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|
0 . : . : . : . : . :
-GCGGGTCACTGAG-GGCTGGGATGA------------------------
| | || ||| | ||
--C---T-AC-----GGC----A-GA------------------------
| | || ||| | ||
--C---T-AC-----GGC----A-GA------------------------
| | | ||| | ||
TGC---T-GCT-GCTGGC---GA-GATGTCTGCTGGTGCTGCTTGTCTCC
50 . : . : . : . : . :
---------------------------------------GG---------
|
---------------------------------------AG---------
||
---------------------------------------AG---------
||
TCGCTGTTGATGTGCTCGGGGCTGGCGTGCGGACCCGGCAGGGGATTTGG
100 . : . : . : . : . :
-ACGGCCAC--C---ACTTCGAGGAGTCCCTTCACTACGAGGGCAGGGCC
| | | | | ||| | | | | ||
-AAG---A---C---A----------TCC---GA--A-AA----A--GC-
||| | | | ||| | | | | ||
-AAG---A---C---A----------TCC---CA--A-GA----A--GC-
||| | | | || || | | | ||
CAAG---A-GGCGGAA----------CCC---CA--A-AA----A--GC-
150 . : . : . : . : . :
GTGGACATCACCACGTCAGACAGGGACAAGAGCAAG--TACGGCACCCTG
| || |||| | || | | ||| ||| || | | |||
-T-GA---CACCTC-TC-GCC---TACA--AGC-AGTTCA---TA-CCT-
| || |||||| || ||| |||| ||| |||| | || |||
-T-GA---CACCTC-TC-GCC---TACA--AGC-AGTTTA---TA-CCT-
| || | ||| | ||| |||| ||| |||||| | ||
-T-GA---CCCCTT-TA-GCC---TACA--AGC-AGTTTA---TC-CCC-
200 . : . : . : . : . :
TCCAGACTG--GCGGTGGAAGCTGGGTTCGACTGGGTCTACTATGAGTCC
| | || |||| ||| ||| || || | | ||
---A-A-TGTCGCGG-AGAA---------GAC-----CT--TA-GGGGCC
| | |||||||| |||| ||| || || ||||||
---A-A-TGTCGCGG-AGAA---------GAC-----CT--TA-GGGGCC
| | || |||| |||| ||| | || ||||||
---A-A-CGTGGCGG-AGAA---------GAC-----CC--TA-GGGGCC
250 . : . : . : . : . :
AAAGC-GCACATCCACTGCTCTGTGAAAGCAGAAAGCTCAGTCGCT-GCA
||| ||| || || | | | || ||| | | ||| ||
--AGCGGCAGAT--AC-G---AG-G---GC---AAGATAA--CGC--GC-
|||||||||| || | || | || ||||| | ||| ||
--AGCGGCAGAT--AC-G---AG-G---GC---AAGATCA--CGC--GC-
|| || |||| | | || | | ||||||| | | |
--AGTGGAAGAT--AT-G---AG-G---GG---AAGATCA--C-C-AGA-
300 . : . : . : . : . :
AAGTCGGGCGGTTGCTTCCCAG-GATCCTCCACGGTCACCCTGGAAAATG
|| |||| || ||| | | |||
AATTCGG-------------AGAGAT--T------T--------AAA---
||||||| |||||| | | |||
AATTCGG-------------AGAGAT--T------T--------AAA---
|| || | || ||| | | ||
AACTCAG-------------AGCGAT--T------T--------AAG---
350 . : . : . : . : . :
GCACCCAGAGGCCCGTCAAAGATCTCCAA-CCCGGGGACAGAGTACTGGC
| || | | | ||| || | ||| ||| ||| | || |
GAACTTA----CTC--CAA--AT-TACAATCCC---GAC--ATTA-T---
||||||| ||| ||| || ||||||||| ||| |||| |
GAACTTA----CTC--CAA--AT-TACAATCCC---GAC--ATTA-T---
||||| | | | | | || ||||| |||
GAACTCA----CCC--CCA--AT-TACAA-CCC-----------------
400 . : . : . : . : . :
CGCGGA-TTACGACGGA--AACCCGGTTTATACCGACTTCATCATGTTCA
| ||| | ||| | || | || | || |
--C---TTTA--A-GGATGA----GG---A----GA----A-CACG----
| |||| | |||||| || | || | |||
--C---TTTA--A-GGATGA----GG---A----GA----A-CACT----
--------------------------------------------------
450
A
-
-
-
consensus sequence is
GCTACTGGCGAGAAGAAGACATCCCAAAAAGCTGACACCTCTCGCCTACAAGCAGTTTATACCTAATGTCGCGGAGAAGACCTTAGGGGCCAGCGGCAGATACGAGGGCAAGATCACGCGCAATTCGGAGAGATTTAAAGAACTCACCCCAAATTACAATCCCGACATTATCTTTAAGGATGAGGAGAACACG
|
