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275
|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
UQ1 UQ1 'UBIQUINONE-1 ' non-polymer 36 18 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_UQ1
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
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_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
UQ1 O4 n/a C4 START
UQ1 C4 O4 C5 .
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UQ1 H71 C7 . .
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UQ1 H8 C8 . .
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UQ1 C11 C9 H111 .
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UQ1 C10 C9 H101 .
UQ1 H103 C10 . .
UQ1 H102 C10 . .
UQ1 H101 C10 . END
UQ1 C1 C2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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UQ1 H113 C11 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
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_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
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UQ1 C9 C11 H111 109.470 3.000
UQ1 H113 C11 H112 109.470 3.000
UQ1 H113 C11 H111 109.470 3.000
UQ1 H112 C11 H111 109.470 3.000
UQ1 C9 C10 H103 109.470 3.000
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UQ1 H103 C10 H101 109.470 3.000
UQ1 H102 C10 H101 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
UQ1 CONST_1 O4 C4 C3 C2 180.000 0.000 0
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UQ1 CONST_5 C5 C6 C1 O1 180.000 0.000 0
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UQ1 var_6 C5 C6 C7 C8 90.034 20.000 2
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UQ1 CONST_7 C7 C8 C9 C10 -172.553 0.000 0
UQ1 var_8 C8 C9 C11 H111 5.414 20.000 1
UQ1 var_9 C8 C9 C10 H101 179.912 20.000 1
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
UQ1 plan-1 C1 0.020
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UQ1 plan-2 C11 0.020
# ------------------------------------------------------
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