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|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
V2H V2H '(1S,3R,5Z,7E,22E)-9,10-secoergosta-5' non-polymer 74 30 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_V2H
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
V2H OAG O OH1 0.000 0.000 0.000 0.000
V2H HOAG H H 0.000 0.084 -0.833 0.483
V2H CAZ C CH1 0.000 -1.384 0.319 -0.161
V2H HAZ H H 0.000 -1.852 0.420 0.828
V2H CAO C CH2 0.000 -1.517 1.637 -0.923
V2H HAOA H H 0.000 -1.147 1.502 -1.942
V2H HAO H H 0.000 -0.925 2.405 -0.421
V2H CAS C CH2 0.000 -2.077 -0.804 -0.939
V2H HAS H H 0.000 -2.024 -1.738 -0.375
V2H HASA H H 0.000 -1.595 -0.939 -1.910
V2H CAU C C 0.000 -3.528 -0.418 -1.144
V2H CAT C C 0.000 -3.791 0.959 -1.613
V2H CAA C C2 0.000 -4.692 1.212 -2.563
V2H HAAA H H 0.000 -5.252 0.405 -3.011
V2H HAA H H 0.000 -4.866 2.226 -2.890
V2H CAN C CH1 0.000 -2.987 2.067 -0.964
V2H HAN H H 0.000 -3.087 2.990 -1.552
V2H O30 O OH1 0.000 -3.461 2.289 0.366
V2H HO30 H H 0.000 -4.393 2.544 0.337
V2H CAH C C1 0.000 -4.532 -1.288 -0.907
V2H HAH H H 0.000 -4.310 -2.285 -0.566
V2H CAI C C1 0.000 -5.922 -0.877 -1.115
V2H HAI H H 0.000 -6.142 0.120 -1.457
V2H CAV C C 0.000 -6.914 -1.737 -0.883
V2H CBA C CH1 0.000 -8.356 -1.372 -1.072
V2H HBA H H 0.000 -8.821 -1.999 -1.846
V2H CAP C CH2 0.000 -8.664 0.109 -1.312
V2H HAP H H 0.000 -8.567 0.394 -2.362
V2H HAPA H H 0.000 -8.050 0.771 -0.698
V2H CAQ C CH2 0.000 -10.136 0.226 -0.881
V2H HAQ H H 0.000 -10.805 0.116 -1.737
V2H HAQA H H 0.000 -10.326 1.184 -0.392
V2H CBB C CH1 0.000 -10.387 -0.928 0.125
V2H HBB H H 0.000 -11.114 -1.642 -0.287
V2H CBC C CT 0.000 -9.033 -1.598 0.304
V2H CAF C CH3 0.000 -8.240 -0.853 1.380
V2H HAFB H H 0.000 -8.251 0.186 1.174
V2H HAFA H H 0.000 -8.678 -1.028 2.329
V2H HAF H H 0.000 -7.238 -1.199 1.386
V2H CAR C CH2 0.000 -8.998 -3.080 0.594
V2H HAR H H 0.000 -9.401 -3.642 -0.250
V2H HARA H H 0.000 -9.579 -3.305 1.491
V2H CAL C CH2 0.000 -7.529 -3.473 0.821
V2H HAL H H 0.000 -7.490 -4.545 1.029
V2H HALA H H 0.000 -7.156 -2.922 1.686
V2H CAM C CH2 0.000 -6.663 -3.158 -0.398
V2H HAMA H H 0.000 -6.906 -3.864 -1.195
V2H HAM H H 0.000 -5.613 -3.270 -0.122
V2H CAY C CH1 0.000 -10.885 -0.371 1.460
V2H HAY H H 0.000 -10.167 0.369 1.839
