1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
V35 V35 'D-1-(4-CHLOROPHENYL)-2-(ACETAMIDO)ET' non-polymer 31 17 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_V35
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
V35 CL4 CL CL 0.000 0.000 0.000 0.000
V35 C4 C CR6 0.000 -1.686 0.181 -0.377
V35 C3 C CR16 0.000 -2.392 -0.880 -0.915
V35 H3 H H 0.000 -1.894 -1.823 -1.102
V35 C2 C CR16 0.000 -3.734 -0.735 -1.213
V35 H2 H H 0.000 -4.287 -1.566 -1.635
V35 C5 C CR16 0.000 -2.322 1.386 -0.138
V35 H5 H H 0.000 -1.770 2.217 0.283
V35 C6 C CR16 0.000 -3.664 1.529 -0.437
V35 H6 H H 0.000 -4.163 2.472 -0.251
V35 C1 C CR6 0.000 -4.370 0.469 -0.975
V35 C7 C CH2 0.000 -5.831 0.627 -1.307
V35 H71 H H 0.000 -6.083 -0.017 -2.152
V35 H72 H H 0.000 -6.033 1.667 -1.571
V35 C8 C CH1 0.000 -6.676 0.234 -0.094
V35 H8 H H 0.000 -6.421 0.883 0.756
V35 B B B -1.000 -6.379 -1.288 0.291
V35 O3B O OH1 0.000 -6.540 -2.076 -0.814
V35 HOB3 H H 0.000 -5.992 -1.893 -1.558
V35 O2B O OH1 0.000 -7.246 -1.689 1.267
V35 HOB2 H H 0.000 -7.227 -1.217 2.081
V35 O1B O OH1 0.000 -5.095 -1.401 0.746
V35 HOB1 H H 0.000 -4.803 -2.258 1.005
V35 N N NH1 0.000 -8.096 0.388 -0.416
V35 HN H H 0.000 -8.453 0.050 -1.298
V35 C C C 0.000 -8.927 0.981 0.464
V35 O O O 0.000 -8.484 1.467 1.484
V35 C9 C CH3 0.000 -10.406 1.038 0.184
V35 H93 H H 0.000 -10.933 0.539 0.955
V35 H92 H H 0.000 -10.719 2.049 0.141
V35 H91 H H 0.000 -10.609 0.567 -0.743
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
V35 CL4 n/a C4 START
V35 C4 CL4 C5 .
V35 C3 C4 C2 .
V35 H3 C3 . .
V35 C2 C3 H2 .
V35 H2 C2 . .
V35 C5 C4 C6 .
V35 H5 C5 . .
V35 C6 C5 C1 .
V35 H6 C6 . .
V35 C1 C6 C7 .
V35 C7 C1 C8 .
V35 H71 C7 . .
V35 H72 C7 . .
V35 C8 C7 N .
V35 H8 C8 . .
V35 B C8 O1B .
V35 O3B B HOB3 .
V35 HOB3 O3B . .
V35 O2B B HOB2 .
V35 HOB2 O2B . .
V35 O1B B HOB1 .
V35 HOB1 O1B . .
V35 N C8 C .
V35 HN N . .
V35 C N C9 .
V35 O C . .
V35 C9 C H91 .
V35 H93 C9 . .
V35 H92 C9 . .
