53 109.500 3.000
TSD SI4 C5 H52 109.500 3.000
TSD SI4 C5 H51 109.500 3.000
TSD H53 C5 H52 109.470 3.000
TSD H53 C5 H51 109.470 3.000
TSD H52 C5 H51 109.470 3.000
TSD SI4 C4 H43 109.500 3.000
TSD SI4 C4 H42 109.500 3.000
TSD SI4 C4 H41 109.500 3.000
TSD H43 C4 H42 109.470 3.000
TSD H43 C4 H41 109.470 3.000
TSD H42 C4 H41 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
TSD var_1 O13 C1 C2 C3 -89.760 20.000 1
TSD var_2 C1 C2 D21 H211 175.000 20.000 1
TSD var_3 C1 C2 D22 H221 175.000 20.000 1
TSD var_4 C1 C2 C3 SI4 -176.306 20.000 1
TSD var_5 C2 C3 D31 H311 175.000 20.000 1
TSD var_6 C2 C3 D32 H321 175.000 20.000 1
TSD var_7 C2 C3 SI4 C4 58.497 20.000 1
TSD var_8 C3 SI4 C6 H61 179.226 20.000 1
TSD var_9 C3 SI4 C5 H51 -165.744 20.000 1
TSD var_10 C3 SI4 C4 H41 112.673 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
TSD chir_01 C2 C1 C3 D21 negativ
TSD chir_02 C3 C2 SI4 D31 positiv
TSD chir_03 SI4 C3 C6 C5 both
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
TSD plan-1 C1 0.020
TSD plan-1 O12 0.020
TSD plan-1 O13 0.020
TSD plan-1 C2 0.020
TSD plan-2 D31 0.020
TSD plan-2 C3 0.020
TSD plan-2 H311 0.020
TSD plan-2 H312 0.020
TSD plan-3 D32 0.020
TSD plan-3 C3 0.020
TSD plan-3 H321 0.020
TSD plan-3 H322 0.020
TSD plan-4 D21 0.020
TSD plan-4 C2 0.020
TSD plan-4 H211 0.020
TSD plan-4 H212 0.020
TSD plan-5 D22 0.020
TSD plan-5 C2 0.020
TSD plan-5 H221 0.020
TSD plan-5 H222 0.020
# ------------------------------------------------------
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