File: sequences.fasta

package info (click to toggle)
seqan2 2.3.1%2Bdfsg-4
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: stretch
  • size: 222,320 kB
  • ctags: 40,872
  • sloc: cpp: 252,894; ansic: 86,805; python: 6,534; sh: 985; xml: 570; makefile: 236; awk: 51
file content (111 lines) | stat: -rw-r--r-- 7,095 bytes parent folder | download | duplicates (18) 
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
 
>seq_ref
GTAGGTAAGCGGGGTATTTGCACTTCCCTTAATCCATAAGGGCTTTTGCCGCGTGTTAGAGGAAGCTATC
CCACACTTGTGTATGGCATCTTCCCCCTCAGCCTCCCTCGTGTCGTACTATACGATCATTTAAAGAAAGA
TATTTGGGATGGAGACGCATGATTCATGGCTAGTTCGGAGAGCGAACGGCGGAGGCCTAGGTGATATTCA
GGAGGATATGGGCTCCACAACTTTTTCCGTCGTAGCAAAGCATAAGGCTGACAAGCTTGGCTTTATACAC
TTCGCGAAATAGACCTCGATAAGCCATCTCTGTGGTGAGCTATCCCGGTTAATGCTAGTTGTGCGGGTTG
TAATTGCTAGTAACGGCCGGTTCTATTACATCTAATGGAAGGTTGTTCTATTGATTCTTCGTCAGAACTC
CCCGTAATATACATTTTTGGATATTGGCGCCCCCAGCTGGCACATGTAATATGTGTATATTCACACGTAA
TAACAGGTATGAATGATGTCACGCCGTCTCTGCGCGGCCCATAAGCTGACGCGCATATCGATATATTCTC
TGGGTCCTGGCGACGCACCCCATCCGCGTAATATTTAGTCATTCGGGTTTACTCCGATGGTCGCACACGG
ATAACCAGCTCCTAGTGGTTAAATAGTGACAGGTCTGACAACTAGACCCTATTCCTAGTACCAGCCCATC
TGCCGCTATAATTTTGCATTTGTTTCGTAAAGGATGAATCGTAATGCCAGCGGACTACCCCCGAGTCACA
AAATCAATTGAGTTCAGTTGCTATAGAGAGACAACTTACAGGATTAAGTAGTCGTTGCGTAAGTATGATA
GTAGAACCGCGCAGGAGGCGTACCTAACGCATCACGCCAAACGTTAACTAGGAATTCTGGATCGGCCGGC
GAACTCCTTTAGAGAGATCAGTAATACACCTATAAGATCAGTATGGTACGAACGGAACCGTGAGTCTTTC
TTTATCTTCTCTCTTAATTG
>seq_1
GTAGGTAAGCGGGGTATTTGCACTTCCCTTAATCCACGCTATAAGGGCTTTTGCCGCGTGTTAGAGGAAG
CTATCCCACACTTGTGTATGGCATCTTCCCCCTCAGCCTCCCTCGTGTCGTACTATACGATCATTTAAAG
AAAGATATTTGGTGGTGACGCATGATTCATGGCTAGTTCGGAGAGCGAACGGCGGAGGCCTAGGTGATAT
TCAGGAGGATATGGGCTCCACAACTTTTTCCGTCGTAGCAAAGCATAAGGCTGACAAGCGGCTTTATACA
CTTCGCGAAATAGACCTCGATAAGCCATCTCTGTGGTGAGCTATCCCGGTTAATGCTAGTTGTGCGGGTT
GTAATTGCTAGTAACGGCCGGTTCTATTACATCTAATGGAAGGTTGTTCTAATTCTTCGTCAGAACTCCC