V35 H91 C9 . END
V35 C1 C2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
V35 C1 C2 double 1.390 0.020
V35 C1 C6 single 1.390 0.020
V35 C7 C1 single 1.511 0.020
V35 C2 C3 single 1.390 0.020
V35 H2 C2 single 1.083 0.020
V35 C3 C4 double 1.390 0.020
V35 H3 C3 single 1.083 0.020
V35 C5 C4 single 1.390 0.020
V35 C4 CL4 single 1.795 0.020
V35 C6 C5 double 1.390 0.020
V35 H5 C5 single 1.083 0.020
V35 H6 C6 single 1.083 0.020
V35 C8 C7 single 1.524 0.020
V35 H71 C7 single 1.092 0.020
V35 H72 C7 single 1.092 0.020
V35 N C8 single 1.450 0.020
V35 B C8 single 1.600 0.020
V35 H8 C8 single 1.099 0.020
V35 C9 C single 1.500 0.020
V35 H91 C9 single 1.059 0.020
V35 H92 C9 single 1.059 0.020
V35 H93 C9 single 1.059 0.020
V35 C N single 1.330 0.020
V35 O C double 1.220 0.020
V35 HN N single 1.010 0.020
V35 O1B B single 1.535 0.020
V35 HOB1 O1B single 0.967 0.020
V35 O2B B single 1.535 0.020
V35 HOB2 O2B single 0.967 0.020
V35 O3B B single 1.535 0.020
V35 HOB3 O3B single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
V35 CL4 C4 C3 120.000 3.000
V35 CL4 C4 C5 120.000 3.000
V35 C3 C4 C5 120.000 3.000
V35 C4 C3 H3 120.000 3.000
V35 C4 C3 C2 120.000 3.000
V35 H3 C3 C2 120.000 3.000
V35 C3 C2 H2 120.000 3.000
V35 C3 C2 C1 120.000 3.000
V35 H2 C2 C1 120.000 3.000
V35 C4 C5 H5 120.000 3.000
V35 C4 C5 C6 120.000 3.000
V35 H5 C5 C6 120.000 3.000
V35 C5 C6 H6 120.000 3.000
V35 C5 C6 C1 120.000 3.000
V35 H6 C6 C1 120.000 3.000
V35 C6 C1 C7 120.000 3.000
V35 C6 C1 C2 120.000 3.000
V35 C7 C1 C2 120.000 3.000
V35 C1 C7 H71 109.470 3.000
V35 C1 C7 H72 109.470 3.000
V35 C1 C7 C8 109.470 3.000
V35 H71 C7 H72 107.900 3.000
V35 H71 C7 C8 109.470 3.000
V35 H72 C7 C8 109.470 3.000
V35 C7 C8 H8 108.340 3.000
V35 C7 C8 B 109.470 3.000
V35 C7 C8 N 110.000 3.000
V35 H8 C8 B 109.470 3.000
V35 H8 C8 N 108.550 3.000
V35 B C8 N 109.500 3.000
V35 C8 B O3B 120.000 3.000
V35 C8 B O2B 120.000 3.000
V35 C8 B O1B 120.000 3.000
V35 O3B B O2B 120.000 3.000
V35 O3B B O1B 120.000 3.000
V35 O2B B O1B 120.000 3.000
V35 B O3B HOB3 120.000 3.000
V35 B O2B HOB2 120.000 3.000
V35 B O1B HOB1 120.000 3.000
V35 C8 N HN 118.500 3.000
V35 C8 N C 121.500 3.000
V35 HN N C 120.000 3.000
V35 N C O 123.000 3.000
V35 N C C9 116.500 3.000
V35 O C C9 123.000 3.000
V35 C C9 H93 109.470 3.000
V35 C C9 H92 109.470 3.000
V35 C C9 H91 109.470 3.000
V35 H93 C9 H92 109.470 3.000
V35 H93 C9 H91 109.470 3.000
V35 H92 C9 H91 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
V35 CONST_1 CL4 C4 C3 C2 180.000 0.000 0
V35 CONST_2 C4 C3 C2 C1 0.000 0.000 0
V35 CONST_3 CL4 C4 C5 C6 180.000 0.000 0
V35 CONST_4 C4 C5 C6 C1 0.000 0.000 0
V35 CONST_5 C5 C6 C1 C7 180.000 0.000 0
V35 CONST_6 C6 C1 C2 C3 0.000 0.000 0
V35 var_1 C6 C1 C7 C8 -90.257 20.000 2
V35 var_2 C1 C7 C8 N 179.992 20.000 3
V35 var_3 C7 C8 B O1B 67.218 20.000 1
V35 var_4 C8 B O3B HOB3 60.003 20.000 1
V35 var_5 C8 B O2B HOB2 -59.998 20.000 1
V35 var_6 C8 B O1B HOB1 179.974 20.000 1
V35 var_7 C7 C8 N C -135.120 20.000 3
V35 CONST_7 C8 N C C9 180.000 0.000 0
V35 var_8 N C C9 H91 -0.036 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
V35 chir_01 C8 C7 N B negativ
V35 chir_02 B C8 O1B O2B negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
V35 plan-1 C1 0.020
V35 plan-1 C2 0.020
V35 plan-1 C6 0.020
V35 plan-1 C7 0.020
V35 plan-1 C3 0.020
V35 plan-1 C4 0.020
V35 plan-1 C5 0.020
V35 plan-1 H2 0.020
V35 plan-1 H3 0.020
V35 plan-1 CL4 0.020
V35 plan-1 H5 0.020
V35 plan-1 H6 0.020
V35 plan-2 C 0.020
V35 plan-2 C9 0.020
V35 plan-2 N 0.020
V35 plan-2 O 0.020
V35 plan-2 HN 0.020
V35 plan-3 N 0.020
V35 plan-3 C8 0.020
V35 plan-3 C 0.020
V35 plan-3 HN 0.020
# ------------------------------------------------------
|