1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
TUO TUO '2-(hydrazinocarbonyl)-3-phenyl-1H-in' non-polymer 37 23 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_TUO
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
TUO OAH O O 0.000 0.000 0.000 0.000
TUO CAP C C 0.000 -0.567 1.076 0.016
TUO NAQ N NH1 0.000 0.152 2.216 0.036
TUO H13 H H 0.000 -0.319 3.110 0.048
TUO NAR N NH2 0.000 1.516 2.163 0.039
TUO H14 H H 0.000 2.025 2.620 0.774
TUO HNAR H H 0.000 1.992 1.668 -0.694
TUO CAO C CR5 0.000 -2.033 1.134 0.014
TUO CAN C CR5 0.000 -2.879 0.040 -0.006
TUO CAF C CR6 0.000 -2.483 -1.386 -0.028
TUO CAG C CR16 0.000 -2.780 -2.212 1.058
TUO HAG H H 0.000 -3.304 -1.812 1.917
TUO CAC C CR16 0.000 -2.403 -3.539 1.033
TUO HAC H H 0.000 -2.632 -4.180 1.875
TUO CAB C CR16 0.000 -1.733 -4.051 -0.063
TUO HAB H H 0.000 -1.439 -5.094 -0.077
TUO CAA C CR16 0.000 -1.437 -3.237 -1.143
TUO HAA H H 0.000 -0.912 -3.644 -1.998
TUO CAE C CR16 0.000 -1.808 -1.909 -1.131
TUO HAE H H 0.000 -1.576 -1.273 -1.977
TUO NAW N NR15 0.000 -2.789 2.287 0.027
TUO HNAW H H 0.000 -2.403 3.253 0.036
TUO CAV C CR56 0.000 -4.128 1.974 0.025
TUO CAM C CR56 0.000 -4.247 0.572 0.006
TUO CAU C CR16 0.000 -5.283 2.754 0.041
TUO HAU H H 0.000 -5.208 3.834 0.057
TUO CAT C CR16 0.000 -6.520 2.147 0.035
TUO HAT H H 0.000 -7.415 2.756 0.047
TUO CAK C CR6 0.000 -6.629 0.763 0.016
TUO CAL C CR16 0.000 -5.512 -0.022 0.001
TUO HAL H H 0.000 -5.605 -1.101 -0.013
TUO SAJ S ST 0.000 -8.223 0.013 0.009
TUO OAS O OS 0.000 -9.121 0.980 -0.518
TUO OAD O OS 0.000 -8.057 -1.281 -0.555
TUO NAI N NH2 0.000 -8.663 -0.219 1.589
TUO HNAA H H 0.000 -9.559 -0.643 1.826
TUO HNAI H H 0.000 -8.045 0.060 2.350
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
TUO OAH n/a CAP START
TUO CAP OAH CAO .
TUO NAQ CAP NAR .
TUO H13 NAQ . .
TUO NAR NAQ HNAR .
TUO H14 NAR . .
TUO HNAR NAR . .
TUO CAO CAP NAW .
TUO CAN CAO CAF .
TUO CAF CAN CAE .
TUO CAG CAF CAC .
TUO HAG CAG . .
TUO CAC CAG CAB .
TUO HAC CAC . .
TUO CAB CAC CAA .
TUO HAB CAB . .
TUO CAA CAB HAA .
TUO HAA CAA . .
TUO CAE CAF HAE .
TUO HAE CAE . .
TUO NAW CAO CAV .
TUO HNAW NAW . .
TUO CAV NAW CAU .
TUO CAM CAV . .
TUO CAU CAV CAT .
TUO HAU CAU . .
TUO CAT CAU CAK .
TUO HAT CAT . .
TUO CAK CAT SAJ .
TUO CAL CAK HAL .
TUO HAL CAL . .
TUO SAJ CAK NAI .
TUO OAS SAJ . .
TUO OAD SAJ . .
TUO NAI SAJ HNAI .
TUO HNAA NAI . .