CGTAATATACATTTTTGGATATTGGCGCCCCCAGCTGGCACATGTAATATGTGTATATTCACACGTAAAG
GTATGAATGATGTCACGCCGTCTGCGCGGCCCATAAGCTGACGCGCATATCGATATATTCTCTGGGTCCT
GGCGACGCACCCCATCCGCGTAATATTTAGTCATTCGGGTTTACTCCGATGGTCGCACACGGGACGACTC
ATAACCAGCTCCTATAAATAGTGACATCTGACAACTAGACCCTATTCCTAGTACCAGCCCATCTGCCGCT
ATAATTTTGCATTTGTTTCGTAAAGGATGAATCGTAATGCCAGCGGACTACCCCCGAGTCACAGATTAAA
ATCAATTGAGTTCAGTTGCTATAGAGAGAacgtCTTACAGGATTAAGTAGTCGTTGCGTAAGTATGATAG
TAGAACCGCGCAGGAGGCGTACCTAACGCATCACGCCAAACGTTAACTAGGAATTCTGGATCGGCCGGGA
ACTCCTTTAGAGAGATCAGTAATACACCTATAAGATCAGTATGGTACGAACGGAACCGTGAGTCTTTCTT
TATCTTCTCTCTTA
>seq_2
GTAGGTAAGCGGGGTATTTGCACTTCCCTTAATCCATAAGGGCTTTTGCCGCGTGTTAGAGGAAGCTATC
CCACACTTGTGTATGGCATCTTCCCCCTCAGCCTCCCTCGTGTCGTACTATACGATCATTTAAAGAAAGA
TATTTGGGATGGAGACGCATGATTCATGGCTAGTTCGGAGAGCGAACGGCGGAGGCCTAGGTGATATTCA
GGAGGATATGGGCTCCACAACTTTTTCCGTCGTAGCAAAGCATAAGGCTGACAAGCTTGGCTTTATACAC
TTCGCGAAGACCTCGATAAGCCATCTCTGTGGTGAGCTATCCCGGTTAATGCTAGTTGTGCGGGTTGACG
TAATTGCTAGTAACGGCCGGTTCTATTACATCTAATGGAAGGTTGTTCTATTGATTCTTCGTCAGAACTC
CCCGTAATATACATTTTTGGAACGACTGTTGGCGCCCCCAGCTGGCACATGTAATATGTGTATATTCACA
TAACAGGTATGAATGATGTCACGCCGTCTCTGCGCGGCCCATAAGCTGACGCGCATATCGATATATTCTC
TGGGTCCTGGCGACGCACCCCATCCGCGTAATATTTAGTCATTCGGGTTTACTCCGATGGTCGCACACGG
ATAACCAGCTCCTATAAATAGTGACAGGTCTGACAACTAGACCCTATTCCTAGTACCAGCCCATCTGCCG
CTATAATTTTGCATTTGTTTCGTAAAGGATGAATCGTAATGCCAGCGGACTACCCCCGAGTCACAGATTA
AAATCAATTGAGTTCAGTTGCTATAGAGAGACAACTTAACGTATTAAGTAGTCGTTGCGTAAGTATGATA
GTAGAACCGCGCGGCGTACCTAACGCATCACGCCAAACGTTAACTAGGAATTCTGGATCGGCCGGCGAAC
TCCTTACCCAACTAGAGAGATCAGTAATACACCTATAAGATCAGTATGGTACGAACGGAACCGTGAGTCT
TTTATCTTCCTTAATTG
>seq_3
GTAGGTAAGCGGGGTATTTCTTCCCGTCCTTAATCCATAAGGGCTTTTGCCGCGTGTTAGAGGAAGCTAT
CCACACTTGTGTATGGCATCTTCCCCCTCCGTCGTAGCCTCCCTCGTGTATACGATCATTTAAAGAAAGA
TATTTGGGATGGAGACGCATGATTCATGGCTAGTTCGGAGAGCGAACGGCGGAGGCCTAGGTGATATTCA
GGAGGATATGGGCTCCACAACTTTTTCCGTCGTAGCAAAGCATAAGGCTGACAAGCTTGGCTTTATACAC
