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.. (parent) |
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rw-r--r-- |
23,571 |
align_base.h
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- |
rw-r--r-- |
13,680 |
align_cols.h
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- |
rw-r--r-- |
14,552 |
align_config.h
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- |
rw-r--r-- |
8,975 |
align_interface_wrapper.h
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- |
rw-r--r-- |
17,283 |
align_iterator_base.h
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- |
rw-r--r-- |
4,646 |
align_metafunctions.h
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- |
rw-r--r-- |
5,962 |
align_traceback.h
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- |
rw-r--r-- |
3,107 |
aligned_sequence_concept.h
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- |
rw-r--r-- |
6,069 |
alignment_algorithm_tags.h
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- |
rw-r--r-- |
6,879 |
alignment_operations.h
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- |
rw-r--r-- |
72,450 |
dp_algorithm_impl.h
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- |
rw-r--r-- |
20,772 |
dp_align_simd_helper.h
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- |
rw-r--r-- |
12,786 |
dp_band.h
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- |
rw-r--r-- |
14,678 |
dp_cell.h
|
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- |
rw-r--r-- |
9,653 |
dp_cell_affine.h
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- |
rw-r--r-- |
9,006 |
dp_cell_dynamic.h
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- |
rw-r--r-- |
4,879 |
dp_cell_linear.h
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- |
rw-r--r-- |
5,964 |
dp_context.h
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- |
rw-r--r-- |
12,540 |
dp_formula.h
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- |
rw-r--r-- |
17,463 |
dp_formula_affine.h
|
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- |
rw-r--r-- |
35,893 |
dp_formula_dynamic.h
|
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- |
rw-r--r-- |
13,260 |
dp_formula_linear.h
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- |
rw-r--r-- |
24,107 |
dp_matrix.h
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- |
rw-r--r-- |
12,111 |
dp_matrix_navigator.h
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- |
rw-r--r-- |
18,833 |
dp_matrix_navigator_score_matrix.h
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- |
rw-r--r-- |
11,876 |
dp_matrix_navigator_score_matrix_sparse.h
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- |
rw-r--r-- |
28,959 |
dp_matrix_navigator_trace_matrix.h
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- |
rw-r--r-- |
6,028 |
dp_matrix_sparse.h
|
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- |
rw-r--r-- |
23,640 |
dp_meta_info.h
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- |
rw-r--r-- |
30,333 |
dp_profile.h
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- |
rw-r--r-- |
13,305 |
dp_scout.h
|
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- |
rw-r--r-- |
36,421 |
dp_scout_simd.h
|
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- |
rw-r--r-- |
16,105 |
dp_setup.h
|
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- |
rw-r--r-- |
14,350 |
dp_trace_segment.h
|
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- |
rw-r--r-- |
14,384 |
dp_traceback_adaptor.h
|
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- |
rw-r--r-- |
31,002 |
dp_traceback_impl.h
|
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- |
rw-r--r-- |
12,314 |
evaluate_alignment.h
|
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- |
rw-r--r-- |
19,673 |
fragment.h
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- |
rw-r--r-- |
12,801 |
gap_anchor.h
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- |
rw-r--r-- |
3,843 |
gapped_value_type.h
|
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- |
rw-r--r-- |
36,461 |
gaps_anchor.h
|
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- |
rw-r--r-- |
32,467 |
gaps_array.h
|
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- |
rw-r--r-- |
44,170 |
gaps_base.h
|
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- |
rw-r--r-- |
29,954 |
gaps_iterator_anchor.h
|
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- |
rw-r--r-- |
28,671 |
gaps_iterator_array.h
|
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- |
rw-r--r-- |
17,589 |
gaps_iterator_base.h
|
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- |
rw-r--r-- |
38,045 |
global_alignment_banded.h
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- |
rw-r--r-- |
22,896 |
global_alignment_hirschberg_impl.h
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- |
rw-r--r-- |
27,828 |
global_alignment_myers_hirschberg_impl.h
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- |
rw-r--r-- |
7,855 |
global_alignment_myers_impl.h
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- |
rw-r--r-- |
9,419 |
global_alignment_specialized.h
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- |
rw-r--r-- |
46,020 |
global_alignment_unbanded.h
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- |
rw-r--r-- |
18,354 |
local_alignment_banded.h
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- |
rw-r--r-- |
25,876 |
local_alignment_banded_waterman_eggert_impl.h
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- |
rw-r--r-- |
8,629 |
local_alignment_enumeration.h
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- |
rw-r--r-- |
5,776 |
local_alignment_enumeration_banded.h
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- |
rw-r--r-- |
5,497 |
local_alignment_enumeration_unbanded.h
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- |
rw-r--r-- |
24,598 |
local_alignment_unbanded.h
|
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- |
rw-r--r-- |
26,853 |
local_alignment_waterman_eggert_impl.h
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- |
rw-r--r-- |
34,878 |
matrix_base.h
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