File: TTX.cif

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global_
_lib_name         ?
_lib_version      ?
_lib_update       ?
# ------------------------------------------------
#
# ---   LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
TTX      TTX 'TENTOXIN                            ' non-polymer        60  30 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_TTX
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 TTX           O4     O    O         0.000      0.000    0.000    0.000
 TTX           C14    C    C         0.000     -0.193    0.156    1.175
 TTX           C15    C    C         0.000      0.063    1.348    1.708
 TTX           C16    C    C1        0.000      0.568    2.332    0.925
 TTX           H161   H    H         0.000      0.705    2.043   -0.104
 TTX           C17    C    CR6       0.000      0.972    3.741    1.218
 TTX           C18    C    CR16      0.000      0.994    4.438    2.396
 TTX           H181   H    H         0.000      0.628    3.954    3.293
 TTX           C19    C    CR16      0.000      1.453    5.709    2.486
 TTX           H191   H    H         0.000      1.452    6.207    3.448
 TTX           C20    C    CR16      0.000      1.914    6.367    1.399
 TTX           H201   H    H         0.000      2.280    7.384    1.474
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 TTX           C13    C    CH2       0.000     -1.193   -2.151    1.480
 TTX           H131   H    H         0.000     -0.397   -2.898    1.523
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 TTX           O3     O    O         0.000     -2.152   -3.427    3.256
 TTX           N3     N    N         0.000     -3.407   -1.886    2.405
 TTX           C11    C    CH3       0.000     -4.376   -2.313    3.370
 TTX           H113   H    H         0.000     -3.997   -3.147    3.898
 TTX           H112   H    H         0.000     -4.568   -1.521    4.044
 TTX           H111   H    H         0.000     -5.269   -2.581    2.871
 TTX           C9     C    CH1       0.000     -3.692   -0.853    1.478
 TTX           H91    H    H         0.000     -3.018   -0.959    0.616
 TTX           C10    C    CH3       0.000     -5.107   -0.987    0.999
 TTX           H103   H    H         0.000     -5.217   -1.910    0.495
 TTX           H102   H    H         0.000     -5.760   -0.954    1.830
 TTX           H101   H    H         0.000     -5.328   -0.192    0.339
 TTX           C8     C    C         0.000     -3.486    0.502    2.080
 TTX           O2     O    O         0.000     -3.767    1.478    1.416
 TTX           N2     N    NH1       0.000     -2.983    0.665    3.314
 TTX           HN21   H    H         0.000     -3.193   -0.040    4.007
 TTX           C5     C    CH1       0.000     -2.131    1.825    3.729
 TTX           H51    H    H         0.000     -1.900    2.402    2.823
 TTX           C4     C    CH2       0.000     -2.899    2.745    4.671
 TTX           H41    H    H         0.000     -3.225    2.075    5.469
 TTX           H42    H    H         0.000     -3.763    3.050    4.077
 TTX           C2     C    CH1       0.000     -2.253    3.948    5.264
 TTX           H21    H    H         0.000     -1.187    3.748    5.443
 TTX           C3     C    CH3       0.000     -2.946    4.270    6.579
 TTX           H33    H    H         0.000     -2.440    5.068    7.057
 TTX           H32    H    H         0.000     -3.949    4.551    6.389
 TTX           H31    H    H         0.000     -2.930    3.416    7.204
 TTX           C1     C    CH3       0.000     -2.401    5.130    4.364
 TTX           H13    H    H         0.000     -2.013    5.985    4.849
 TTX           H12    H    H         0.000     -1.866    4.953    3.470
 TTX           H11    H    H         0.000     -3.425    5.274    4.147
 TTX           C6     C    C         0.000     -0.753    1.074    4.193
 TTX           O1     O    O         0.000     -0.324    1.319    5.534
 TTX           N1     N    NT        0.000     -0.041    1.554    3.027
 TTX           C7     C    CH3       0.000      0.271    2.793    3.562
 TTX           H73    H    H         0.000      0.040    2.780    4.588
 TTX           H72    H    H         0.000      1.299    2.968    3.417
 TTX           H71    H    H         0.000     -0.301    3.524    3.065
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
 TTX      O4     n/a    C14    START
 TTX      C14    O4     N4     .
