package info (click to toggle)
staden 2.0.0%2Bb11-4
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bookworm, bullseye, buster, trixie
  • size: 21,556 kB
  • sloc: ansic: 240,603; tcl: 65,360; cpp: 12,854; makefile: 11,201; sh: 2,952; fortran: 2,033; perl: 63; awk: 46

Folder: spin

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 39,313 Makefile
- - rw-r--r-- 6,916 base_comp.tcl
- - rw-r--r-- 33,987 codon_content.c
- - rw-r--r-- 2,102 codon_content.h
- - rw-r--r-- 5,481 comborange.tcl
- - rw-r--r-- 11,441 compare_spans.c
- - rw-r--r-- 838 compare_spans.h
- - rw-r--r-- 2,103 dinuc_freqs.c
- - rw-r--r-- 248 dinuc_freqs.h
- - rw-r--r-- 6,309 dot_raster.tcl
- - rw-r--r-- 1,707 eia.wts
- - rw-r--r-- 26,618 emboss_input_funcs.c
- - rw-r--r-- 993 emboss_input_funcs.h
- - rw-r--r-- 871 gap_canvas_box.tcl
- - rw-r--r-- 18,695 gene_search.tcl
- - rw-r--r-- 3,687 graph_raster.tcl
- - rw-r--r-- 779 ied.wts
- - rw-r--r-- 961 init.c
- - rw-r--r-- 8,389 keybox.tcl
- - rw-r--r-- 10,816 nip_base_comp.c
- - rw-r--r-- 431 nip_base_comp.h
- - rw-r--r-- 5,053 nip_canvas_box.c
- - rw-r--r-- 311 nip_canvas_box.h
- - rw-r--r-- 3,412 nip_canvas_box.tcl
- - rw-r--r-- 61,510 nip_cmds.c
- - rw-r--r-- 124 nip_cmds.h
- - rw-r--r-- 6,400 nip_codon_content.tcl
- - rw-r--r-- 1,847 nip_dinuc_freq.tcl
- - rw-r--r-- 19,086 nip_gene_search.c
- - rw-r--r-- 899 nip_gene_search.h
- - rw-r--r-- 4,058 nip_genetic_code.tcl
- - rw-r--r-- 1,437 nip_globals.c
- - rw-r--r-- 177 nip_globals.h
- - rw-r--r-- 5,484 nip_open_reading_frames.tcl
- - rw-r--r-- 1,061 nip_raster.h
- - rw-r--r-- 11,188 nip_restriction_enzymes.c
- - rw-r--r-- 959 nip_restriction_enzymes.h
- - rw-r--r-- 7,254 nip_restriction_enzymes.tcl
- - rw-r--r-- 214 nip_results.h
- - rw-r--r-- 155 nip_sendto.h
- - rw-r--r-- 7,240 nip_sendto.tcl
- - rw-r--r-- 18,298 nip_splice_search.c
- - rw-r--r-- 455 nip_splice_search.h
- - rw-r--r-- 32,757 nip_stop_codon.c
- - rw-r--r-- 811 nip_stop_codon.h
- - rw-r--r-- 6,628 nip_stop_codon.tcl
- - rw-r--r-- 11,198 nip_string_search.c
- - rw-r--r-- 474 nip_string_search.h
- - rw-r--r-- 3,629 nip_string_search.tcl
- - rw-r--r-- 5,118 nip_structs.h
- - rw-r--r-- 3,538 nip_translation.tcl
- - rw-r--r-- 10,006 nip_trna_search.c
- - rw-r--r-- 534 nip_trna_search.h
- - rw-r--r-- 10,534 nip_wtmatrix_search.c
- - rw-r--r-- 542 nip_wtmatrix_search.h
- - rw-r--r-- 3,905 nip_wtmatrix_search.tcl
- - rw-r--r-- 11,672 niprc
- - rw-r--r-- 3,791 perceptron.wts
- - rw-r--r-- 14,129 probs.c
- - rw-r--r-- 1,175 probs.h
- - rw-r--r-- 632 prokprom_10.wts
- - rw-r--r-- 812 prokprom_35.wts
- - rw-r--r-- 11,178 raster_cmds.c
- - rw-r--r-- 99 raster_cmds.h
- - rw-r--r-- 157 raster_globals.h
- - rw-r--r-- 1,137 raster_structs.h
- - rw-r--r-- 7,089 readpam.c
- - rw-r--r-- 443 readpam.h
- - rw-r--r-- 1,992 rescan_matches.c
- - rw-r--r-- 157 rescan_matches.h
- - rw-r--r-- 1,099 rescan_matches.tcl
- - rw-r--r-- 88 resource.h
- - rw-r--r-- 10,683 seq_id.tcl
- - rw-r--r-- 24,205 seq_plot_funcs.c
- - rw-r--r-- 598 seq_plot_funcs.h
