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#include <gtest/gtest.h>
#include <functional>
#include <type_traits>
#include <seqan3/alignment/configuration/align_config_sequence_ends.hpp>
TEST(align_config_sequence_ends, constructor)
{
EXPECT_TRUE((std::is_default_constructible_v<seqan3::detail::align_config_sequence_ends<>>));
}
TEST(align_config_sequence_ends, on_align_config)
{
struct bar
{
int value;
};
using sequence_ends_align_cfg = seqan3::detail::on_align_config<seqan3::align_cfg::id::sequence_ends>;
EXPECT_FALSE((sequence_ends_align_cfg::invoke<bar>::value));
EXPECT_TRUE((sequence_ends_align_cfg::invoke<seqan3::detail::align_config_sequence_ends<>>::value));
}
TEST(align_config_sequence_ends, align_config_type_to_id)
{
EXPECT_EQ(seqan3::detail::align_config_type_to_id_v<seqan3::detail::align_config_sequence_ends<>>,
seqan3::align_cfg::id::sequence_ends);
EXPECT_EQ(seqan3::detail::align_config_type_to_id<seqan3::detail::align_config_sequence_ends<>>::value,
seqan3::align_cfg::id::sequence_ends);
}
TEST(align_config_sequence_ends, invoke)
{
auto cfg = std::invoke(seqan3::align_cfg::sequence_ends<>(free_ends_at::seq1), seqan3::detail::configuration<>{});
EXPECT_NE(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq1_front);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq2_front);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq1_back);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq2_back);
EXPECT_TRUE((std::is_same_v<std::remove_cvref_t<decltype(cfg)>,
seqan3::detail::configuration<seqan3::detail::align_config_sequence_ends_deferred>>));
}
TEST(align_config_sequence_ends, invoke_static)
{
auto cfg = std::invoke(seqan3::align_cfg::sequence_ends<free_ends_at::seq1>(), seqan3::detail::configuration<>{});
EXPECT_NE(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq1_front);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq2_front);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq1_back);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq2_back);
using free_ends_align_config = seqan3::detail::align_config_sequence_ends<free_ends_at::seq1>>;
EXPECT_TRUE((std::is_same_v<std::remove_cvref_t<decltype(cfg)>, seqan3::detail::configuration<free_ends_align_config>));
}
TEST(align_config_sequence_ends, get_by_enum)
{
{
seqan3::detail::configuration cfg = seqan3::align_cfg::sequence_ends<>(free_ends_at::seq1_back |
free_ends_at::seq2_front);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq1_front);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq2_front);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq1_back);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq2_back);
EXPECT_TRUE((std::is_same_v<decltype(std::get<seqan3::align_cfg::id::sequence_ends>(cfg)),
free_ends_at &>));
}
{
seqan3::detail::configuration<seqan3::detail::align_config_sequence_ends_deferred> const c_cfg =
seqan3::detail::configuration{seqan3::align_cfg::sequence_ends<>(free_ends_at::seq1_back |
free_ends_at::seq2_front)};
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, get<0>(c_cfg).value & free_ends_at::seq1_front);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, get<0>(c_cfg).value & free_ends_at::seq2_front);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, get<0>(c_cfg).value & free_ends_at::seq1_back);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, get<0>(c_cfg).value & free_ends_at::seq2_back);
EXPECT_TRUE((std::is_same_v<decltype(std::get<seqan3::align_cfg::id::sequence_ends>(c_cfg)),
free_ends_at const &>));
}
{
seqan3::detail::configuration cfg = seqan3::align_cfg::sequence_ends<>(free_ends_at::seq1_back |
free_ends_at::seq2_front);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq1_front);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq2_front);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq1_back);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, get<0>(cfg).value & free_ends_at::seq2_back);
EXPECT_TRUE((std::is_same_v<decltype(std::get<seqan3::align_cfg::id::sequence_ends>(std::move(cfg))),
free_ends_at &&>));
}
{
seqan3::detail::configuration<seqan3::detail::align_config_sequence_ends_deferred> const c_cfg =
seqan3::detail::configuration{seqan3::align_cfg::sequence_ends<>(free_ends_at::seq1_back |
free_ends_at::seq2_front)};
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, get<0>(c_cfg).value & free_ends_at::seq1_front);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, get<0>(c_cfg).value & free_ends_at::seq2_front);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, get<0>(c_cfg).value & free_ends_at::seq1_back);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, get<0>(c_cfg).value & free_ends_at::seq2_back);
EXPECT_TRUE((std::is_same_v<decltype(std::get<seqan3::align_cfg::id::sequence_ends>(std::move(c_cfg))),
free_ends_at const &&>));
}
}
TEST(align_config_sequence_ends, free_ends_enum_all_and_none)
{
seqan3::seqan3::detail::align_config_sequence_ends<free_ends_at::all> cfg_all;
EXPECT_NE(free_ends_at::none, cfg_all.value & free_ends_at::seq1_front);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, cfg_all.value & free_ends_at::seq2_front);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, cfg_all.value & free_ends_at::seq1_back);
EXPECT_NE(free_ends_at::none, cfg_all.value & free_ends_at::seq2_back);
seqan3::seqan3::detail::align_config_sequence_ends cfg_none;
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, cfg_none.value & free_ends_at::seq1_front);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, cfg_none.value & free_ends_at::seq2_front);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, cfg_none.value & free_ends_at::seq1_back);
EXPECT_EQ(free_ends_at::none, cfg_none.value & free_ends_at::seq2_back);
}
TEST(align_config_sequence_ends, invoke_deferred)
{
seqan3::detail::configuration cfg = seqan3::align_cfg::sequence_ends<>(free_ends_at::seq1);
auto call_on_site = [] (auto && new_cfg)
{
return std::get<0>(new_cfg).value;
};
EXPECT_EQ((std::invoke(std::get<0>(cfg), call_on_site, cfg)), free_ends_at::seq1);
}
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