 TTX      C15    C14    C16    .
 TTX      C16    C15    C17    .
 TTX      H161   C16    .      .
 TTX      C17    C16    C18    .
 TTX      C18    C17    C19    .
 TTX      H181   C18    .      .
 TTX      C19    C18    C20    .
 TTX      H191   C19    .      .
 TTX      C20    C19    C21    .
 TTX      H201   C20    .      .
 TTX      C21    C20    C22    .
 TTX      H211   C21    .      .
 TTX      C22    C21    H221   .
 TTX      H221   C22    .      .
 TTX      N4     C14    C13    .
 TTX      HN41   N4     .      .
 TTX      C13    N4     C12    .
 TTX      H131   C13    .      .
 TTX      H132   C13    .      .
 TTX      C12    C13    N3     .
 TTX      O3     C12    .      .
 TTX      N3     C12    C9     .
 TTX      C11    N3     H111   .
 TTX      H113   C11    .      .
 TTX      H112   C11    .      .
 TTX      H111   C11    .      .
 TTX      C9     N3     C8     .
 TTX      H91    C9     .      .
 TTX      C10    C9     H101   .
 TTX      H103   C10    .      .
 TTX      H102   C10    .      .
 TTX      H101   C10    .      .
 TTX      C8     C9     N2     .
 TTX      O2     C8     .      .
 TTX      N2     C8     C5     .
 TTX      HN21   N2     .      .
 TTX      C5     N2     C6     .
 TTX      H51    C5     .      .
 TTX      C4     C5     C2     .
 TTX      H41    C4     .      .
 TTX      H42    C4     .      .
 TTX      C2     C4     C1     .
 TTX      H21    C2     .      .
 TTX      C3     C2     H31    .
 TTX      H33    C3     .      .
 TTX      H32    C3     .      .
 TTX      H31    C3     .      .
 TTX      C1     C2     H11    .
 TTX      H13    C1     .      .
 TTX      H12    C1     .      .
 TTX      H11    C1     .      .
 TTX      C6     C5     N1     .
 TTX      O1     C6     .      .
 TTX      N1     C6     C7     .
 TTX      C7     N1     H71    .
 TTX      H73    C7     .      .
 TTX      H72    C7     .      .
 TTX      H71    C7     .      END
 TTX      N1     C15    .    ADD
 TTX      C17    C22    .    ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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 TTX      H72    C7        single      1.059    0.020
 TTX      H73    C7        single      1.059    0.020
 TTX      N1     C15       single      1.416    0.020
 TTX      N1     C6        single      1.416    0.020
 TTX      C16    C15       double      1.340    0.020
 TTX      C15    C14       single      1.460    0.020
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 TTX      H161   C16       single      1.077    0.020
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loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
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_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
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 TTX      C6     N1     C7      109.470    3.000
 TTX      C6     N1     C15     109.470    3.000
 TTX      C7     N1     C15     109.470    3.000
 TTX      N1     C7     H73     109.470    3.000
 TTX      N1     C7     H72     109.470    3.000
 TTX      N1     C7     H71     109.470    3.000
 TTX      H73    C7     H72     109.470    3.000
 TTX      H73    C7     H71     109.470    3.000
 TTX      H72    C7     H71     109.470    3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 TTX      var_1    O4     C14    C15    C16       -2.047   20.000   1
 TTX      CONST_1  C14    C15    C16    C17     -178.984    0.000   0
 TTX      var_2    C15    C16    C17    C18        2.839   20.000   1
 TTX      CONST_2  C16    C17    C22    C21      180.000    0.000   0
 TTX      CONST_3  C16    C17    C18    C19      180.000    0.000   0
