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crac 2.5.2%2Bdfsg-4
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bullseye
  • size: 6,960 kB
  • sloc: cpp: 41,838; sh: 391; makefile: 370

Folder: libSSA

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 4,096 karkkainen_bwt
d d rwxr-xr-x 4,096 seqan
- - rw-r--r-- 8,640 GenomeInfo.cpp
- - rw-r--r-- 8,269 GenomeInfo.h
- - rw-r--r-- 10,893 HuffAlphabetRank.cpp
- - rw-r--r-- 5,035 HuffAlphabetRank.h
- - rw-r--r-- 6,081 Huffman_Codes.cpp
- - rw-r--r-- 7,302 Huffman_Codes.h
- - rw-r--r-- 13,532 Makefile.am
- - rw-r--r-- 37,299 Makefile.in
- - rw-r--r-- 21,647 SSA.cpp
- - rw-r--r-- 7,416 SSA.h
- - rw-r--r-- 8,115 basic.h
- - rw-r--r-- 13,359 bitarray.cpp
- - rw-r--r-- 5,604 bitarray.h
- - rw-r--r-- 10,090 bitrankw32int.cpp
- - rw-r--r-- 5,259 bitrankw32int.h
- - rw-r--r-- 5,594 chrPosition.cpp
- - rw-r--r-- 5,070 chrPosition.h
- - rw-r--r-- 13,634 cracIndex.cpp
- - rw-r--r-- 5,142 cracIndex.h
- - rw-r--r-- 15,386 locateOnGenome.cpp
- - rw-r--r-- 7,907 locateOnGenome.h
- - rw-r--r-- 14,294 locateTags.cpp
- - rw-r--r-- 7,484 locateTags.h
- - rw-r--r-- 4,400 utils.cpp
- - rw-r--r-- 4,158 utils.h