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|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
TYP TYP 'CYCLO-(L-TYROSINE-L-PROLINE) INHIBIT' non-polymer 35 19 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_TYP
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
TYP OP O O 0.000 0.000 0.000 0.000
TYP CP C C 0.000 -1.105 -0.226 -0.448
TYP N N NH1 0.000 -2.199 0.020 0.298
TYP H H H 0.000 -2.088 0.416 1.220
TYP CAP C CH1 0.000 -1.257 -0.785 -1.839
TYP HAP H H 0.000 -1.278 -1.884 -1.830
TYP CBP C CH2 0.000 -0.123 -0.248 -2.744
TYP HBP1 H H 0.000 0.767 -0.881 -2.741
TYP HBP2 H H 0.000 0.162 0.780 -2.514
TYP CGP C CH2 0.000 -0.793 -0.300 -4.145
TYP HGP1 H H 0.000 -0.745 -1.294 -4.595
TYP HGP2 H H 0.000 -0.373 0.433 -4.837
TYP CDP C CH2 0.000 -2.263 0.058 -3.841
TYP HDP1 H H 0.000 -2.937 -0.547 -4.451
TYP HDP2 H H 0.000 -2.446 1.116 -4.038
TYP NP N N 0.000 -2.501 -0.227 -2.412
TYP C C C 0.000 -3.613 -0.008 -1.681
TYP O O O 0.000 -4.631 0.404 -2.197
TYP CA C CH1 0.000 -3.544 -0.274 -0.194
TYP HA H H 0.000 -3.782 -1.329 -0.001
TYP CB C CH2 0.000 -4.556 0.616 0.528
TYP HBC1 H H 0.000 -5.561 0.396 0.161
TYP HBC2 H H 0.000 -4.321 1.665 0.336
TYP CG C CR6 0.000 -4.492 0.348 2.009
TYP CD2 C CR16 0.000 -5.295 -0.626 2.571
TYP HD2 H H 0.000 -5.973 -1.195 1.946
TYP CE2 C CR16 0.000 -5.234 -0.876 3.928
TYP HE2 H H 0.000 -5.858 -1.645 4.367
TYP CZ C CR6 0.000 -4.373 -0.141 4.729
TYP OH O OH1 0.000 -4.315 -0.382 6.066
TYP HH H H 0.000 -4.955 0.181 6.522
TYP CE1 C CR16 0.000 -3.568 0.836 4.164
TYP HE1 H H 0.000 -2.892 1.409 4.787
TYP CD1 C CR16 0.000 -3.629 1.079 2.806
TYP HD1 H H 0.000 -3.001 1.842 2.364
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
TYP OP n/a CP START
TYP CP OP CAP .
TYP N CP H .
TYP H N . .
TYP CAP CP CBP .
TYP HAP CAP . .
TYP CBP CAP CGP .
TYP HBP1 CBP . .
TYP HBP2 CBP . .
TYP CGP CBP CDP .
TYP HGP1 CGP . .
TYP HGP2 CGP . .
TYP CDP CGP NP .
TYP HDP1 CDP . .
TYP HDP2 CDP . .
TYP NP CDP C .
TYP C NP CA .
TYP O C . .
TYP CA C CB .
TYP HA CA . .
TYP CB CA CG .
TYP HBC1 CB . .
TYP HBC2 CB . .
TYP CG CB CD2 .
TYP CD2 CG CE2 .
TYP HD2 CD2 . .
TYP CE2 CD2 CZ .
TYP HE2 CE2 . .
TYP CZ CE2 CE1 .
TYP OH CZ HH .
TYP HH OH . .
TYP CE1 CZ CD1 .
TYP HE1 CE1 . .
TYP CD1 CE1 HD1 .