 TTX      CONST_4  C17    C18    C19    C20        0.000    0.000   0
 TTX      CONST_5  C18    C19    C20    C21        0.000    0.000   0
 TTX      CONST_6  C19    C20    C21    C22        0.000    0.000   0
 TTX      CONST_7  C20    C21    C22    C17        0.000    0.000   0
 TTX      CONST_8  O4     C14    N4     C13        0.000    0.000   0
 TTX      var_3    C14    N4     C13    C12     -147.612   20.000   3
 TTX      var_4    N4     C13    C12    N3        69.301   20.000   3
 TTX      CONST_9  C13    C12    N3     C9         0.000    0.000   0
 TTX      var_5    C12    N3     C11    H111    -123.505   20.000   1
 TTX      var_6    C12    N3     C9     C8       -99.251   20.000   3
 TTX      var_7    N3     C9     C10    H101     177.668   20.000   3
 TTX      var_8    N3     C9     C8     N2         5.215   20.000   3
 TTX      CONST_10 C9     C8     N2     C5       180.000    0.000   0
 TTX      var_9    C8     N2     C5     C6      -120.146   20.000   3
 TTX      var_10   N2     C5     C4     C2       177.837   20.000   3
 TTX      var_11   C5     C4     C2     C1        87.967   20.000   3
 TTX      var_12   C4     C2     C3     H31       54.745   20.000   3
 TTX      var_13   C4     C2     C1     H11       54.771   20.000   3
 TTX      var_14   N2     C5     C6     N1       108.242   20.000   3
 TTX      var_15   C5     C6     N1     C7        83.425   20.000   1
 TTX      var_16   C6     N1     C15    C14      -27.929   20.000   1
 TTX      var_17   C6     N1     C7     H71     -109.368   20.000   1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 TTX      chir_01  N1     C7     C15    C6        positiv
 TTX      chir_02  C5     C6     C4     N2        positiv
 TTX      chir_03  C2     C4     C1     C3        negativ
 TTX      chir_04  C9     C8     C10    N3        positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 TTX      plan-1    C15       0.020
 TTX      plan-1    N1        0.020
 TTX      plan-1    C16       0.020
 TTX      plan-1    C14       0.020
 TTX      plan-1    C17       0.020
 TTX      plan-1    H161      0.020
 TTX      plan-2    C17       0.020
 TTX      plan-2    C16       0.020
 TTX      plan-2    C22       0.020
 TTX      plan-2    C18       0.020
 TTX      plan-2    C21       0.020
 TTX      plan-2    C20       0.020
 TTX      plan-2    C19       0.020
 TTX      plan-2    H221      0.020
 TTX      plan-2    H211      0.020
 TTX      plan-2    H201      0.020
 TTX      plan-2    H191      0.020
 TTX      plan-2    H181      0.020
 TTX      plan-2    H161      0.020
 TTX      plan-3    C6        0.020
 TTX      plan-3    N1        0.020
 TTX      plan-3    O1        0.020
 TTX      plan-3    C5        0.020
 TTX      plan-4    N2        0.020
 TTX      plan-4    C5        0.020
 TTX      plan-4    C8        0.020
 TTX      plan-4    HN21      0.020
 TTX      plan-5    C8        0.020
 TTX      plan-5    N2        0.020
 TTX      plan-5    O2        0.020
 TTX      plan-5    C9        0.020
 TTX      plan-5    HN21      0.020
 TTX      plan-6    N3        0.020
 TTX      plan-6    C9        0.020
 TTX      plan-6    C11       0.020
 TTX      plan-6    C12       0.020
 TTX      plan-7    C12       0.020
 TTX      plan-7    N3        0.020
 TTX      plan-7    O3        0.020
 TTX      plan-7    C13       0.020
 TTX      plan-8    N4        0.020
 TTX      plan-8    C13       0.020
 TTX      plan-8    C14       0.020
 TTX      plan-8    HN41      0.020
 TTX      plan-9    C14       0.020
 TTX      plan-9    C15       0.020
 TTX      plan-9    N4        0.020
 TTX      plan-9    O4        0.020
 TTX      plan-9    HN41      0.020
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