TTCGCGAAATAGACCTCGATAAGCCATCTCTGTGGTGAGCTATCCCGGTTAATGCTAGTTGTGCGGGTTG
TAATTGCTAGTAACGGCCGGTTCTATTACATCTAATGGAAGGTTGTTCTATTGATTCTTCGTCAGAACTC
CCCGTAATATACTTGGATATTGGCGCCCCCAGCTGGCACGTCCATGTAATATGTGTATATTCACACGTAA
TAACAGGTATGAATGATGTGGTCACGCCGTCTCTGCGCGGCCCATAAGCTGACGCGCATATCGATATATT
TGGGTCCTGGCGACGCACCCCATCCGATATTTAGTCATTCGGGTTTACTCCGATGGTCGCACACGGATAA
CCAGCTCCTATAAATAGTGACAGGTCTGACAACTAGACCCTATTCCTAGTACCAGCCCATCTGCCGCTAT
AATTTTGCATTTGTTTCGTCGCGTAAAGGATGAATCGTAATGCCAGCGGACTACCCCCGAGTCACAGATT
AAATCAATTGAGTTCAGTTGCTATAGAGAGACAACTTACAGGATTAAGTAGTCGTTGCGTAAGTATGATA
GTAGAACCGCGCAGGAGGTACCTAACGCATCACGCCAAACGTACTAGGAATTCTGGATCGGCCGGGAACT
CCTTTAGAGAGATCAGTAATACACCTAGATCAGTATGGTACGAACGGAACCGTGAGTCTTTCTTTATCTT
CTCTCTTAATTG
>seq_4
GGGGGTGATGAGTAGTAGGTAAGCGGGGTATTTGCACTTCCCTTAATCCATAAGGGCTTTTGCCGCGTGT
CCACACTTGTGTATGGCATCTTCCCCCTCAGCCTCCCTCGTGTCGTACTATACGATCATTTAAAGAAAGA
TATTTGGGATGGAGACGCATGATTCATGGCTAGTTCGGAGAGCGAACGGCGGAGGCCTAGGTGATATTCA
GGAGGATATGGGCTCCACAACTTTTTCCGTCGTAGCAAAGCATAAGGCTGACAAGCTTGGCTTTATACAC
TTCGCGAAATAGACCTCGATAAGCCAGGCCGCTCGACTCAGCTCTCTGTGGTGAGCTATCCCGGTTAATG
TAATTGCTAGTAACGGCCGGTTCTATTACATCTAATGGAAGGTTGTTCTATTGATTCTTCGTCAGAACTC
CCCGTAATATACATTTTTGGATATTGGCGCCCCCAGCTGGCACATGTAATATGTGTATATTCACACGTAA
TAACAGGTATGAATGATGTCACGCCGTCTCTGCGCGGCCCATAAGCTGACGCGCATATCGATATATTCTC
TGGGTCCTGGCGACGCACCCCATCCGCGTAATATTTAGTCATTCGGGTTTACTCCGATGGTCGCACACGG
ATAACCAGCTCCTATAAATAGTGACAGGTCTGACAACTAGACCCTATTCCTAGTACCAGCCCATCTGCCG
CTATAATTTTGCATTTGTTTCGTAAAGGAACGTACGAGCGACTACGAGCGAGCGACTAGTTAAAATCAAT
TGAGTTCAGTTGCTATAGAGAGACAACTTACAGGATTAAGTAGTCGTTGCGTAAGTATGATAGTAGAACC
GCGCAGGAGGCGTACCTAACGCATCACGCCAAACGTTAACTAGGAATTCTGGATCGGCCGGCGAACTCCT
TTAGAGAGATCAGTAATACACCTATAAGATCAGTATGGTACGAACGGAACCGTGAGTCTTTCTTTATCTT
CTCTCTTAATTG
>seq_5
GTAGGTAAGCGGCACTTCCCTTAATCCATAAGGGCTTTTGCCGCGTGTTAGAGGAAGCTATCCCACACTT
GTGACGACGACTCTATGGCATCTTCCCCCTCAGCCTCCCTCGTGTCGTACTATACGATCATTTAAAGAAA
