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.. (parent) | ||||
- | rw-r--r-- | 23,004 | AlignmentModel.cpp | |
- | rw-r--r-- | 6,499 | BWAUtils.cpp | |
- | rw-r--r-- | 9,069 | BuildSalmonIndex.cpp | |
- | rwxr-xr-x | 9,621 | CMakeLists.txt | |
- | rw-r--r-- | 35,198 | CollapsedEMOptimizer.cpp | |
- | rw-r--r-- | 15,068 | CollapsedGibbsSampler.cpp | |
- | rw-r--r-- | 2,552 | DistributionUtils.cpp | |
- | rw-r--r-- | 9,553 | ErrorModel.cpp | |
- | rw-r--r-- | 3,071 | FASTAParser.cpp | |
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- | rw-r--r-- | 6,114 | FragmentLengthDistribution.cpp | |
- | rw-r--r-- | 8,817 | FragmentList.cpp | |
- | rw-r--r-- | 6,147 | FragmentStartPositionDistribution.cpp | |
- | rw-r--r-- | 15,184 | GZipWriter.cpp | |
- | rw-r--r-- | 3,353 | GenomicFeature.cpp | |
- | rw-r--r-- | 13,087 | JellyfishMerCounter.cpp | |
- | rw-r--r-- | 3,075 | LibraryFormat.cpp | |
- | rw-r--r-- | 9,182 | LookUpTableUtils.cpp | |
- | rw-r--r-- | 2,897 | MultithreadedBAMParser.cpp | |
- | rw-r--r-- | 10,728 | PCA.cpp | |
- | rw-r--r-- | 4,310 | PCAUtils.cpp | |
- | rw-r--r-- | 12,638 | QSufSort.c | |
- | rw-r--r-- | 10,673 | SBModel.cpp | |
- | rw-r--r-- | 16,676 | SGSmooth.cpp | |
- | rw-r--r-- | 23,106 | SailfishUtils.cpp | |
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- | rw-r--r-- | 10,731 | SequenceBiasModel.cpp | |
- | rw-r--r-- | 2,473 | SimplePosBias.cpp | |
- | rw-r--r-- | 309 | StadenUtils.cpp | |
- | rw-r--r-- | 2,195 | TestUtils.cpp | |
- | rw-r--r-- | 1,321 | TranscriptGroup.cpp | |
- | rw-r--r-- | 6,154 | VersionChecker.cpp | |
- | rw-r--r-- | 53,937 | bwt_gen.c | |
- | rw-r--r-- | 8,999 | bwtindex.c | |
- | rw-r--r-- | 36,395 | format.cc | |
- | rw-r--r-- | 6,674 | is.c | |
- | rw-r--r-- | 29,140 | tags | |
- | rw-r--r-- | 26,613 | xxhash.c |