TUO HNAI NAI . END
TUO CAE CAA . ADD
TUO CAN CAM . ADD
TUO CAM CAL . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
TUO CAE CAF single 1.390 0.020
TUO HAE CAE single 1.083 0.020
TUO CAE CAA double 1.390 0.020
TUO CAA CAB single 1.390 0.020
TUO HAA CAA single 1.083 0.020
TUO CAB CAC double 1.390 0.020
TUO HAB CAB single 1.083 0.020
TUO CAC CAG single 1.390 0.020
TUO HAC CAC single 1.083 0.020
TUO HAG CAG single 1.083 0.020
TUO CAG CAF double 1.390 0.020
TUO CAF CAN single 1.490 0.020
TUO CAN CAM single 1.490 0.020
TUO CAM CAV double 1.490 0.020
TUO CAM CAL single 1.390 0.020
TUO CAL CAK double 1.390 0.020
TUO HAL CAL single 1.083 0.020
TUO CAK CAT single 1.390 0.020
TUO SAJ CAK single 1.595 0.020
TUO OAS SAJ double 1.436 0.020
TUO OAD SAJ double 1.436 0.020
TUO NAI SAJ single 1.600 0.020
TUO HNAI NAI single 1.010 0.020
TUO HNAA NAI single 1.010 0.020
TUO HAT CAT single 1.083 0.020
TUO CAT CAU double 1.390 0.020
TUO HAU CAU single 1.083 0.020
TUO CAU CAV single 1.390 0.020
TUO CAV NAW single 1.340 0.020
TUO HNAW NAW single 1.040 0.020
TUO CAN CAO double 1.490 0.020
TUO NAW CAO single 1.340 0.020
TUO CAO CAP single 1.490 0.020
TUO CAP OAH double 1.220 0.020
TUO NAQ CAP single 1.330 0.020
TUO NAR NAQ single 1.400 0.020
TUO HNAR NAR single 1.010 0.020
TUO H13 NAQ single 1.010 0.020
TUO H14 NAR single 1.010 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
TUO OAH CAP NAQ 123.000 3.000
TUO OAH CAP CAO 120.500 3.000
TUO NAQ CAP CAO 120.000 3.000
TUO CAP NAQ H13 120.000 3.000
TUO CAP NAQ NAR 120.000 3.000
TUO H13 NAQ NAR 120.000 3.000
TUO NAQ NAR H14 120.000 3.000
TUO NAQ NAR HNAR 120.000 3.000
TUO H14 NAR HNAR 120.000 3.000
TUO CAP CAO CAN 117.000 3.000
TUO CAP CAO NAW 126.000 3.000
TUO CAN CAO NAW 108.000 3.000
TUO CAO CAN CAF 126.000 3.000
TUO CAO CAN CAM 108.000 3.000
TUO CAF CAN CAM 126.000 3.000
TUO CAN CAF CAG 120.000 3.000
TUO CAN CAF CAE 120.000 3.000
TUO CAG CAF CAE 120.000 3.000
TUO CAF CAG HAG 120.000 3.000
TUO CAF CAG CAC 120.000 3.000
TUO HAG CAG CAC 120.000 3.000
TUO CAG CAC HAC 120.000 3.000
TUO CAG CAC CAB 120.000 3.000
TUO HAC CAC CAB 120.000 3.000
TUO CAC CAB HAB 120.000 3.000
TUO CAC CAB CAA 120.000 3.000
TUO HAB CAB CAA 120.000 3.000
TUO CAB CAA HAA 120.000 3.000
TUO CAB CAA CAE 120.000 3.000
TUO HAA CAA CAE 120.000 3.000
TUO CAF CAE HAE 120.000 3.000
TUO CAF CAE CAA 120.000 3.000
TUO HAE CAE CAA 120.000 3.000
TUO CAO NAW HNAW 126.000 3.000
TUO CAO NAW CAV 108.000 3.000
TUO HNAW NAW CAV 126.000 3.000
TUO NAW CAV CAM 108.000 3.000
TUO NAW CAV CAU 132.000 3.000
TUO CAM CAV CAU 120.000 3.000
TUO CAV CAM CAN 108.000 3.000
TUO CAV CAM CAL 120.000 3.000
TUO CAN CAM CAL 126.000 3.000
TUO CAV CAU HAU 120.000 3.000
TUO CAV CAU CAT 120.000 3.000
TUO HAU CAU CAT 120.000 3.000
TUO CAU CAT HAT 120.000 3.000
TUO CAU CAT CAK 120.000 3.000
