package info
(click to toggle)
Folder: data
| .. (parent) | ||||
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | Amber | |
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | analysis | |
| d | rwxr-xr-x | 123 | capping | |
| d | rwxr-xr-x | 130 | contacts | |
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | coordinates | |
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | dlpoly | |
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | dssp | |
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | gms | |
| d | rwxr-xr-x | 63 | gromacs | |
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | gromos11 | |
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | lammps | |
| d | rwxr-xr-x | 47 | merge | |
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | mol2 | |
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | tprs | |
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | windows | |
| - | rw-r--r-- | 10,397 | 173D.mmtf | |
| - | rw-r--r-- | 200,523 | 19hc.pdb.gz | |
| - | rw-r--r-- | 401,997 | 1A2C.pqr | |
| - | rw-r--r-- | 92,868 | 1a28.pdb.gz | |
| - | rw-r--r-- | 176,587 | 1a2c_ins_code.psf | |
| - | rw-r--r-- | 24,157 | 1grm_elNemo_mode7.pdb.bz2 | |
| - | rw-r--r-- | 29,437 | 1grm_single.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 190,188 | 1hvr.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 30,247 | 1osm.pdb.gz | |
| - | rw-r--r-- | 10,417 | 1ubq-less-optional.mmtf | |
| - | rw-r--r-- | 269,270 | 2r9r-1b.psf | |
| - | rw-r--r-- | 346,848 | 2r9r-1b.xyz | |
| - | rw-r--r-- | 85,598 | 2r9r-1b.xyz.bz2 | |
| - | rw-r--r-- | 4,188 | 3NJW-onlyrequired.mmtf | |
| - | rw-r--r-- | 198,045 | 4E43.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 5,885 | 4x8u.pdbx | |
| - | rw-r--r-- | 8,042 | 5KIH.mmtf.gz | |
| - | rw-r--r-- | 60,264 | 5a7u.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 650 | 5digitResid.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 6,685 | 6QYR.mmtf.gz | |
| - | rw-r--r-- | 147,966 | 6msm.pdb.bz2 | |
| - | rw-r--r-- | 10,944 | A6PA6_alpha.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 7,827 | C12x64.xml.bz2 | |
| - | rw-r--r-- | 428 | CONECT2TER.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 8,063 | RANDOM_WALK_TOPO.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 402 | SINGLECONECT.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 66,896 | SiN_tric_namd.dcd | |
| - | rw-r--r-- | 715,854 | SiN_tric_namd.psf | |
| - | rw-r--r-- | 1 | __init__.py | |
| - | rw-r--r-- | 931,992 | adk.psf | |
| - | rw-r--r-- | 348,160 | adk_closed.dms | |
| - | rw-r--r-- | 257,381 | adk_closed.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 801,529 | adk_closed_NAMD.psf | |
| - | rw-r--r-- | 348,160 | adk_closed_domains.dms | |
| - | rw-r--r-- | 348,160 | adk_closed_no_segid.dms | |
| - | rw-r--r-- | 3,931,724 | adk_dims.dcd | |
| - | rw-r--r-- | 4,097,820 | adk_dims2.dcd | |
| - | rw-r--r-- | 4,011,876 | adk_gbis_tmd-fast1_NAMD.dcd | |
| - | rw-r--r-- | 330,971 | adk_notop.psf | |
| - | rw-r--r-- | 329,584 | adk_notop_BAD.psf | |
| - | rw-r--r-- | 80,188 | adk_open.coor | |
| - | rw-r--r-- | 237,319 | adk_open.crd | |
| - | rw-r--r-- | 257,454 | adk_open.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 244,235 | adk_open.pqr | |
