package info (click to toggle)
wham-align 0.1.5-8
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bookworm, bullseye, forky, sid, trixie
  • size: 892 kB
  • sloc: cpp: 8,769; sh: 76; makefile: 52

Folder: 0.1.5-8

show hidden (1)
d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 4,096 .pc
d d rwxr-xr-x 4,096 debian
d d rwxr-xr-x 10 indexes
d d rwxr-xr-x 84 reads
d d rwxr-xr-x 33 sequences
- - rw-r--r-- 35,147 COPYING
- - rw-r--r-- 8,172 MANUAL
- - rw-r--r-- 6 VERSION
- - rw-r--r-- 67,838 aligner.cpp
- - rw-r--r-- 5,617 aligner.h
- - rw-r--r-- 8,100 bitread.h
- - rw-r--r-- 7,899 builder.cpp
- - rw-r--r-- 8,918 edit_distance.cpp
- - rw-r--r-- 1,585 edit_distance.h
- - rw-r--r-- 19,350 embedhash.cpp
- - rw-r--r-- 2,966 embedhash.h
- - rw-r--r-- 1,185 error.cpp
- - rw-r--r-- 1,311 error.h
- - rw-r--r-- 56,258 hash.cpp
- - rw-r--r-- 9,462 hash.h
- - rw-r--r-- 4,614 hitset.cpp
- - rw-r--r-- 8,216 hitset.h
- - rw-r--r-- 9,228 interval.cpp
- - rw-r--r-- 2,585 interval.h
- - rw-r--r-- 1,163 lib.h
- - rw-r--r-- 21,415 main.cpp
- - rw-r--r-- 3,062 makefile
- - rw-r--r-- 6,339 model.cpp
- - rw-r--r-- 1,625 model.h
- - rw-r--r-- 30,027 pair.h
- - rw-r--r-- 2,020 perfcounters.cpp
- - rw-r--r-- 1,025 perfcounters.h
- - rw-r--r-- 1,173 rdtsc.h
- - rw-r--r-- 23,836 sequence.cpp
- - rw-r--r-- 3,311 sequence.h
- - rw-r--r-- 13,653 short.cpp
- - rw-r--r-- 3,833 short.h
- - rw-r--r-- 2,324 sorter.cpp
- - rw-r--r-- 4,313 unittest.cpp
- - rw-r--r-- 2,336 util.h
- - rw-r--r-- 19,019 writer.cpp
- - rw-r--r-- 5,536 writer.h