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43
|
seq1 = sample41-1c.fst, 284 bp
seq2 = sample40-2.fst (genome4), 770 bp
>mrna4c
>genome4
(complement)
1-72 (351-424) 89% ->
73-142 (563-630) 95% ==
213-284 (700-770) 95%
0 . : . : . : . : . :
1 TTTTAGCCGGCACGAGATTG AGCGTATGATCACGCGCGCGGCCTCCT C
||||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||-|
351 TTTTAGCCGGCACGAGATTGCAGCG ATGATCACGCGCGCGGCCTCCTAC
50 . : . : . : . : . :
49 AGAGTGATGCATGATACAACTT AT ATATGTACTTAGCTG
-|||| ||||||||||||||||- |->>>...>>>|||||||||||||-|
400 GAGTCATGCATGATACAACTTCTTGGTT...GATATATGTACTTAGC G
100 . : . : . : . : . :
88 GCAACCGAGATTTACTTTCGAAGCACTGTGATGAACCCGCGGCCCTTTGA
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||-||||||||
577 GCAACCGAGATTTACTTTCGAAGGACTGTGATGAACCCGCG CCCTTTGA
150 .
138 GCGCT
|||||
626 GCGCT
0 . : . : . : . : . :
213 TATATATGTACTTAGCGG ACACCGAGATTTACTTTCGAAGGACTGTGGA
||||||||||||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||||-|
700 TATATATGTACTTAGCGGCA ACCGAGATTTACTTTCGAAGGACTGTG A
50 . : . :
262 TGAACCCGCGCCCTTTGAGCGCT
|||||||||||||||||||||||
748 TGAACCCGCGCCCTTTGAGCGCT
|