| - | rw-r--r-- | 12,286 | adk_open_10res.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 2,145,787 | adk_oplsaa.gro | |
| - | rw-r--r-- | 3,194,814 | adk_oplsaa.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 2,096,316 | adk_oplsaa.tpr | |
| - | rw-r--r-- | 11,444,640 | adk_oplsaa.trr | |
| - | rw-r--r-- | 1,651,716 | adk_oplsaa.xtc | |
| - | rw-r--r-- | 1,792 | adk_oplsaa_CA_rmsf.npy | |
| - | rw-r--r-- | 3,168 | adk_oplsaa_GLY_rama.npy | |
| - | rw-r--r-- | 3,008 | adk_oplsaa_LYS_janin.npy | |
| - | rw-r--r-- | 208 | adk_oplsaa_dihedral.npy | |
| - | rw-r--r-- | 288 | adk_oplsaa_dihedral_list.npy | |
| - | rw-r--r-- | 20,768 | adk_oplsaa_janin.npy | |
| - | rw-r--r-- | 34,048 | adk_oplsaa_rama.npy | |
| - | rw-r--r-- | 314 | align.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 21,051 | argon_npt_compressed.gro.gz | |
| - | rw-r--r-- | 403,693 | argon_npt_compressed.tng | |
| - | rw-r--r-- | 160,023 | argon_npt_compressed_uneven.tng | |
| - | rw-r--r-- | 783,195 | argon_npt_compressed_vels_forces.tng | |
| - | rw-r--r-- | 963 | atomtypes.itp | |
| - | rw-r--r-- | 1,451 | atomtypes_charge.itp | |
| - | rw-r--r-- | 1,301,332 | aux_edr.tpr | |
| - | rw-r--r-- | 496,328 | aux_edr.xtc | |
| - | rw-r--r-- | 6,414 | aux_edr_raw.txt | |
| - | rw-r--r-- | 73 | bad_num_col.xvg | |
| - | rw-r--r-- | 71 | bad_top.top | |
| - | rw-r--r-- | 1,135,984 | bigbox.gro.bz2 | |
| - | rw-r--r-- | 708 | chainIDnewres.pdb.gz | |
| - | rw-r--r-- | 753 | chainIDrepeat.pdb.gz | |
| - | rw-r--r-- | 2,978 | charges.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 2,181,532 | cobrotoxin.h5md | |
| - | rw-r--r-- | 1,531,635 | cobrotoxin.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 699,696 | cobrotoxin.tpr | |
| - | rw-r--r-- | 2,093,940 | cobrotoxin.trr | |
| - | rw-r--r-- | 197,736 | cobrotoxin.xtc | |
| - | rw-r--r-- | 697,608 | cobrotoxin_2024_4.tpr | |
| - | rw-r--r-- | 76,069 | cobrotoxin_dry_neutral_0.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 46,164 | cobrotoxin_protein_forces.xvg.bz2 | |
| - | rw-r--r-- | 757 | conect_error.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 946 | conect_parsing.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 1,284 | cryst_then_model.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 10,240 | cryst_then_model.pdb.bz2 | |
| - | rw-r--r-- | 10,240 | cryst_then_model.pdb.gz | |
| - | rw-r--r-- | 300,528 | cu.h5md | |
| - | rw-r--r-- | 302,584 | cu_malformed.h5md | |
| - | rw-r--r-- | 60,623 | dppc_vesicle_hg.gro | |
| - | rw-r--r-- | 16,432 | edited_itp.itp | |
| - | rw-r--r-- | 2,354 | elements.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 0 | empty.dcd | |
| - | rw-r--r-- | 77 | empty_atom.gro | |
| - | rw-r--r-- | 362,541 | example.gsd | |
| - | rw-r--r-- | 56,612 | example_bonds.gsd | |
| - | rw-r--r-- | 1,879,072 | example_longer.gsd | |
| - | rw-r--r-- | 563 | fhiaims.in | |
| - | rw-r--r-- | 116 | five.xyz | |
| - | rw-r--r-- | 1,074 | fullerene.pdb.gz | |
| - | rw-r--r-- | 16,370 | gromacs_ala10.itp | |
| - | rw-r--r-- | 1,040 | gromacs_ala10.top | |
| - | rw-r--r-- | 309 | grovels.gro | |
| - | rw-r--r-- | 12,184 | helanal_bending_matrix_AdK_DIMS_H8.dat | |
