1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
UNU UNU 'BENZAMIDE ' non-polymer 16 9 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_UNU
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
UNU O08 O O 0.000 0.000 0.000 0.000
UNU C07 C C 0.000 -0.899 0.819 -0.001
UNU N09 N NH2 0.000 -0.612 2.136 -0.008
UNU H092 H H 0.000 -1.358 2.821 -0.009
UNU H091 H H 0.000 0.351 2.449 -0.012
UNU C06 C CR6 0.000 -2.307 0.368 -0.001
UNU C05 C CR16 0.000 -3.343 1.304 0.004
UNU H05 H H 0.000 -3.117 2.363 0.008
UNU C04 C CR16 0.000 -4.655 0.878 0.003
UNU H04 H H 0.000 -5.459 1.603 0.006
UNU C03 C CR16 0.000 -4.945 -0.474 -0.002
UNU H03 H H 0.000 -5.977 -0.804 -0.005
UNU C02 C CR16 0.000 -3.924 -1.408 -0.001
UNU H02 H H 0.000 -4.159 -2.466 -0.001
UNU C01 C CR16 0.000 -2.608 -0.995 0.000
UNU H01 H H 0.000 -1.809 -1.727 0.001
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
UNU O08 n/a C07 START
UNU C07 O08 C06 .
UNU N09 C07 H091 .
UNU H092 N09 . .
UNU H091 N09 . .
UNU C06 C07 C05 .
UNU C05 C06 C04 .
UNU H05 C05 . .
UNU C04 C05 C03 .
UNU H04 C04 . .
UNU C03 C04 C02 .
UNU H03 C03 . .
UNU C02 C03 C01 .
UNU H02 C02 . .
UNU C01 C02 H01 .
UNU H01 C01 . END
UNU C06 C01 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
UNU C07 O08 double 1.220 0.020
UNU N09 C07 single 1.332 0.020
UNU C06 C07 single 1.500 0.020
UNU H091 N09 single 1.010 0.020
UNU H092 N09 single 1.010 0.020
UNU C06 C01 double 1.390 0.020
UNU C05 C06 single 1.390 0.020
UNU C01 C02 single 1.390 0.020
UNU H01 C01 single 1.083 0.020
UNU C04 C05 double 1.390 0.020
UNU H05 C05 single 1.083 0.020
UNU C03 C04 single 1.390 0.020
UNU H04 C04 single 1.083 0.020
UNU C02 C03 double 1.390 0.020
UNU H03 C03 single 1.083 0.020
UNU H02 C02 single 1.083 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
UNU O08 C07 N09 123.000 3.000
UNU O08 C07 C06 120.500 3.000
UNU N09 C07 C06 120.000 3.000
UNU C07 N09 H092 120.000 3.000
UNU C07 N09 H091 120.000 3.000
UNU H092 N09 H091 120.000 3.000
UNU C07 C06 C05 120.000 3.000
UNU C07 C06 C01 120.000 3.000
UNU C05 C06 C01 120.000 3.000
UNU C06 C05 H05 120.000 3.000
UNU C06 C05 C04 120.000 3.000
UNU H05 C05 C04 120.000 3.000
UNU C05 C04 H04 120.000 3.000
UNU C05 C04 C03 120.000 3.000
UNU H04 C04 C03 120.000 3.000
UNU C04 C03 H03 120.000 3.000
UNU C04 C03 C02 120.000 3.000
UNU H03 C03 C02 120.000 3.000
UNU C03 C02 H02 120.000 3.000
UNU C03 C02 C01 120.000 3.000
UNU H02 C02 C01 120.000 3.000
UNU C02 C01 H01 120.000 3.000
UNU C02 C01 C06 120.000 3.000
UNU H01 C01 C06 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
UNU CONST_1 O08 C07 N09 H091 0.000 0.000 0
UNU var_1 O08 C07 C06 C05 179.701 20.000 1
UNU CONST_2 C07 C06 C01 C02 180.000 0.000 0
UNU CONST_3 C07 C06 C05 C04 180.000 0.000 0
UNU CONST_4 C06 C05 C04 C03 0.000 0.000 0
UNU CONST_5 C05 C04 C03 C02 0.000 0.000 0
UNU CONST_6 C04 C03 C02 C01 0.000 0.000 0
UNU CONST_7 C03 C02 C01 C06 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
UNU plan-1 C07 0.020
UNU plan-1 O08 0.020
UNU plan-1 N09 0.020
UNU plan-1 C06 0.020
UNU plan-1 H092 0.020
UNU plan-1 H091 0.020
UNU plan-2 N09 0.020
UNU plan-2 C07 0.020
UNU plan-2 H091 0.020
UNU plan-2 H092 0.020
UNU plan-3 C06 0.020
UNU plan-3 C07 0.020
UNU plan-3 C01 0.020
UNU plan-3 C05 0.020
UNU plan-3 C04 0.020
UNU plan-3 C03 0.020
UNU plan-3 C02 0.020
UNU plan-3 H01 0.020
UNU plan-3 H05 0.020
UNU plan-3 H04 0.020
UNU plan-3 H03 0.020
UNU plan-3 H02 0.020
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