File: alns1.sam

package info (click to toggle)
seqan2 2.5.2-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: forky, sid
  • size: 228,748 kB
  • sloc: cpp: 257,602; ansic: 91,967; python: 8,326; sh: 1,056; xml: 570; makefile: 229; awk: 51; javascript: 21
file content (22 lines) | stat: -rw-r--r-- 6,133 bytes parent folder | download | duplicates (9)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
@HD	VN:1.4
@SQ	SN:1	LN:400
simulated.1	0	1	54	255	100M	*	0	0	GTTGACCCATGCAGAACGAGAGCTTGCCGCTGAATGGGAACATCGCCGACGTTAGAGATGGCCCCAGACAGGCATATCGTAAGTGATTTCGTAGCGAACC	IIHIHIIHHGIIIGHIHHIGGIGIGIHFHGGGIIFHGHIIHIDIIEFIGIHIIIHIIHGIIEDGHEHIIICIEIGIICDIIIHIGFHHIBFBDE=BEFBI	NM:i:0	MD:Z:100	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:53	oS:A:F	XE:i:0	XS:i:0	XI:i:0
simulated.2	0	1	171	255	100M	*	0	0	CGGTATGATCCAGTAGGTCCACGGAATCAAGGCGGCTCATGCGTGGATTGCCTTGACTTCCGTAGCTTGGGGGGTAGCCGGCACCGGCCCGGCTAACAGC	HHIHHHIIHIIHHIIHHHHHHGIHFIHIHDIEIGIIGIEGFEIIFGGIHHIIGBFIFIFEGHEHIEDCDIICIIIIGIIIIIIHIEIIHIFGIEIIICBG	NM:i:0	MD:Z:100	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:170	oS:A:F	XE:i:0	XS:i:0	XI:i:0
simulated.3	16	1	127	255	100M	*	0	0	ATATCGTAAGTGATTTCGTAGCGAACCTACCCAGCTCTAAGGGTCGGTATGATCCAGTTGGTCCACGGAATCAAGGCGGCTCATGCGTGGATTGCCTTGA	BGIHAEIGF;HII=AGHIFBIBICICDHD?DIGEGIHHDBIDGHDFAIIIIIIIHFFGHGIICIIGIHFIGFGIFIIIIIFHGIIIIHHIIIHHHHHHIH	NM:i:1	MD:Z:58A41	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:126	oS:A:R	XE:i:1	XS:i:0	XI:i:0
simulated.4	0	1	154	255	100M	*	0	0	TACCCAGCTCTAAGGGTCGGTATGATCCAGTAGGTCCACGGAATCAAGGCGGCTCAGGCGTGGATTGCCTTGACTTCCGTAGCTTGGGGGGTAGCCGGCA	IHIIIHIIHGHHIGIGIHGFFHHIIGGHIHEICIIIHEIGHIHCIFIHIHGIIIIGHIFDHEIIGIHH?IDIIIEIEIIHFIII>IIIDDIGFFDEIIII	NM:i:1	MD:Z:56T43	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:153	oS:A:F	XE:i:1	XS:i:0	XI:i:0
simulated.5	16	1	188	255	100M	*	0	0	TCCACGGAATCAAGGCGGCTCATGCGTGGATTGCCTTGACTTCCGTAGCTTGGGGGGTAGCCGGCACCGGCCCGGCTAACAGCGGGAGTGCCATACACTT	IIIHIIIIGIF@HI=IIIIIHIDIIIHIIE@HHICIIEIIGIIIIIHIIF?HFGIDIFIIEIHIIIHFFFIHIHIHIGHGHIIHIHHIIHIIIIIHHIII	NM:i:0	MD:Z:100	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:187	oS:A:R	XE:i:0	XS:i:0	XI:i:0
simulated.6	16	1	194	255	100M	*	0	0	GAATCAAGGCGGCTCATGCGTGGATTGCCTTGACTTCCGCAGCTTGGGGGGTAGCCGGCAACGGCCCGGCTAACAGCGGGAGTGCCATACACTTCTGGCA	IFIB?IHIGIEIIG@AIIIIH;IFEGIIICGGIAFIIIIIIFEIIEDFIHIIEGEIEHIHGIIHGIIIIIHIFIGFHHGHIIGIHHHHIIIIHHIIIHII	NM:i:2	MD:Z:39T20C39	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:193	oS:A:R	XE:i:2	XS:i:0	XI:i:0