TYP HD1 CD1 . END
TYP N CA . ADD
TYP CG CD1 . ADD
TYP NP CAP . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
TYP N CA single 1.450 0.020
TYP N CP single 1.330 0.020
TYP H N single 1.010 0.020
TYP CA C single 1.500 0.020
TYP CB CA single 1.524 0.020
TYP HA CA single 1.099 0.020
TYP O C double 1.220 0.020
TYP C NP single 1.330 0.020
TYP CG CB single 1.511 0.020
TYP HBC1 CB single 1.092 0.020
TYP HBC2 CB single 1.092 0.020
TYP CG CD1 double 1.390 0.020
TYP CD2 CG single 1.390 0.020
TYP CD1 CE1 single 1.390 0.020
TYP HD1 CD1 single 1.083 0.020
TYP CE1 CZ double 1.390 0.020
TYP HE1 CE1 single 1.083 0.020
TYP CE2 CD2 double 1.390 0.020
TYP CZ CE2 single 1.390 0.020
TYP HE2 CE2 single 1.083 0.020
TYP HD2 CD2 single 1.083 0.020
TYP OH CZ single 1.362 0.020
TYP HH OH single 0.967 0.020
TYP NP CAP single 1.455 0.020
TYP NP CDP single 1.455 0.020
TYP CAP CP single 1.500 0.020
TYP CBP CAP single 1.524 0.020
TYP HAP CAP single 1.099 0.020
TYP CP OP double 1.220 0.020
TYP CGP CBP single 1.524 0.020
TYP HBP1 CBP single 1.092 0.020
TYP HBP2 CBP single 1.092 0.020
TYP CDP CGP single 1.524 0.020
TYP HGP1 CGP single 1.092 0.020
TYP HGP2 CGP single 1.092 0.020
TYP HDP1 CDP single 1.092 0.020
TYP HDP2 CDP single 1.092 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
TYP OP CP N 123.000 3.000
TYP OP CP CAP 120.500 3.000
TYP N CP CAP 116.500 3.000
TYP CP N H 120.000 3.000
TYP CP N CA 121.500 3.000
TYP H N CA 118.500 3.000
TYP CP CAP HAP 108.810 3.000
TYP CP CAP CBP 109.470 3.000
TYP CP CAP NP 111.600 3.000
TYP HAP CAP CBP 108.340 3.000
TYP HAP CAP NP 109.470 3.000
TYP CBP CAP NP 105.000 3.000
TYP CAP CBP HBP1 109.470 3.000
TYP CAP CBP HBP2 109.470 3.000
TYP CAP CBP CGP 111.000 3.000
TYP HBP1 CBP HBP2 107.900 3.000
TYP HBP1 CBP CGP 109.470 3.000
TYP HBP2 CBP CGP 109.470 3.000
TYP CBP CGP HGP1 109.470 3.000
TYP CBP CGP HGP2 109.470 3.000
TYP CBP CGP CDP 111.000 3.000
TYP HGP1 CGP HGP2 107.900 3.000
TYP HGP1 CGP CDP 109.470 3.000
TYP HGP2 CGP CDP 109.470 3.000
TYP CGP CDP HDP1 109.470 3.000
TYP CGP CDP HDP2 109.470 3.000
TYP CGP CDP NP 105.000 3.000
TYP HDP1 CDP HDP2 107.900 3.000
TYP HDP1 CDP NP 109.470 3.000
TYP HDP2 CDP NP 109.470 3.000
TYP CDP NP C 127.000 3.000
TYP CDP NP CAP 112.000 3.000
TYP C NP CAP 121.000 3.000
TYP NP C O 123.000 3.000
TYP NP C CA 116.500 3.000
TYP O C CA 120.500 3.000
TYP C CA HA 108.810 3.000
TYP C CA CB 109.470 3.000
TYP C CA N 111.600 3.000
TYP HA CA CB 108.340 3.000
