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seqan2 2.4.0%2Bdfsg-11
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  • area: main
  • in suites: buster
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  • sloc: cpp: 256,886; ansic: 91,672; python: 8,339; sh: 995; xml: 570; makefile: 251; awk: 51

Folder: mason2

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 4,096 example
d d rwxr-xr-x 4,096 tests
- - rw-r--r-- 6,701 CMakeLists.txt
- - rw-r--r-- 1,556 LICENSE
- - rw-r--r-- 3,699 README
- - rw-r--r-- 4,042 README.mason_frag_sequencing
- - rw-r--r-- 2,409 README.mason_genome
- - rw-r--r-- 3,534 README.mason_materializer
- - rw-r--r-- 4,396 README.mason_methylation
- - rw-r--r-- 5,376 README.mason_simulator
- - rw-r--r-- 3,661 README.mason_splicing
- - rw-r--r-- 8,287 README.mason_variator
- - rw-r--r-- 957 TODO
- - rw-r--r-- 982 breakpoint_contigs.awk
- - rw-r--r-- 8,383 external_split_merge.cpp
- - rw-r--r-- 13,061 external_split_merge.h
- - rw-r--r-- 15,066 fragment_generation.h
- - rw-r--r-- 45,455 genomic_variants.cpp
- - rw-r--r-- 21,528 genomic_variants.h
- - rw-r--r-- 6,929 individual_genome.h
- - rw-r--r-- 10,177 mason_frag_sequencing.cpp
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- - rw-r--r-- 10,442 mason_materializer.cpp
- - rw-r--r-- 7,250 mason_methylation.cpp
- - rw-r--r-- 85,555 mason_options.cpp
- - rw-r--r-- 33,138 mason_options.h
- - rw-r--r-- 55,340 mason_simulator.cpp
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- - rw-r--r-- 15,744 mason_tests.cpp
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- - rw-r--r-- 89,170 mason_variator.cpp
- - rw-r--r-- 5,528 methylation_levels.cpp
- - rw-r--r-- 11,583 methylation_levels.h
- - rw-r--r-- 4,267 omp_wrapper.h
- - rw-r--r-- 15,759 sequencing.h
- - rw-r--r-- 15,939 simulate_454.cpp
- - rw-r--r-- 10,502 simulate_base.cpp
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- - rw-r--r-- 3,963 simulate_genome.h
- - rw-r--r-- 18,252 simulate_illumina.cpp
- - rw-r--r-- 11,426 simulate_sanger.cpp
- - rw-r--r-- 5,417 variation_size_tsv.h
- - rw-r--r-- 24,075 vcf_materialization.cpp
- - rw-r--r-- 7,946 vcf_materialization.h