TUO HAT CAT CAK 120.000 3.000
TUO CAT CAK CAL 120.000 3.000
TUO CAT CAK SAJ 120.000 3.000
TUO CAL CAK SAJ 120.000 3.000
TUO CAK CAL HAL 120.000 3.000
TUO CAK CAL CAM 120.000 3.000
TUO HAL CAL CAM 120.000 3.000
TUO CAK SAJ OAS 109.500 3.000
TUO CAK SAJ OAD 109.500 3.000
TUO CAK SAJ NAI 109.500 3.000
TUO OAS SAJ OAD 109.500 3.000
TUO OAS SAJ NAI 109.500 3.000
TUO OAD SAJ NAI 109.500 3.000
TUO SAJ NAI HNAA 120.000 3.000
TUO SAJ NAI HNAI 120.000 3.000
TUO HNAA NAI HNAI 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
TUO CONST_1 OAH CAP NAQ NAR 0.000 0.000 0
TUO CONST_2 CAP NAQ NAR HNAR 56.123 0.000 0
TUO var_1 OAH CAP CAO NAW -179.809 20.000 1
TUO CONST_3 CAP CAO CAN CAF 0.000 0.000 0
TUO CONST_4 CAO CAN CAM CAV 0.000 0.000 0
TUO var_2 CAO CAN CAF CAE -65.325 20.000 1
TUO CONST_5 CAN CAF CAG CAC 180.000 0.000 0
TUO CONST_6 CAF CAG CAC CAB 0.000 0.000 0
TUO CONST_7 CAG CAC CAB CAA 0.000 0.000 0
TUO CONST_8 CAC CAB CAA CAE 0.000 0.000 0
TUO CONST_9 CAN CAF CAE CAA 180.000 0.000 0
TUO CONST_10 CAF CAE CAA CAB 0.000 0.000 0
TUO CONST_11 CAP CAO NAW CAV 180.000 0.000 0
TUO CONST_12 CAO NAW CAV CAU 180.000 0.000 0
TUO CONST_13 NAW CAV CAM CAN 0.000 0.000 0
TUO CONST_14 CAV CAM CAL CAK 0.000 0.000 0
TUO CONST_15 NAW CAV CAU CAT 180.000 0.000 0
TUO CONST_16 CAV CAU CAT CAK 0.000 0.000 0
TUO CONST_17 CAU CAT CAK SAJ 180.000 0.000 0
TUO CONST_18 CAT CAK CAL CAM 0.000 0.000 0
TUO var_3 CAT CAK SAJ NAI -89.972 20.000 1
TUO var_4 CAK SAJ NAI HNAI -0.047 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
TUO chir_01 SAJ CAK OAS OAD negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
TUO plan-1 CAE 0.020
TUO plan-1 CAA 0.020
TUO plan-1 CAF 0.020
TUO plan-1 HAE 0.020
TUO plan-1 CAB 0.020
TUO plan-1 CAC 0.020
TUO plan-1 CAG 0.020
TUO plan-1 HAA 0.020
TUO plan-1 HAB 0.020
TUO plan-1 HAC 0.020
TUO plan-1 HAG 0.020
TUO plan-1 CAN 0.020
TUO plan-2 CAN 0.020
TUO plan-2 CAF 0.020
TUO plan-2 CAM 0.020
TUO plan-2 CAO 0.020
TUO plan-2 NAW 0.020
TUO plan-2 CAL 0.020
TUO plan-2 CAV 0.020
TUO plan-2 CAK 0.020
TUO plan-2 CAT 0.020
TUO plan-2 CAU 0.020
TUO plan-2 HAL 0.020
TUO plan-2 SAJ 0.020
TUO plan-2 HAT 0.020
TUO plan-2 HAU 0.020
TUO plan-2 HNAW 0.020
TUO plan-2 CAP 0.020
TUO plan-3 NAI 0.020
TUO plan-3 SAJ 0.020
TUO plan-3 HNAI 0.020
TUO plan-3 HNAA 0.020
TUO plan-4 CAP 0.020
TUO plan-4 CAO 0.020
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TUO plan-4 NAQ 0.020
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TUO plan-5 NAQ 0.020
TUO plan-5 CAP 0.020
TUO plan-5 NAR 0.020
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TUO plan-5 HNAR 0.020
TUO plan-6 NAR 0.020
TUO plan-6 NAQ 0.020
TUO plan-6 HNAR 0.020
TUO plan-6 H14 0.020
TUO plan-6 H13 0.020
# ------------------------------------------------------
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