package info (click to toggle)
mafft 6.864-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: wheezy
  • size: 2,400 kB
  • sloc: ansic: 51,638; sh: 2,205; makefile: 387; ruby: 372

Folder: core

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 8,094 DNA.h
- - rw-r--r-- 60,538 Falign.c
- - rw-r--r-- 21,648 Falign_localhom.c
- - rw-r--r-- 14,240 Galign11.c
- - rw-r--r-- 38,753 Halignmm.c
- - rw-r--r-- 8,491 JTT.c
- - rw-r--r-- 10,821 Lalign11.c
- - rw-r--r-- 17,337 Lalign11.c.fast
- - rw-r--r-- 9,982 Lalign11.c_nostatic
- - rw-r--r-- 58,520 Lalignmm.c
- - rw-r--r-- 13,311 MSalign11.c
- - rw-r--r-- 39,969 MSalignmm.c
- - rw-r--r-- 28,097 MSalignmm.c.algAa
- - rw-r--r-- 31,798 MSalignmm.c.algLargeA
- - rw-r--r-- 31,792 MSalignmm.c.alga
- - rw-r--r-- 27,787 MSalignmm.c.algsmalla
- - rw-r--r-- 19,980 MSalignmm.c.back
- - rw-r--r-- 30,929 MSalignmm.c.bkbk
- - rw-r--r-- 32,250 MSalignmm.c.bug
- - rw-r--r-- 25,432 MSalignmm.c.work
- - rw-r--r-- 17,778 Makefile
- - rw-r--r-- 55,347 Qalignmm.c
- - rw-r--r-- 33,723 Ralignmm.c
- - rw-r--r-- 8,225 SAalignmm.c
- - rw-r--r-- 42,335 Salignmm.c
- - rw-r--r-- 9,491 addfunctions.c
- - rw-r--r-- 13,086 blosum.c
- - rw-r--r-- 256 blosum.h
- - rw-r--r-- 29,553 constants.c
- - rw-r--r-- 7,784 contrafoldwrap.c
- - rw-r--r-- 1,061 countlen.c
- - rw-r--r-- 1,952 defs.c
- - rw-r--r-- 44,465 disttbfast.c
- - rw-r--r-- 8,865 dndblast.c
- - rw-r--r-- 5,232 dndfast4.c
- - rw-r--r-- 7,328 dndfast7.c
- - rw-r--r-- 5,311 dndpre.c
- - rw-r--r-- 3,639 dndpre2.c
- - rw-r--r-- 944 dndpre_score.c
- - rw-r--r-- 185 dp.h
- - rw-r--r-- 15,202 dvtditr.c
- - rw-r--r-- 4,908 f2cl.c
- - rw-r--r-- 3,796 fft.c
- - rw-r--r-- 287 fft.h
- - rw-r--r-- 16,425 fftFunctions.c
- - rw-r--r-- 29,123 functions.h
- - rw-r--r-- 9,364 genGalign11.c
- - rw-r--r-- 13,241 genalign11.c
- - rw-r--r-- 11,108 getlag.c
- - rw-r--r-- 104,249 io.c
- - rw-r--r-- 9,324 iteration.c
- - rw-r--r-- 8,331 mafft-distance.c
- - rw-r--r-- 4,550 mafft-homologs.1
- - rw-r--r-- 8,252 mafft-homologs.tmpl
- - rw-r--r-- 12,396 mafft-profile.c
- - rw-r--r-- 14,771 mafft.1
- - rwxr-xr-x 292 mafft.bat
- - rw-r--r-- 54,147 mafft.tmpl
- - rw-r--r-- 23,994 mafft.tmpl.subopt
- - rw-r--r-- 9,981 mccaskillwrap.c
- - rwxr-xr-x 398 mingw64mingw32
- - rw-r--r-- 711 miyata.h
- - rw-r--r-- 4,635 miyata5.h
- - rw-r--r-- 6,522 mltaln.h
- - rw-r--r-- 159,586 mltaln9.c
- - rw-r--r-- 9,207 mtxutl.c
- - rw-r--r-- 1,218 mtxutl.h
- - rw-r--r-- 8,600 multi2hat3s.c
- - rwxr-xr-x 2,485 newick2mafft.rb
- - rw-r--r-- 4,969 nj.c
- - rw-r--r-- 10,438 pair2hat3s.c
- - rw-r--r-- 30,021 pairash.c
- - rw-r--r-- 21,849 pairlara.c
- - rw-r--r-- 35,995 pairlocalalign.c
- - rw-r--r-- 30,833 partQalignmm.c
- - rw-r--r-- 28,882 partSalignmm.c
- - rw-r--r-- 4,569 regtable2seq.c
- - rw-r--r-- 2,621 replaceu.c
- - rw-r--r-- 4,782 restoreu.c
- - rw-r--r-- 15,448 rna.c
- - rw-r--r-- 10,064 rnatest.c
- - rw-r--r-- 2,266 score.c
- - rw-r--r-- 1,553 seq2regtable.c
- - rw-r--r-- 10,496 setcore.c
- - rw-r--r-- 6,038 sextet5.c
- - rw-r--r-- 323 share.h
- - rw-r--r-- 83,927 splittbfast.c
- - rw-r--r-- 14,084 suboptalign11.c
- - rw-r--r-- 50,340 tbfast.c
- - rw-r--r-- 19,154 tddis.c
- - rw-r--r-- 76,437 tditeration.c
- - rw-r--r-- 194 test.c
- - rw-r--r-- 16,525 treeOperation.c
- - rw-r--r-- 1,108 univscript.tmpl
- - rw-r--r-- 65 version.c