1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
UI1 UI1 '6-[(Z)-AMINO(IMINO)METHYL]-N-[4-(AMI' non-polymer 52 31 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_UI1
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
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UI1 H4 H H 0.000 0.000 0.000 0.000
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UI1 N15 N NRD6 0.000 0.000 0.000 0.000
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
UI1 O9 n/a C8 START
UI1 C8 O9 C10 .
UI1 N7 C8 C6 .
UI1 HN7 N7 . .
UI1 C6 N7 C30 .
UI1 C5 C6 C4 .
UI1 H5 C5 . .
UI1 C4 C5 H4 .
UI1 H4 C4 . .
UI1 C30 C6 C31 .
UI1 H30 C30 . .
UI1 C31 C30 C3 .
UI1 H31 C31 . .
UI1 C3 C31 C2 .
UI1 C2 C3 N1 .
UI1 H21A C2 . .
UI1 H22 C2 . .
UI1 N1 C2 HN11 .
UI1 HN12 N1 . .
UI1 HN11 N1 . .
UI1 C10 C8 C26 .
UI1 C26 C10 C25 .
UI1 H26 C26 . .
UI1 C25 C26 C20 .
UI1 C24 C25 C23 .
UI1 H24 C24 . .
UI1 C23 C24 C22 .
UI1 H23 C23 . .
UI1 C22 C23 C21 .
UI1 C27 C22 N28 .
UI1 N29 C27 H291 .
UI1 H292 N29 . .
UI1 H291 N29 . .
UI1 N28 C27 H28 .
UI1 H28 N28 . .
UI1 C21 C22 H21 .
UI1 H21 C21 . .
UI1 C20 C25 C12 .
UI1 C12 C20 N13 .
UI1 C11 C12 H11 .
UI1 H11 C11 . .
UI1 N13 C12 C14 .
UI1 H13 N13 . .
UI1 C14 N13 N19 .
UI1 N19 C14 C18 .
UI1 C18 N19 C17 .
UI1 H18 C18 . .
UI1 C17 C18 C16 .
UI1 H17 C17 . .
UI1 C16 C17 N15 .
UI1 H16 C16 . .
UI1 N15 C16 . END
UI1 C3 C4 . ADD
UI1 C10 C11 . ADD
UI1 C14 N15 . ADD
UI1 C20 C21 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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UI1 H22 C2 single 1.092 0.020
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UI1 C3 C31 double 1.390 0.020
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UI1 H5 C5 single 1.083 0.020
UI1 C6 N7 single 1.350 0.020
UI1 C30 C6 double 1.390 0.020
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UI1 HN7 N7 single 1.010 0.020
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UI1 H17 C17 single 1.083 0.020
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UI1 H18 C18 single 1.083 0.020
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UI1 H21 C21 single 1.083 0.020
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UI1 H23 C23 single 1.083 0.020
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UI1 H24 C24 single 1.083 0.020
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UI1 H30 C30 single 1.083 0.020
UI1 H31 C31 single 1.083 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
UI1 O9 C8 N7 123.000 3.000
UI1 O9 C8 C10 120.500 3.000
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UI1 HN7 N7 C6 120.000 3.000
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UI1 N7 C6 C30 120.000 3.000
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UI1 C6 C30 C31 120.000 3.000
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UI1 HN12 N1 HN11 120.000 3.000
UI1 C8 C10 C26 120.000 3.000
UI1 C8 C10 C11 120.000 3.000
UI1 C26 C10 C11 120.000 3.000
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UI1 H26 C26 C25 120.000 3.000
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UI1 C24 C25 C20 120.000 3.000
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UI1 C16 N15 C14 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
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