GATATTTGGGATGGAGACGCATGATTCATGGCTAGTTCGGAGAGCGGGAGGCCTAGGTGATATTCAGGAG
GATATGGGCTCCACAACTTTTTCCGTCGTAGCAAAGCATAAGGCTGACAAGCTTGGCTTTATACACTTCG
CGAAATAGACCTCGATAAGCCATCTCTGTGGTGTGGTGTGGTGAGCTATCCCGGTTAGTTGTGCGGGTTG
TAACGGCCGGTTCTATTACATCTAATGGAAGGTTGTTCTATTGATTCTTCGTCAGAACTCCCCGTAATAT
ACATTTTTGGATATTGGCGCCCCCAGCTGGCACATGTAATATGTGTATATTCACACGTAATAACAGGTAT
GAATGATGTCACGCCGTCTCTGCGCGGCCCATAAGCTGACGCGCATATCGATATATTCTCTGGGTCCTGG
CGACGCACCCCATCCGCGTAATATTTAGTCATTCGGGTTTACTCCGATGGTCGCACACGGATAACCAGCT
CCTAACGACGAGCGACACACTGACTACGCTAGACCCTATTCCTAGTACCAGCCCATCTGCCGCTATAATT
TTGCATTTGTTTCGTAAAGGATGAATCGTAATGCCAGCACAGTATTATATTTTTTCCGAGTCACAGATTA
AAATCAATTGAGTTCAGTTGCTATAGAGAGACAACTTACAGGATTAAGTAGTCGTTGCGTAAGTATGATA
GTAGAACCGCGCAGGAGGCGTACCTAACGCATCACGACTAGGAATTCTGGATCGGCCGGCGAACTCCTTT
AGAGAGATCAGTAATACACCTATAAGATCAGTATGGTACGAACGGTTTATCTTCTCTCTTAATTG
>seq_6
GTGGTGTAGGTAAGCGGGGTATTTGCACTTCCCTTAATCCATAAGGGCTTTTGCCGCGTGTTAGAGGAAG
CCACACTTGTGTATGGCATCTTCCCCCTCAGCCTCCCTCGTGTCGTACTATACGATCATTTAAAGAAAGA
TATTTGGGATGGAGACGCATGAACGACTGACGACTACGCTAGTTCGGAGAGCGAACGGCGGAGGCCTAGG
TGATATTCAGGAGGATATGGGCTCCACAACTTTTTCCGTCGTAGCAAAGCATAAGGCTGACAAGCTTGGC
TTTATACACTTCGCGAAATAGACCTCGATAAGCCATCTCTGTGGTGAGCTATCCCGGTTAATGCTAGTTG
TGCGGGTTGTAATTGCTAGTAACGGCCGGTTCTATTACATCTAATGGAAGGTTGTTCTATTGATTCTTCG
TCAGAACTCCCCGTAATATACATTTTTGGATGCTGGCACATGTAATATGTGTATATTCACACGTAATAAC
AGGTATGAATGATGTCACGCCGTCTCTGCGCGGCCCATAAGCTGACGCGCATATCGATATATTCTCTGGG
TCCTGGCGACGCACCCCATCCGCGTAATATTTAGTCATTCGGGTTTACTCCGATGGTCGCACACGGATAA
CCAGCTCCTATAAATAGTGACAGGTCTGACAACTAGACCCTATTCCTAGTACCAGCCCATCTGCCGCTAT
AATTTTGCATTTGTTTCGTAAAGGATGAATCGTAACGATCGACCGGACTACCCCCGAGTCACAGATTAAA
ATCAATTGAGTTCAGTTGCTATAGAGAGACAACTTACAGGATTAAGTAGTCGTTGCGTAAGTATGATAGT
AGAACCGCGCTAACGCATCACGCCAAACGTTAACTAGGAATTCTGGATCGGCCGGCGAACTCCTTTAGAG
AGATCAGTAATACACCTATAAGATCAGTATGGTACGAACGGAACCGTGAGTCTTTCTTTATCTTCTCTCT
TAATTGGTGGT