| - | rw-r--r-- | 10,456 | helanal_bending_matrix_AdK_DIMS_H8_frames10to79.dat | |
| - | rw-r--r-- | 100 | huge_box.gro | |
| - | rw-r--r-- | 509 | incomplete.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 17,936 | itp_nomass.itp | |
| - | rw-r--r-- | 66,620 | legacy_DCD_NAMD_coords.npy | |
| - | rw-r--r-- | 80,264 | legacy_DCD_adk_coords.npy | |
| - | rw-r--r-- | 9,080 | legacy_DCD_c36_coords.npy | |
| - | rw-r--r-- | 461 | make_whole.gro | |
| - | rw-r--r-- | 347,816 | martini_dppc_chol_bilayer.gro | |
| - | rw-r--r-- | 74 | mini.xyz | |
| - | rw-r--r-- | 126 | missing_atomname.gro | |
| - | rw-r--r-- | 1,284 | model_then_cryst.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 10,240 | model_then_cryst.pdb.bz2 | |
| - | rw-r--r-- | 10,240 | model_then_cryst.pdb.gz | |
| - | rw-r--r-- | 560 | mol2_comments_header_bat.npy | |
| - | rw-r--r-- | 4,754 | molecule.sdf | |
| - | rw-r--r-- | 10,345 | namd_cgenff.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 29,592 | namd_cgenff.psf | |
| - | rw-r--r-- | 790,398 | nmr_neopetrosiamide.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 875 | no_endif_spc.itp | |
| - | rw-r--r-- | 9,648 | nosegid.psf | |
| - | rw-r--r-- | 2,676 | nucl_res.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 9,205 | parmed_ala3.psf | |
| - | rw-r--r-- | 144,456 | pdbqt_inputpdbqt.pdbqt | |
| - | rw-r--r-- | 7,156 | pdbqt_querypdb.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 826,259 | plength.gro | |
| - | rw-r--r-- | 5,795 | residwrap.gro | |
| - | rw-r--r-- | 5,795 | residwrap_0base.gro | |
| - | rw-r--r-- | 176 | sameresid_diffresname.gro | |
| - | rw-r--r-- | 161 | sameresid_diffresname.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 474 | sample_velocity_file.gro | |
| - | rw-r--r-- | 1,512 | single_frame.edr | |
| - | rw-r--r-- | 1,258 | spce.itp | |
| - | rw-r--r-- | 668 | surface.pdb.bz2 | |
| - | rw-r--r-- | 1,320 | surface.trr | |
| - | rw-r--r-- | 2,340 | test.edr | |
| - | rw-r--r-- | 1,505 | test.fasta | |
| - | rw-r--r-- | 245 | test.xvg | |
| - | rw-r--r-- | 728 | testENT.ent | |
| - | rw-r--r-- | 74 | test_highf.xvg | |
| - | rw-r--r-- | 65 | test_lowf.xvg | |
| - | rw-r--r-- | 46,396 | tip125_tric_C36.dcd | |
| - | rw-r--r-- | 56,220 | tip125_tric_C36.psf | |
| - | rw-r--r-- | 2,297 | tip5p.itp | |
| - | rw-r--r-- | 4,800 | trr_test_only_10_frame_10_atoms.trr | |
| - | rw-r--r-- | 574,426 | trz_psf.psf | |
| - | rw-r--r-- | 1,180,276 | trzfile.trz | |
| - | rw-r--r-- | 326 | two_water_gro.gro | |
| - | rw-r--r-- | 648 | two_water_gro_multiframe.gro | |
| - | rw-r--r-- | 326 | two_water_gro_nonames.gro | |
| - | rw-r--r-- | 369 | two_water_gro_widebox.gro | |
| - | rw-r--r-- | 590 | tyrosol.pdbqt.bz2 | |
| - | rw-r--r-- | 45,658 | unordered_res.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 721 | varying_occ_tmp.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 2,876 | watdyn.dcd | |
| - | rw-r--r-- | 1,973 | watdyn.psf | |
| - | rw-r--r-- | 3,022 | water_methane_acetic-acid_ammonia.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 475 | xl_serial.pdb | |
| - | rw-r--r-- | 1,040 | xtc_test_only_10_frame_10_atoms.xtc | |
| - | rw-r--r-- | 57,380 | xyz_random_walk.xtc |