simulated.7	0	1	104	255	100M	*	0	0	GTTAGAGATGGCCCCAGACAGGCATATCGTAAGTGATTTCGTAGCGAACCTACCCAGCTCTAAGGGTCGGTATGATCCAGTAGGTCCACGGAATCAAGGC	HIIHIIHHHHHIIIIHIHIGHIHEFIIGIGGGHIDIGIIIIHDI>IIIIIIIGDHHGEHIGHBHIICIIHHEBDIIGDFGIIII=DHBB=DBIIBIBFIF	NM:i:0	MD:Z:100	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:103	oS:A:F	XE:i:0	XS:i:0	XI:i:0
simulated.8	16	1	174	255	100M	*	0	0	TATGATCCAGTAGGTCCACGGAATCAAGGCGGCTCATTCGTGGATTGCCTTGACTTCCGTAGCTTGGGGGGTAGCCGGCACCGGCCCGGCTAACAGCGGG	?AGICFADIIIIIIIGICFBIIF>HIGGHIFIICIHHIGGDBIIIBFHDIIIIDHFIIIGIIGHIHIFIFIIIHIHGIHIIHIGIIHHIHHGHHIIIIIH	NM:i:1	MD:Z:37G62	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:173	oS:A:R	XE:i:1	XS:i:0	XI:i:0
simulated.9	16	1	2	255	100M	*	0	0	GGTGTGTCGGCCCTATCCCTTGCGCTTACAGACTATATTTCTTCGTGAGGGAGTTGACCCATGCAGAACGAGAGCTTGCCGCTGAATGGGAACATCGCCG	BII?IIGGFIICH@HI<BCIIAIIHDDIIIHEECHHIFIIGIEIIIFBIFHEIIIHHIIGGIIIIDEEEFDIIDIFEHIIIIGHIGIIHIIGIHHIIIHH	NM:i:1	MD:Z:34T65	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:1	oS:A:R	XE:i:1	XS:i:0	XI:i:0
simulated.10	16	1	163	255	100M	*	0	0	CTAAGGGTCGGTATGATCCAGTAGGTCCACGGAATCAAGGCGGCTCATGCGTGGATTGCCTTGACTTCCGTAGCTTGGGGGGTAGCCGGCACCGGCCCGG	AEIBAIIIIGHF<IFIDIHIAIIBIGI?IIIIIIHIIG@GFIIHIIIII@GHGGBGIIIIGHHHFHHFHIIHGHIGHIHIIIGIHHHHHHIIIIHHHIHI	NM:i:0	MD:Z:100	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:162	oS:A:R	XE:i:0	XS:i:0	XI:i:0
simulated.11	0	1	77	255	100M	*	0	0	TTGCCGCTGAATGGGAACATCGCCGACGTTAGAGATGGCCCCAGACAGGCATATCGTAAGTGATTTCGTAGCGAACCTACCCAGCTCTAAGGGTCGGTAT	IHIIIIHIHHHHIGHIHIFIHHHHIEIIHIIFHEIIFIHIHIHIFHIAIGHHDIBHIEFIEIAIICFIIIGGGGIIEI=IIDCIBAIIHIC?IEDHIIIG	NM:i:0	MD:Z:100	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:76	oS:A:F	XE:i:0	XS:i:0	XI:i:0
simulated.12	16	1	164	255	100M	*	0	0	TAAGGGTCGGTATGATCCAGTAGGTCCACGGAATCAAGGCGGCTCATGCGTGGATTGCCTTGACTTCCGTAGCTTGGGGGGTAGCCGGCACCGGCCCGGC	I:IIAAIIIIII@DIII@CGFGGIDEIBIIDBAEII?IFDEIIIEIIDCCIIIHIIFIIFIIHIFFIBDEHIGIGGHIGFFHHHIHIIIIHIHHHHHHII	NM:i:0	MD:Z:100	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:163	oS:A:R	XE:i:0	XS:i:0	XI:i:0
simulated.13	0	1	131	255	100M	*	0	0	CGTAAGTGATTTCGTAGCGAACCTACCCAGCTCTAAGGGTCGGTCTGATCCAGTAGGTCCACGGAATCAAGGCGGCTCATGCGTGGATTGCCTTGACTTC	HHHIIHIIHHHGHHIGIIIHHGHHIEIGHHIIGDDHEGIBIFFFIICCGIEIIIIIIIFIDII?IHHCCFFIEHGDIIIFEIII@@CIEIDBGEIIC;HE	NM:i:1	MD:Z:44A55	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:130	oS:A:F	XE:i:1	XS:i:0	XI:i:0
