 |
|
|
|
.. (parent) |
 |
- |
rw-r--r-- |
23,333 |
align_base.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13,680 |
align_cols.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,552 |
align_config.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,013 |
align_interface_wrapper.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17,283 |
align_iterator_base.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,646 |
align_metafunctions.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,962 |
align_traceback.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,069 |
alignment_algorithm_tags.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,879 |
alignment_operations.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
90,000 |
dp_algorithm_impl.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
21,867 |
dp_align_simd_helper.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,786 |
dp_band.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,239 |
dp_cell.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,597 |
dp_cell_affine.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,182 |
dp_cell_dynamic.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,879 |
dp_cell_linear.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,478 |
dp_context.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,015 |
dp_formula.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
34,874 |
dp_formula_affine.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
39,480 |
dp_formula_dynamic.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,584 |
dp_formula_linear.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
24,245 |
dp_matrix.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,664 |
dp_matrix_navigator.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19,662 |
dp_matrix_navigator_score_matrix.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17,783 |
dp_matrix_navigator_score_matrix_sparse.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
24,383 |
dp_matrix_navigator_trace_matrix.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,851 |
dp_matrix_sparse.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
23,639 |
dp_meta_info.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
23,149 |
dp_profile.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,887 |
dp_scout.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18,314 |
dp_scout_simd.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,161 |
dp_setup.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,354 |
dp_trace_segment.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,384 |
dp_traceback_adaptor.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
29,358 |
dp_traceback_impl.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,290 |
evaluate_alignment.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19,673 |
fragment.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,801 |
gap_anchor.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,843 |
gapped_value_type.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
36,345 |
gaps_anchor.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
32,467 |
gaps_array.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
43,920 |
gaps_base.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
29,972 |
gaps_iterator_anchor.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
28,671 |
gaps_iterator_array.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17,589 |
gaps_iterator_base.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
40,268 |
global_alignment_banded.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,896 |
global_alignment_hirschberg_impl.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
27,780 |
global_alignment_myers_hirschberg_impl.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,839 |
global_alignment_myers_impl.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,419 |
global_alignment_specialized.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
44,262 |
global_alignment_unbanded.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,940 |
local_alignment_banded.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
25,844 |
local_alignment_banded_waterman_eggert_impl.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,629 |
local_alignment_enumeration.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,776 |
local_alignment_enumeration_banded.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,497 |
local_alignment_enumeration_unbanded.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18,490 |
local_alignment_unbanded.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
26,779 |
local_alignment_waterman_eggert_impl.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
33,362 |
matrix_base.h
|