TYP HA CA N 108.550 3.000
TYP CB CA N 110.000 3.000
TYP CA CB HBC1 109.470 3.000
TYP CA CB HBC2 109.470 3.000
TYP CA CB CG 109.470 3.000
TYP HBC1 CB HBC2 107.900 3.000
TYP HBC1 CB CG 109.470 3.000
TYP HBC2 CB CG 109.470 3.000
TYP CB CG CD2 120.000 3.000
TYP CB CG CD1 120.000 3.000
TYP CD2 CG CD1 120.000 3.000
TYP CG CD2 HD2 120.000 3.000
TYP CG CD2 CE2 120.000 3.000
TYP HD2 CD2 CE2 120.000 3.000
TYP CD2 CE2 HE2 120.000 3.000
TYP CD2 CE2 CZ 120.000 3.000
TYP HE2 CE2 CZ 120.000 3.000
TYP CE2 CZ OH 120.000 3.000
TYP CE2 CZ CE1 120.000 3.000
TYP OH CZ CE1 120.000 3.000
TYP CZ OH HH 109.470 3.000
TYP CZ CE1 HE1 120.000 3.000
TYP CZ CE1 CD1 120.000 3.000
TYP HE1 CE1 CD1 120.000 3.000
TYP CE1 CD1 HD1 120.000 3.000
TYP CE1 CD1 CG 120.000 3.000
TYP HD1 CD1 CG 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
TYP CONST_1 OP CP N CA 180.000 0.000 0
TYP var_1 CP N CA C -30.000 20.000 3
TYP var_2 OP CP CAP CBP -30.000 20.000 3
TYP var_3 CP CAP CBP CGP -150.000 20.000 3
TYP var_4 CAP CBP CGP CDP 30.000 20.000 3
TYP var_5 CBP CGP CDP NP -30.000 20.000 3
TYP var_6 CGP CDP NP C 180.000 20.000 1
TYP var_7 CDP NP CAP CP 150.000 20.000 3
TYP CONST_2 CDP NP C CA 180.000 0.000 0
TYP var_8 NP C CA CB 150.000 20.000 3
TYP var_9 C CA CB CG 179.803 20.000 3
TYP var_10 CA CB CG CD2 -90.021 20.000 2
TYP CONST_3 CB CG CD1 CE1 180.000 0.000 0
TYP CONST_4 CB CG CD2 CE2 180.000 0.000 0
TYP CONST_5 CG CD2 CE2 CZ 0.000 0.000 0
TYP CONST_6 CD2 CE2 CZ CE1 0.000 0.000 0
TYP var_11 CE2 CZ OH HH -90.194 20.000 1
TYP CONST_7 CE2 CZ CE1 CD1 0.000 0.000 0
TYP CONST_8 CZ CE1 CD1 CG 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
TYP chir_01 CA N C CB positiv
TYP chir_02 CAP NP CP CBP positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
TYP plan-1 N 0.020
TYP plan-1 CA 0.020
TYP plan-1 CP 0.020
TYP plan-1 H 0.020
TYP plan-2 C 0.020
TYP plan-2 CA 0.020
TYP plan-2 O 0.020
TYP plan-2 NP 0.020
TYP plan-3 CG 0.020
TYP plan-3 CB 0.020
TYP plan-3 CD1 0.020
TYP plan-3 CD2 0.020
TYP plan-3 CE1 0.020
TYP plan-3 CE2 0.020
TYP plan-3 CZ 0.020
TYP plan-3 HD1 0.020
TYP plan-3 HE1 0.020
TYP plan-3 HE2 0.020
TYP plan-3 HD2 0.020
TYP plan-3 OH 0.020
TYP plan-4 NP 0.020
TYP plan-4 C 0.020
TYP plan-4 CAP 0.020
TYP plan-4 CDP 0.020
TYP plan-5 CP 0.020
TYP plan-5 N 0.020
TYP plan-5 CAP 0.020
TYP plan-5 OP 0.020
TYP plan-5 H 0.020
# ------------------------------------------------------
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