1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90
|
##fileformat=VCFv4.1
##contig=<ID=Pf3D7_01_v3,length=249250621>
##contig=<ID=Pf3D7_02_v3,length=249250621>
##contig=<ID=Pf3D7_03_v3,length=249250621>
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT AAA BBB
Pf3D7_01_v3 1 . A T . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 2 . A G . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 33 . T A . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 36 . A G . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 57 . C T . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 61 . A T . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 72 . T C,A . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 73 . T A . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 74 . A T,C . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 84 . C T . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 110 . T A . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 111 . T A . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 129 . T A . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 146 . A C,T . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 147 . A C,T . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 152 . G T . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 168 . T A . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 169 . A G . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 175 . A T . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 195 . T A . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 196 . A C . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 199 . T C . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 204 . C T . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 213 . G A . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 222 . A G . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 223 . A G . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 227 . T A . . . GT . .
Pf3D7_01_v3 235 . A G . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 1 . A T . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 2 . A G . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 33 . T A . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 36 . A G . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 57 . C T . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 61 . A T . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 72 . T C,A . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 73 . T A . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 74 . A T,C . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 90 . C T . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 100 . T A . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 111 . T A . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 129 . T A . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 146 . A C,T . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 147 . A C,T . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 152 . G T . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 168 . T A . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 169 . A G . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 175 . A T . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 195 . T A . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 196 . A C . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 199 . T C . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 204 . C T . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 213 . G A . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 222 . A G . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 223 . A G . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 227 . T A . . . GT . .
Pf3D7_02_v3 235 . A G . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 1 . A T . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 2 . A G . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 33 . T A . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 36 . A G . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 57 . C T . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 61 . A T . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 72 . T C,A . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 73 . T A . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 74 . A T,C . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 84 . C T . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 110 . T A . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 111 . T A . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 129 . T A . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 146 . A C,T . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 147 . A C,T . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 152 . G T . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 168 . T A . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 169 . A G . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 175 . A T . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 195 . T A . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 196 . A C . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 199 . T C . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 204 . C T . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 213 . G A . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 222 . A G . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 223 . A G . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 227 . T A . . . GT . .
Pf3D7_03_v3 235 . A G . . . GT . .
|