- - rw-r--r-- 112,635 seq_raster.c
- - rw-r--r-- 8,131 seq_raster.h
- - rw-r--r-- 63,486 seq_raster.tcl
- - rw-r--r-- 27,417 seq_reg.c
- - rw-r--r-- 7,560 seq_reg.h
- - rw-r--r-- 76,190 seq_reg_cmds.c
- - rw-r--r-- 3,327 seq_reg_structs.h
- - rw-r--r-- 5,331 seq_result_manager.tcl
- - rw-r--r-- 39,432 seq_results.c
- - rw-r--r-- 7,048 seq_results.h
- - rw-r--r-- 5,519 seq_sendto.c
- - rw-r--r-- 112 seq_sendto.h
- - rw-r--r-- 6,972 seqed.c
- - rw-r--r-- 725 seqed.h
- - rw-r--r-- 14,162 seqed.tcl
- - rw-r--r-- 3,129 seqedInterface.c
- - rw-r--r-- 204 seqedInterface.h
- - rw-r--r-- 11,999 seqed_restriction_enzymes.c
- - rw-r--r-- 621 seqed_restriction_enzymes.h
- - rw-r--r-- 3,930 seqed_search.c
- - rw-r--r-- 336 seqed_search.h
- - rw-r--r-- 2,477 seqed_search.tcl
- - rw-r--r-- 14,238 seqed_translate.c
- - rw-r--r-- 1,093 seqed_translate.h
- - rw-r--r-- 4,388 seqed_write.c
- - rw-r--r-- 374 seqed_write.h
- - rw-r--r-- 3,858 sequence_browser.tcl
- - rw-r--r-- 24,951 sequence_manager.tcl
- - rw-r--r-- 17,277 sequence_pair_display.c
- - rw-r--r-- 1,062 sequence_pair_display.h
- - rw-r--r-- 23,562 sequence_pair_display.tcl
- - rw-r--r-- 3,044 sequtils.c
- - rw-r--r-- 196 sequtils.h
- - rw-r--r-- 118 sequtils_cmds.h
- - rw-r--r-- 139 sequtils_structs.h
- - rw-r--r-- 2,899 set_alignment_symbols.tcl
- - rw-r--r-- 35,623 sim.c
- - rw-r--r-- 228 sim.h
- - rw-r--r-- 15,927 sip_align.c
- - rw-r--r-- 555 sip_align.h
- - rw-r--r-- 10,716 sip_align.tcl
- - rw-r--r-- 28,814 sip_cmds.c
- - rw-r--r-- 84 sip_cmds.h
- - rw-r--r-- 1,373 sip_config.tcl
- - rw-r--r-- 20,771 sip_find_identity.c
- - rw-r--r-- 629 sip_find_identity.h
- - rw-r--r-- 9,935 sip_find_identity.tcl
- - rw-r--r-- 1,601 sip_globals.c
- - rw-r--r-- 191 sip_globals.h
- - rw-r--r-- 34,666 sip_hash.c
- - rw-r--r-- 1,884 sip_hash.h
- - rw-r--r-- 3,088 sip_options.tcl
- - rw-r--r-- 19,203 sip_quick_scan.c
- - rw-r--r-- 554 sip_quick_scan.h
- - rw-r--r-- 10,710 sip_quick_scan.tcl
- - rw-r--r-- 11,633 sip_results.c
- - rw-r--r-- 2,232 sip_results.h
- - rw-r--r-- 112 sip_sendto.h
- - rw-r--r-- 10,190 sip_sendto.tcl
- - rw-r--r-- 19,792 sip_sim.c
- - rw-r--r-- 1,357 sip_sim.h
- - rw-r--r-- 13,198 sip_sim.tcl
- - rw-r--r-- 19,002 sip_similar_spans.c
- - rw-r--r-- 587 sip_similar_spans.h
- - rw-r--r-- 19,996 sip_similar_spans.tcl
- - rw-r--r-- 3,827 sip_structs.h
- - rw-r--r-- 8,170 siprc
- - rw-r--r-- 53 spin.bat
- - rwxr-xr-x 1,859 spin.in
- - rw-r--r-- 8,583 spin.tcl
- - rw-r--r-- 2,227 spin_globals.c
- - rw-r--r-- 371 spin_globals.h
- - rw-r--r-- 9,303 spinrc
- - rw-r--r-- 28,068 splice_search.c
- - rw-r--r-- 1,451 splice_search.h
- - rw-r--r-- 5,278 splice_search.tcl
- - rw-r--r-- 720 strand.tcl
- - rw-r--r-- 28,383 tclIndex
- - rw-r--r-- 15,781 tkSeqed.c
- - rw-r--r-- 2,573 tkSeqed.h
- - rw-r--r-- 3,805 tkSeqedNames.c
- - rw-r--r-- 359 tkSeqedNames.h
- - rw-r--r-- 28,389 tkSeqedUtils.c
- - rw-r--r-- 1,836 tkSeqedUtils.h
- - rw-r--r-- 23,547 trna_search.c
- - rw-r--r-- 1,154 trna_search.h
- - rw-r--r-- 3,589 trna_search.tcl