package info (click to toggle)
seqan2 2.5.2-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: forky, sid
  • size: 228,748 kB
  • sloc: cpp: 257,602; ansic: 91,967; python: 8,326; sh: 1,056; xml: 570; makefile: 229; awk: 51; javascript: 21

Folder: seq_io

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 2,138 CMakeLists.txt
- - rw-r--r-- 253,451 SRR067601_1.1k.fasta
- - rw-r--r-- 45,439 SRR067601_1.1k.fasta.gz
- - rw-r--r-- 4,882 adeno_genome.fa
- - rw-r--r-- 62 adeno_genome.fa.fai
- - rw-r--r-- 214 small_sequences.bam
- - rw-r--r-- 226 small_sequences.sam
- - rw-r--r-- 53 test_dna.fa
- - rw-r--r-- 62 test_dna.fa.bgzf
- - rw-r--r-- 71 test_dna.fa.bz2
- - rw-r--r-- 66 test_dna.fa.gz
- - rw-r--r-- 94 test_dna.fq
- - rw-r--r-- 99 test_dna.fq.bgzf
- - rw-r--r-- 84 test_dna.fq.bz2
- - rw-r--r-- 75 test_dna.fq.gz
- - rw-r--r-- 5,578 test_fai_index.h
- - rw-r--r-- 4,891 test_genbank.gbk
- - rw-r--r-- 4,846 test_genomic_region.h
- - rw-r--r-- 5,262 test_read_bam.h
- - rw-r--r-- 5,997 test_seq_io.cpp
- - rw-r--r-- 6,985 test_seq_io_generic.h
- - rw-r--r-- 13,584 test_sequence_file.h
- - rw-r--r-- 22,826 test_stream_read_embl.h
- - rw-r--r-- 26,784 test_stream_read_genbank.h
- - rw-r--r-- 12,010 test_stream_record_reader_fasta.h
- - rw-r--r-- 10,782 test_stream_write_fasta.h
- - rw-r--r-- 4,601 test_tag_select_intersect.h
- - rw-r--r-- 5,056 test_write_bam.h