simulated.14	0	1	21	255	100M	*	0	0	TTGCGCTTACAGACTTTATTTCTTCGTGAGGGAGTTGACCCATGCAGAACCAGAGCTTGCCGCTGAATGGGAACATCGCCGACGTTAGAGATGGCACCAG	IHHIIHHHHIHHHGHHIGGGGGIIIIGFIIFGHGGCHHIIGIIIGICIFGHGFIIIIFIGHDIIGIDDIIII@BEIHGFIFCIEFIEGBIAIGIEGIIFE	NM:i:2	MD:Z:50G44C4	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:20	oS:A:F	XE:i:2	XS:i:0	XI:i:0
simulated.15	16	1	179	255	100M	*	0	0	TCCAGTAGGTCCACGGAATCAAGGCCGCTCATGCGTGGATTGCCTTGACTTCCGTAGCTTGGGGGGTAGCCGGCACCGGCCCGGCTAACAGCGGGAGTGC	GICIIIGDIHIGD@I@IIHIIIAHEEDIIIIIEFFIIFICIIIFIIBIHIIDIIIEHHGIGIIHIIIIIEGGIIIIIIIHIIIIIIIHIIIIIIIIHIIH	NM:i:1	MD:Z:25G74	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:178	oS:A:R	XE:i:1	XS:i:0	XI:i:0
simulated.16	0	1	52	255	100M	*	0	0	GAGTTGACCCATGCAGAACGAGAGCTTGCCGCTGAATGGGAACATCGCCGACGTTAGAGATGGCCCCAGACAGGCATATCGTAAGTGATTTCGTAGCGAA	IHHHIIIHHIIGHIHGGGFIHIGIEGIIIIGIIHHIIIGIFHIGDHIIBHDIIIHII?IEDIFIIGIIIHHIIIADIAH>H@AICFCIIFGEIIFIIIHH	NM:i:0	MD:Z:100	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:51	oS:A:F	XE:i:0	XS:i:0	XI:i:0
simulated.17	0	1	60	255	100M	*	0	0	CCATGCAGAACGAGAGCTTGCCGCTGAATGGGAACATCGCCGACGTTAGAGATGGCCCCAGACAGGCATATCGTAAGTGATTTCGTAGCGAACCTACCCA	IIIIIIHHIHGIHHIIGGHIIIFGIHGHIEFIEIFIEFHIFIEHIGIIIFEIIFEIIGFIIICIFHCFIDI?HEGIIEHIIFIIIIBIIEIFI@DCIDIF	NM:i:0	MD:Z:100	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:59	oS:A:F	XE:i:0	XS:i:0	XI:i:0
simulated.18	16	1	88	255	100M	*	0	0	TGGGAAAATCGCCGACGTTAGAGATGGCCCCAGACAGGCATATCGTAAGTGATTTCGTAGCGAACCTACCCAGCTCTAAGGGTCGGTATGATCCAGTAGG	IAF7CAIIFD>HIFIIIBCEIIEIFHIEIHGEIIIBDIBIEIIGEHHHIIIIIIIIIIICIICFIEIGEIIFIGIHHIIHHGIIHIHIIHHIHIHHHIHH	NM:i:1	MD:Z:6C93	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:87	oS:A:R	XE:i:1	XS:i:0	XI:i:0
simulated.19	16	1	11	255	100M	*	0	0	GCCCTATCCCTTGCGCTTACAGACTTTATTTCTTCGTGAGGGAGTTGACCCATGCAGAACGAGAGCTTGCCGCTGAATGGGAACATCGCCGACGTTAGAG	IAIIIIIIDH?@@IIFFIBGDHHFG?DII>IFFIFIIGIIIICHIIHIIDDIFEIIHIIFGGHFFGHIFIGHHFFHGIHGHIHIGHIHHIIHIIHHIHHI	NM:i:0	MD:Z:100	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:10	oS:A:R	XE:i:0	XS:i:0	XI:i:0
simulated.20	16	1	167	255	100M	*	0	0	GGGTCGGTATGATCCAGTAGGTCCACGGAATCAAGGCGGCTCATGCGTGGATTGCCTTGACTTCCGTAGCTTGGGGGGTAGCCGGCACCGGCCCGGCTAA	=II@IIIE>IIIIIEGIIIIDIIIIIIIIEIEHIIIIHIC@IGIFIIFGIFIHBGFIHFIIIDICFIGFGIHIIGGIIHGHIIHHGHHGIIIIHHIHIII	NM:i:0	MD:Z:100	oR:Z:1	oH:i:1	oP:i:166	oS:A:R	XE:i:0	XS:i:0	XI:i:0