Folder: rapmap

package info (click to toggle)

salmon 0.7.2%2Bds1-2

			.. (parent)
-	rw-r--r--	6,884	BooMap.hpp
-	rw-r--r--	33,664	BooPHF.hpp
-	rw-r--r--	31,090	HitManager.cpp
-	rw-r--r--	4,062	HitManager.hpp
-	rw-r--r--	3,145	IndexHeader.hpp
-	rw-r--r--	743	JFRaw.hpp
-	rw-r--r--	728	PairAlignmentFormatter.hpp
-	rw-r--r--	338	RapMapConfig.hpp
-	rw-r--r--	1,030	RapMapFileSystem.cpp
-	rw-r--r--	529	RapMapFileSystem.hpp
-	rw-r--r--	1,646	RapMapIndex.hpp
-	rw-r--r--	6,237	RapMapSAIndex.cpp
-	rw-r--r--	1,506	RapMapSAIndex.hpp
-	rw-r--r--	26,091	RapMapSAIndexer.cpp
-	rw-r--r--	25,994	RapMapUtils.cpp
-	rw-r--r--	31,320	RapMapUtils.hpp
-	rw-r--r--	26,112	SACollector.hpp
-	rw-r--r--	23,073	SASearcher.hpp
-	rw-r--r--	567	ScopedTimer.hpp
-	rw-r--r--	529	SingleAlignmentFormatter.hpp
-	rw-r--r--	758	SpinLock.hpp
-	rw-r--r--	83,040	bit_array.c
-	rw-r--r--	19,395	bit_array.h
-	rw-r--r--	9,697	bit_macros.h
-	rw-r--r--	8,795	kseq.h
-	rw-r--r--	2,842	macros.h
-	rw-r--r--	1,992	rank9b.cpp
-	rw-r--r--	1,253	rank9b.h