package info (click to toggle)
kmc 3.1.1%2Bdfsg-3
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bullseye
  • size: 2,376 kB
  • sloc: cpp: 33,006; python: 372; perl: 178; makefile: 135; sh: 34

Folder: kmer_counter

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 831 bam_utils.h
- - rw-r--r-- 9,862 binary_reader.h
- - rw-r--r-- 8,672 bkb_merger.h
- - rw-r--r-- 3,038 bkb_reader.cpp
- - rw-r--r-- 1,417 bkb_reader.h
- - rw-r--r-- 14,080 bkb_sorter.h
- - rw-r--r-- 4,387 bkb_subbin.h
- - rw-r--r-- 16,031 bkb_uncompactor.h
- - rw-r--r-- 4,006 bkb_writer.cpp
- - rw-r--r-- 1,455 bkb_writer.h
- - rw-r--r-- 3,967 cpu_info.cpp
- - rw-r--r-- 654 cpu_info.h
- - rw-r--r-- 3,109 defs.h
- - rw-r--r-- 4,146 develop.cpp
- - rw-r--r-- 433 develop.h
- - rw-r--r-- 30,938 fastq_reader.cpp
- - rw-r--r-- 5,737 fastq_reader.h
- - rw-r--r-- 13,409 first_dispatch.h
- - rw-r--r-- 2,095 intr_copy.h
- - rw-r--r-- 2,727 kb_collector.cpp
- - rw-r--r-- 2,738 kb_collector.h
- - rw-r--r-- 9,618 kb_completer.cpp
- - rw-r--r-- 8,484 kb_completer.h
- - rw-r--r-- 7,331 kb_reader.h
- - rw-r--r-- 31,686 kb_sorter.h
- - rw-r--r-- 6,384 kb_storer.cpp
- - rw-r--r-- 2,147 kb_storer.h
- - rw-r--r-- 46,369 kmc.h
- - rw-r--r-- 366 kmer.cpp
- - rw-r--r-- 15,863 kmer.h
- - rw-r--r-- 15,736 kmer_counter.cpp
- - rw-r--r-- 14,078 kmer_counter.vcxproj
- - rw-r--r-- 6,293 kmer_counter.vcxproj.filters
- - rw-r--r-- 16,191 kxmer_set.h
- - rw-r--r-- 2,298 mem_disk_file.cpp
- - rw-r--r-- 1,127 mem_disk_file.h
- - rw-r--r-- 884 meta_oper.h
- - rw-r--r-- 1,026 mmer.cpp
- - rw-r--r-- 4,901 mmer.h
- - rw-r--r-- 6,070 params.h
- - rw-r--r-- 1,125 percent_progress.h
- - rw-r--r-- 56,353 queues.h
- - rw-r--r-- 26,353 radix.h
- - rw-r--r-- 1,212 raduls.h
- - rw-r--r-- 321 raduls_avx.cpp
- - rw-r--r-- 321 raduls_avx2.cpp
- - rw-r--r-- 24,567 raduls_impl.h
- - rw-r--r-- 321 raduls_sse2.cpp
- - rw-r--r-- 321 raduls_sse41.cpp
- - rw-r--r-- 379 rev_byte.cpp
- - rw-r--r-- 591 rev_byte.h
- - rw-r--r-- 3,657 s_mapper.h
- - rw-r--r-- 601 small_k_buf.h
- - rw-r--r-- 13,928 small_sort.h
- - rw-r--r-- 24,022 splitter.cpp
- - rw-r--r-- 4,719 splitter.h
- - rw-r--r-- 291 stdafx.cpp
- - rw-r--r-- 324 stdafx.h
- - rw-r--r-- 306 targetver.h
- - rw-r--r-- 4,350 timer.cpp
- - rw-r--r-- 1,557 timer.h