V2H CAE C CH3 0.000 -11.022 -1.513 2.469
V2H HAEB H H 0.000 -10.080 -1.977 2.610
V2H HAEA H H 0.000 -11.367 -1.129 3.394
V2H HAE H H 0.000 -11.715 -2.227 2.105
V2H CAK C C1 0.000 -12.226 0.287 1.260
V2H HAK H H 0.000 -13.059 -0.289 0.891
V2H CAJ C C1 0.000 -12.380 1.558 1.535
V2H HAJ H H 0.000 -11.547 2.133 1.904
V2H CAX C CH1 0.000 -13.721 2.216 1.337
V2H HAX H H 0.000 -14.439 1.476 0.957
V2H CAD C CH3 0.000 -13.583 3.358 0.327
V2H HADB H H 0.000 -12.891 4.072 0.692
V2H HADA H H 0.000 -13.238 2.973 -0.598
V2H HAD H H 0.000 -14.525 3.821 0.186
V2H CAW C CH1 0.000 -14.219 2.772 2.672
V2H HAW H H 0.000 -13.501 3.513 3.051
V2H CAC C CH3 0.000 -14.355 1.632 3.681
V2H HACB H H 0.000 -14.700 2.016 4.606
V2H HACA H H 0.000 -15.048 0.917 3.317
V2H HAC H H 0.000 -13.413 1.168 3.821
V2H CAB C CH3 0.000 -15.580 3.441 2.469
V2H HABB H H 0.000 -15.927 3.827 3.393
V2H HABA H H 0.000 -15.486 4.232 1.770
V2H HAB H H 0.000 -16.274 2.729 2.103
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
V2H OAG n/a CAZ START
V2H HOAG OAG . .
V2H CAZ OAG CAS .
V2H HAZ CAZ . .
V2H CAO CAZ HAO .
V2H HAOA CAO . .
V2H HAO CAO . .
V2H CAS CAZ CAU .
V2H HAS CAS . .
V2H HASA CAS . .
V2H CAU CAS CAH .
V2H CAT CAU CAN .
V2H CAA CAT HAA .
V2H HAAA CAA . .
V2H HAA CAA . .
V2H CAN CAT O30 .
V2H HAN CAN . .
V2H O30 CAN HO30 .
V2H HO30 O30 . .
V2H CAH CAU CAI .
V2H HAH CAH . .
V2H CAI CAH CAV .
V2H HAI CAI . .
V2H CAV CAI CBA .
V2H CBA CAV CAP .
V2H HBA CBA . .
V2H CAP CBA CAQ .
V2H HAP CAP . .
V2H HAPA CAP . .
V2H CAQ CAP CBB .
V2H HAQ CAQ . .
V2H HAQA CAQ . .
V2H CBB CAQ CAY .
V2H HBB CBB . .
V2H CBC CBB CAR .
V2H CAF CBC HAF .
V2H HAFB CAF . .
V2H HAFA CAF . .
V2H HAF CAF . .
V2H CAR CBC CAL .
V2H HAR CAR . .
V2H HARA CAR . .
V2H CAL CAR CAM .
V2H HAL CAL . .
V2H HALA CAL . .
V2H CAM CAL HAM .
V2H HAMA CAM . .
V2H HAM CAM . .
V2H CAY CBB CAK .
V2H HAY CAY . .
V2H CAE CAY HAE .
V2H HAEB CAE . .
V2H HAEA CAE . .
V2H HAE CAE . .
V2H CAK CAY CAJ .
V2H HAK CAK . .
V2H CAJ CAK CAX .
V2H HAJ CAJ . .
V2H CAX CAJ CAW .
V2H HAX CAX . .
V2H CAD CAX HAD .
V2H HADB CAD . .
V2H HADA CAD . .
V2H HAD CAD . .
V2H CAW CAX CAB .
V2H HAW CAW . .
V2H CAC CAW HAC .
V2H HACB CAC . .
V2H HACA CAC . .
V2H HAC CAC . .
V2H CAB CAW HAB .
V2H HABB CAB . .
V2H HABA CAB . .
