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233
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
TYC TYC 'L-TYROSINAMIDE ' non-polymer 25 13 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_TYC
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
TYC O O O 0.000 0.000 0.000 0.000
TYC C C C 0.000 -0.997 0.287 0.626
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TYC HT22 H H 0.000 -1.779 0.613 2.496
TYC HT21 H H 0.000 -0.080 0.200 2.461
TYC CA C CH1 0.000 -2.293 0.546 -0.099
TYC HA H H 0.000 -2.893 1.268 0.471
TYC N N NH2 0.000 -2.007 1.092 -1.432
TYC H H H 0.000 -2.355 2.007 -1.695
TYC H0 H H 0.000 -1.461 0.558 -2.098
TYC CB C CH2 0.000 -3.070 -0.763 -0.241
TYC HB1 H H 0.000 -3.281 -1.169 0.751
TYC HB2 H H 0.000 -2.472 -1.481 -0.807
TYC CG C CR6 0.000 -4.364 -0.504 -0.965
TYC CD2 C CR16 0.000 -5.503 -0.182 -0.250
TYC HD2 H H 0.000 -5.464 -0.120 0.831
TYC CE2 C CR16 0.000 -6.690 0.061 -0.912
TYC HE2 H H 0.000 -7.580 0.321 -0.352
TYC CZ C CR6 0.000 -6.742 -0.028 -2.296
TYC OH O OH1 0.000 -7.911 0.207 -2.949
TYC HH H H 0.000 -8.401 -0.622 -3.039
TYC CE1 C CR16 0.000 -5.600 -0.356 -3.010
TYC HE1 H H 0.000 -5.639 -0.426 -4.090
TYC CD1 C CR16 0.000 -4.413 -0.594 -2.344
TYC HD1 H H 0.000 -3.521 -0.852 -2.901
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
TYC O n/a C START
TYC C O CA .
TYC NXT C HT21 .
TYC HT22 NXT . .
TYC HT21 NXT . .
TYC CA C CB .
TYC HA CA . .
TYC N CA H0 .
TYC H N . .
TYC H0 N . .
TYC CB CA CG .
TYC HB1 CB . .
TYC HB2 CB . .
TYC CG CB CD2 .
TYC CD2 CG CE2 .
TYC HD2 CD2 . .
TYC CE2 CD2 CZ .
TYC HE2 CE2 . .
TYC CZ CE2 CE1 .
TYC OH CZ HH .
TYC HH OH . .
TYC CE1 CZ CD1 .
TYC HE1 CE1 . .
TYC CD1 CE1 HD1 .
TYC HD1 CD1 . END
TYC CG CD1 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
TYC N CA single 1.450 0.020
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TYC H N single 1.010 0.020
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TYC C O double 1.220 0.020
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TYC HB2 CB single 1.092 0.020
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TYC CD2 CG single 1.390 0.020
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TYC HD2 CD2 single 1.083 0.020
TYC CE1 CZ double 1.390 0.020
TYC HE1 CE1 single 1.083 0.020
TYC CZ CE2 single 1.390 0.020
TYC HE2 CE2 single 1.083 0.020
TYC OH CZ single 1.362 0.020
TYC HH OH single 0.967 0.020
TYC HT21 NXT single 1.010 0.020
TYC HT22 NXT single 1.010 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
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_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
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TYC HT22 NXT HT21 120.000 3.000
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TYC HA CA CB 108.340 3.000
TYC N CA CB 109.470 3.000
TYC CA N H 120.000 3.000
TYC CA N H0 120.000 3.000
TYC H N H0 120.000 3.000
TYC CA CB HB1 109.470 3.000
TYC CA CB HB2 109.470 3.000
TYC CA CB CG 109.470 3.000
TYC HB1 CB HB2 107.900 3.000
TYC HB1 CB CG 109.470 3.000
TYC HB2 CB CG 109.470 3.000
TYC CB CG CD2 120.000 3.000
TYC CB CG CD1 120.000 3.000
TYC CD2 CG CD1 120.000 3.000
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TYC CG CD2 CE2 120.000 3.000
TYC HD2 CD2 CE2 120.000 3.000
TYC CD2 CE2 HE2 120.000 3.000
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TYC HE2 CE2 CZ 120.000 3.000
TYC CE2 CZ OH 120.000 3.000
TYC CE2 CZ CE1 120.000 3.000
TYC OH CZ CE1 120.000 3.000
TYC CZ OH HH 109.470 3.000
TYC CZ CE1 HE1 120.000 3.000
TYC CZ CE1 CD1 120.000 3.000
TYC HE1 CE1 CD1 120.000 3.000
TYC CE1 CD1 HD1 120.000 3.000
TYC CE1 CD1 CG 120.000 3.000
TYC HD1 CD1 CG 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
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_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
TYC CONST_1 O C NXT HT21 0.000 0.000 0
TYC var_1 O C CA CB 90.047 20.000 3
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TYC var_3 C CA CB CG -179.999 20.000 3
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TYC CONST_3 CB CG CD2 CE2 180.000 0.000 0
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TYC CONST_5 CD2 CE2 CZ CE1 0.000 0.000 0
TYC var_5 CE2 CZ OH HH -90.053 20.000 1
TYC CONST_6 CE2 CZ CE1 CD1 0.000 0.000 0
TYC CONST_7 CZ CE1 CD1 CG 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
TYC chir_01 CA N C CB positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
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TYC plan-1 H 0.020
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# ------------------------------------------------------
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