package info (click to toggle)
samtools 1.22.1-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: forky, sid
  • size: 22,092 kB
  • sloc: ansic: 36,084; perl: 7,882; sh: 475; makefile: 302; java: 158

Folder: mpileup

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 4,096 expected
d d rwxr-xr-x 4,096 md5
- - rw-r--r-- 525 1read.bam
- - rw-r--r-- 5 1read.sam
- - rw-r--r-- 1,886 anomalous.sam
- - rw-r--r-- 265 c1%23clip.bam
- - rw-r--r-- 299 c1%23pad1.bam
- - rw-r--r-- 349 c1%23pad2.bam
- - rw-r--r-- 382 c1%23pad3.bam
- - rw-r--r-- 29 c1.fa
- - rw-r--r-- 557 ce%235b.bam
- - rw-r--r-- 416 ce%235b.bam.bai
- - rw-r--r-- 13,183 ce%235b.cram
- - rw-r--r-- 75 ce%235b.cram.crai
- - rw-r--r-- 2,033 ce%235b.sam
- - rw-r--r-- 345,315 ce%23large_seq.bam
- - rw-r--r-- 233 ce%23unmap.bam
- - rw-r--r-- 896 ce%23unmap1.bam
- - rw-r--r-- 1,344 ce%23unmap2.bam
- - rw-r--r-- 1,060,702 ce.fa
- - rw-r--r-- 1,568 cram-size.reg
- - rw-r--r-- 252,022 deep.sam
- - rw-r--r-- 5,840 depth.reg
- - rw-r--r-- 116 depth_del.sam
- - rw-r--r-- 1,561 indels.sam
- - rw-r--r-- 757 mod1.sam
- - rw-r--r-- 17 mp.fa
- - rw-r--r-- 65 mp_2018.fa
- - rw-r--r-- 193 mp_2018.sam
- - rw-r--r-- 295 mp_D.sam
- - rw-r--r-- 429 mp_DI.sam
- - rw-r--r-- 504 mp_I.sam
- - rw-r--r-- 416 mp_ID.sam
- - rw-r--r-- 421 mp_ID_rev.sam
- - rw-r--r-- 295 mp_N.sam
- - rw-r--r-- 484 mp_N2.sam
- - rw-r--r-- 432 mp_P.sam
- - rw-r--r-- 280 mpileup-E.bam
- - rw-r--r-- 71,637 mpileup.1.bam
- - rw-r--r-- 776 mpileup.1.bam.bai
- - rw-r--r-- 31,556 mpileup.2.bam
- - rw-r--r-- 31,216 mpileup.3.bam
- - rw-r--r-- 4,284 mpileup.ref.fa
- - rw-r--r-- 9,132 mpileup.reg
- - rw-r--r-- 210 output-BP.sam
- - rw-r--r-- 376 overlap.bam
- - rw-r--r-- 793 overlap50.sam
- - rw-r--r-- 583 overlapIllumina.bam
- - rw-r--r-- 250 regions
- - rw-r--r-- 279 xx%23depth1.sam
- - rw-r--r-- 279 xx%23depth2.sam
- - rw-r--r-- 346 xx%23depth3.sam
- - rw-r--r-- 521 xx%23depth4.sam
- - rw-r--r-- 210 xx%23depth5.sam
- - rw-r--r-- 215 xx%23minimal.bam
- - rw-r--r-- 247 xx%23triplet.bam
- - rw-r--r-- 17 xx.bed
- - rw-r--r-- 8 xx.bed2
- - rw-r--r-- 24 xx.bed3
- - rw-r--r-- 55 xx.fa