V2H HAB CAB . END
V2H CAN CAO . ADD
V2H CAV CAM . ADD
V2H CBC CBA . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
V2H O30 CAN single 1.432 0.020
V2H HO30 O30 single 0.967 0.020
V2H CAN CAT single 1.500 0.020
V2H CAN CAO single 1.524 0.020
V2H HAN CAN single 1.099 0.020
V2H CAO CAZ single 1.524 0.020
V2H HAO CAO single 1.092 0.020
V2H HAOA CAO single 1.092 0.020
V2H CAZ OAG single 1.432 0.020
V2H CAS CAZ single 1.524 0.020
V2H HAZ CAZ single 1.099 0.020
V2H HOAG OAG single 0.967 0.020
V2H CAA CAT double 1.320 0.020
V2H CAT CAU single 1.460 0.020
V2H HAA CAA single 1.077 0.020
V2H HAAA CAA single 1.077 0.020
V2H CAH CAU double 1.340 0.020
V2H CAU CAS single 1.510 0.020
V2H HAS CAS single 1.092 0.020
V2H HASA CAS single 1.092 0.020
V2H CAI CAH single 1.460 0.020
V2H HAH CAH single 1.077 0.020
V2H CAV CAI double 1.340 0.020
V2H HAI CAI single 1.077 0.020
V2H CBA CAV single 1.500 0.020
V2H CAV CAM single 1.510 0.020
V2H CAM CAL single 1.524 0.020
V2H HAM CAM single 1.092 0.020
V2H HAMA CAM single 1.092 0.020
V2H CAL CAR single 1.524 0.020
V2H HAL CAL single 1.092 0.020
V2H HALA CAL single 1.092 0.020
V2H CAR CBC single 1.524 0.020
V2H HAR CAR single 1.092 0.020
V2H HARA CAR single 1.092 0.020
V2H CBC CBB single 1.524 0.020
V2H CBC CBA single 1.524 0.020
V2H CAF CBC single 1.524 0.020
V2H CAP CBA single 1.524 0.020
V2H HBA CBA single 1.099 0.020
V2H HAF CAF single 1.059 0.020
V2H HAFA CAF single 1.059 0.020
V2H HAFB CAF single 1.059 0.020
V2H CBB CAQ single 1.524 0.020
V2H CAY CBB single 1.524 0.020
V2H HBB CBB single 1.099 0.020
V2H CAQ CAP single 1.524 0.020
V2H HAQ CAQ single 1.092 0.020
V2H HAQA CAQ single 1.092 0.020
V2H HAP CAP single 1.092 0.020
V2H HAPA CAP single 1.092 0.020
V2H CAK CAY single 1.510 0.020
V2H CAE CAY single 1.524 0.020
V2H HAY CAY single 1.099 0.020
V2H HAE CAE single 1.059 0.020
V2H HAEA CAE single 1.059 0.020
V2H HAEB CAE single 1.059 0.020
V2H CAJ CAK double 1.330 0.020
V2H HAK CAK single 1.077 0.020
V2H CAX CAJ single 1.510 0.020
V2H HAJ CAJ single 1.077 0.020
V2H CAW CAX single 1.524 0.020
V2H CAD CAX single 1.524 0.020
V2H HAX CAX single 1.099 0.020
V2H HAD CAD single 1.059 0.020
V2H HADA CAD single 1.059 0.020
V2H HADB CAD single 1.059 0.020
V2H CAB CAW single 1.524 0.020
V2H CAC CAW single 1.524 0.020
V2H HAW CAW single 1.099 0.020
V2H HAB CAB single 1.059 0.020
V2H HABA CAB single 1.059 0.020
V2H HABB CAB single 1.059 0.020
V2H HAC CAC single 1.059 0.020
V2H HACA CAC single 1.059 0.020
V2H HACB CAC single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
V2H HOAG OAG CAZ 109.470 3.000
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V2H OAG CAZ CAS 109.470 3.000
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V2H HAZ CAZ CAS 108.340 3.000
V2H CAO CAZ CAS 109.470 3.000
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V2H HAO CAO CAN 109.470 3.000
