 |
|
|
|
.. (parent) |
 |
- |
rw-r--r-- |
8,449 |
CMakeLists.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
228,989 |
fasta.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,411,557 |
m_tuberculosis_h37rv.fa
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,108 |
test_crosscompare.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,339 |
test_find2_index_approx.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
20,070 |
test_find2_index_approx.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,532 |
test_find_backtracking.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,754 |
test_find_backtracking.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,559 |
test_find_base.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,820 |
test_index_base.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,177 |
test_index_bifm.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,605 |
test_index_creation.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,860 |
test_index_creation.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,557 |
test_index_crosscompare_char.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,557 |
test_index_crosscompare_char_dfi.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,685 |
test_index_crosscompare_dna.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,635 |
test_index_crosscompare_dna_dfi.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,604 |
test_index_drawing.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,074 |
test_index_finder.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,989 |
test_index_fm.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,815 |
test_index_fm_rank_dictionary.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,009 |
test_index_fm_right_array_binary_tree.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,649 |
test_index_fm_right_array_binary_tree.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
28,108 |
test_index_fm_right_array_binary_tree_iterator.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,072 |
test_index_fm_sparse_string.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
16,018 |
test_index_fm_stree.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,450 |
test_index_helpers.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,609 |
test_index_qgram.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,351 |
test_index_repeats.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,946 |
test_index_repeats.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,437 |
test_index_sa_bwtwalk.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,406 |
test_index_shapes.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,108 |
test_index_stree_iterators.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,091 |
test_index_swift.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,224 |
test_index_view.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,450 |
test_index_view.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,900 |
test_index_vstree.cpp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,419 |
test_qgram_index.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,854 |
test_sa_bwtwalk.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,459 |
test_shapes.h
|
 |
- |
rw-r--r-- |
25,377 |
test_stree_iterators.h
|