1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
VO3 VO3 'TETRAMETAVANADATE ' non-polymer 17 17 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_VO3
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
VO3 O00 O O -1.000 0.000 0.000 0.000
VO3 V4 V V 0.000 -0.798 1.486 0.736
VO3 O10 O O 0.000 -1.109 2.538 -0.407
VO3 O11 O O -1.000 0.334 2.240 1.974
VO3 O8 O O2 0.000 -2.369 0.994 1.560
VO3 V3 V V 0.000 -3.440 0.252 0.261
VO3 O5 O O 0.000 -3.712 1.322 -0.874
VO3 O7 O O -1.000 -2.598 -1.214 -0.466
VO3 O6 O O2 0.000 -5.039 -0.269 1.010
VO3 V2 V V 0.000 -6.048 -0.997 -0.345
VO3 O2 O O 0.000 -6.283 0.092 -1.472
VO3 O4 O O -1.000 -5.163 -2.441 -1.063
VO3 O3 O O2 0.000 -7.672 -1.544 0.326
VO3 V1 V V 0.000 -8.617 -2.256 -1.083
VO3 O0 O O 0.000 -7.818 -3.481 -1.690
VO3 O1 O O -1.000 -8.846 -0.971 -2.380
VO3 O30 O O -1.000 -10.262 -2.830 -0.491
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
VO3 O00 n/a V4 START
VO3 V4 O00 O8 .
VO3 O10 V4 . .
VO3 O11 V4 . .
VO3 O8 V4 V3 .
VO3 V3 O8 O6 .
VO3 O5 V3 . .
VO3 O7 V3 . .
VO3 O6 V3 V2 .
VO3 V2 O6 O3 .
VO3 O2 V2 . .
VO3 O4 V2 . .
VO3 O3 V2 V1 .
VO3 V1 O3 O30 .
VO3 O0 V1 . .
VO3 O1 V1 . .
VO3 O30 V1 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
VO3 O0 V1 double 1.910 0.020
VO3 O1 V1 single 1.910 0.020
VO3 O30 V1 single 1.910 0.020
VO3 V1 O3 single 2.004 0.020
VO3 O2 V2 double 1.910 0.020
VO3 O3 V2 single 2.004 0.020
VO3 O4 V2 single 1.910 0.020
VO3 V2 O6 single 2.004 0.020
VO3 O5 V3 double 1.910 0.020
VO3 O6 V3 single 2.004 0.020
VO3 O7 V3 single 1.910 0.020
VO3 V3 O8 single 2.004 0.020
VO3 O8 V4 single 2.004 0.020
VO3 O10 V4 double 1.910 0.020
VO3 O11 V4 single 1.910 0.020
VO3 V4 O00 single 1.910 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
VO3 O00 V4 O10 109.433 3.000
VO3 O00 V4 O11 109.454 3.000
VO3 O00 V4 O8 109.482 3.000
VO3 O10 V4 O11 109.486 3.000
VO3 O10 V4 O8 109.465 3.000
VO3 O11 V4 O8 109.507 3.000
VO3 V4 O8 V3 120.000 3.000
VO3 O8 V3 O5 109.463 3.000
VO3 O8 V3 O7 109.495 3.000
VO3 O8 V3 O6 109.441 3.000
VO3 O5 V3 O7 109.497 3.000
VO3 O5 V3 O6 109.474 3.000
VO3 O7 V3 O6 109.457 3.000
VO3 V3 O6 V2 120.000 3.000
VO3 O6 V2 O2 109.466 3.000
VO3 O6 V2 O4 109.502 3.000
VO3 O6 V2 O3 109.463 3.000
VO3 O2 V2 O4 109.483 3.000
VO3 O2 V2 O3 109.442 3.000
VO3 O4 V2 O3 109.471 3.000
VO3 V2 O3 V1 120.000 3.000
VO3 O3 V1 O0 109.498 3.000
VO3 O3 V1 O1 109.486 3.000
VO3 O3 V1 O30 109.447 3.000
VO3 O0 V1 O1 109.486 3.000
VO3 O0 V1 O30 109.448 3.000
VO3 O1 V1 O30 109.462 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
VO3 var_1 O00 V4 O8 V3 -59.965 20.000 1
VO3 var_2 V4 O8 V3 O6 179.999 20.000 1
VO3 var_3 O8 V3 O6 V2 179.990 20.000 1
VO3 var_4 V3 O6 V2 O3 -179.989 20.000 1
VO3 var_5 O6 V2 O3 V1 179.997 20.000 1
VO3 var_6 V2 O3 V1 O30 179.997 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
VO3 chir_01 V1 O3 O0 O1 both
VO3 chir_02 V2 O6 O2 O4 both
VO3 chir_03 V3 O8 O5 O7 both
VO3 chir_04 V4 O00 O10 O11 both
# ------------------------------------------------------
|