V2H CAZ CAS HAS 109.470 3.000
V2H CAZ CAS HASA 109.470 3.000
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V2H HAS CAS CAU 109.470 3.000
V2H HASA CAS CAU 109.470 3.000
V2H CAS CAU CAT 120.000 3.000
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V2H CAH CAI CAV 120.000 3.000
V2H HAI CAI CAV 120.000 3.000
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V2H CBA CAV CAM 120.000 3.000
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V2H HBA CBA CBC 108.340 3.000
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V2H CBA CAP HAPA 109.470 3.000
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V2H HAQA CAQ CBB 109.470 3.000
V2H CAQ CBB HBB 108.340 3.000
V2H CAQ CBB CBC 111.000 3.000
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V2H HBB CBB CBC 108.340 3.000
V2H HBB CBB CAY 108.340 3.000
V2H CBC CBB CAY 111.000 3.000
V2H CBB CBC CAF 111.000 3.000
V2H CBB CBC CAR 111.000 3.000
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V2H CAF CBC CAR 111.000 3.000
V2H CAF CBC CBA 111.000 3.000
V2H CAR CBC CBA 111.000 3.000
V2H CBC CAF HAFB 109.470 3.000
V2H CBC CAF HAFA 109.470 3.000
V2H CBC CAF HAF 109.470 3.000
V2H HAFB CAF HAFA 109.470 3.000
V2H HAFB CAF HAF 109.470 3.000
V2H HAFA CAF HAF 109.470 3.000
V2H CBC CAR HAR 109.470 3.000
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V2H HAR CAR CAL 109.470 3.000
V2H HARA CAR CAL 109.470 3.000
V2H CAR CAL HAL 109.470 3.000
V2H CAR CAL HALA 109.470 3.000
V2H CAR CAL CAM 111.000 3.000
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V2H HAL CAL CAM 109.470 3.000
V2H HALA CAL CAM 109.470 3.000
V2H CAL CAM HAMA 109.470 3.000
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V2H HAMA CAM HAM 107.900 3.000
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V2H HAM CAM CAV 109.470 3.000
V2H CBB CAY HAY 108.340 3.000
V2H CBB CAY CAE 111.000 3.000
V2H CBB CAY CAK 109.470 3.000
V2H HAY CAY CAE 108.340 3.000
V2H HAY CAY CAK 108.810 3.000
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V2H CAY CAE HAE 109.470 3.000
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V2H HAEB CAE HAE 109.470 3.000
V2H HAEA CAE HAE 109.470 3.000
V2H CAY CAK HAK 120.000 3.000
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V2H HAK CAK CAJ 120.000 3.000
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V2H HAJ CAJ CAX 120.000 3.000
V2H CAJ CAX HAX 108.810 3.000
V2H CAJ CAX CAD 109.470 3.000
V2H CAJ CAX CAW 109.470 3.000
V2H HAX CAX CAD 108.340 3.000
V2H HAX CAX CAW 108.340 3.000
V2H CAD CAX CAW 111.000 3.000
V2H CAX CAD HADB 109.470 3.000
V2H CAX CAD HADA 109.470 3.000
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V2H HADB CAD HAD 109.470 3.000
V2H HADA CAD HAD 109.470 3.000
V2H CAX CAW HAW 108.340 3.000
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V2H HAW CAW CAC 108.340 3.000
V2H HAW CAW CAB 108.340 3.000
V2H CAC CAW CAB 111.000 3.000
V2H CAW CAC HACB 109.470 3.000
V2H CAW CAC HACA 109.470 3.000
V2H CAW CAC HAC 109.470 3.000
V2H HACB CAC HACA 109.470 3.000
V2H HACB CAC HAC 109.470 3.000
V2H HACA CAC HAC 109.470 3.000
V2H CAW CAB HABB 109.470 3.000
V2H CAW CAB HABA 109.470 3.000
V2H CAW CAB HAB 109.470 3.000
V2H HABB CAB HABA 109.470 3.000
V2H HABB CAB HAB 109.470 3.000
V2H HABA CAB HAB 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
V2H var_1 HOAG OAG CAZ CAS -59.669 20.000 1
V2H var_2 OAG CAZ CAO CAN 180.000 20.000 3
V2H var_3 OAG CAZ CAS CAU 180.000 20.000 3
V2H var_4 CAZ CAS CAU CAH -120.000 20.000 3
V2H var_5 CAS CAU CAT CAN -30.000 20.000 1
V2H CONST_1 CAU CAT CAA HAA -179.952 0.000 0
V2H var_6 CAU CAT CAN O30 -60.000 20.000 3
V2H var_7 CAT CAN CAO CAZ -60.000 20.000 3
V2H var_8 CAT CAN O30 HO30 -60.031 20.000 1
V2H CONST_2 CAS CAU CAH CAI 179.944 0.000 0
V2H var_9 CAU CAH CAI CAV 179.984 20.000 1
V2H CONST_3 CAH CAI CAV CBA 179.750 0.000 0
V2H var_10 CAI CAV CAM CAL 120.000 20.000 3
V2H var_11 CAI CAV CBA CAP 0.000 20.000 3
V2H var_12 CAV CBA CAP CAQ -150.000 20.000 3
V2H var_13 CBA CAP CAQ CBB 30.000 20.000 3
V2H var_14 CAP CAQ CBB CAY 120.000 20.000 3
V2H var_15 CAQ CBB CBC CAR -150.000 20.000 1
V2H var_16 CBB CBC CBA CAV 180.000 20.000 1
V2H var_17 CBB CBC CAF HAF -169.732 20.000 1
V2H var_18 CBB CBC CAR CAL 180.000 20.000 1
V2H var_19 CBC CAR CAL CAM -60.000 20.000 3
V2H var_20 CAR CAL CAM CAV 60.000 20.000 3
V2H var_21 CAQ CBB CAY CAK 64.358 20.000 3
V2H var_22 CBB CAY CAE HAE -60.001 20.000 3
V2H var_23 CBB CAY CAK CAJ -120.004 20.000 1
V2H CONST_4 CAY CAK CAJ CAX -179.962 0.000 0
V2H var_24 CAK CAJ CAX CAW 119.986 20.000 1
V2H var_25 CAJ CAX CAD HAD 179.966 20.000 3
V2H var_26 CAJ CAX CAW CAB 179.970 20.000 3
V2H var_27 CAX CAW CAC HAC 59.963 20.000 3
V2H var_28 CAX CAW CAB HAB 60.018 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
V2H chir_01 CAN O30 CAO CAT negativ
V2H chir_02 CAZ CAO OAG CAS positiv
V2H chir_03 CBC CAR CBA CAF positiv
V2H chir_04 CBA CAV CBC CAP negativ
V2H chir_05 CBB CBC CAQ CAY positiv
V2H chir_06 CAY CBB CAE CAK positiv
V2H chir_07 CAX CAJ CAD CAW positiv
V2H chir_08 CAW CAX CAB CAC negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
V2H plan-1 CAT 0.020
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V2H plan-1 CAA 0.020
V2H plan-1 CAU 0.020
V2H plan-1 HAA 0.020
V2H plan-1 HAAA 0.020
V2H plan-2 CAU 0.020
V2H plan-2 CAT 0.020
V2H plan-2 CAS 0.020
V2H plan-2 CAH 0.020
V2H plan-2 CAI 0.020
V2H plan-2 HAH 0.020
V2H plan-2 HAI 0.020
V2H plan-3 CAI 0.020
V2H plan-3 CAH 0.020
V2H plan-3 CAV 0.020
V2H plan-3 HAI 0.020
V2H plan-3 CAM 0.020
V2H plan-3 CBA 0.020
V2H plan-3 HAH 0.020
V2H plan-4 CAK 0.020
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