1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
|
MEME version 4
ALPHABET= ACGT
strands: + -
Background letter frequencies
A 0.303 C 0.183 G 0.209 T 0.306
MOTIF KRP
letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 17 E= 4.1e-009
0.000000 0.176471 0.000000 0.823529
0.000000 0.058824 0.647059 0.294118
0.000000 0.058824 0.000000 0.941176
0.176471 0.000000 0.764706 0.058824
0.823529 0.058824 0.000000 0.117647
0.294118 0.176471 0.176471 0.352941
0.294118 0.352941 0.235294 0.117647
0.117647 0.235294 0.352941 0.294118
0.529412 0.000000 0.176471 0.294118
0.058824 0.235294 0.588235 0.117647
0.176471 0.235294 0.294118 0.294118
0.000000 0.058824 0.117647 0.823529
0.058824 0.882353 0.000000 0.058824
0.764706 0.000000 0.176471 0.058824
0.058824 0.882353 0.000000 0.058824
0.823529 0.058824 0.058824 0.058824
0.176471 0.411765 0.058824 0.352941
0.411765 0.000000 0.000000 0.588235
0.352941 0.058824 0.000000 0.588235
MOTIF IFXA
letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 14 E= 3.2e-035
0.214286 0.000000 0.000000 0.785714
0.857143 0.000000 0.071429 0.071429
0.000000 1.000000 0.000000 0.000000
0.000000 0.000000 0.000000 1.000000
0.000000 0.000000 1.000000 0.000000
0.000000 0.000000 0.000000 1.000000
0.857143 0.000000 0.071429 0.071429
0.000000 0.071429 0.000000 0.928571
0.857143 0.000000 0.071429 0.071429
0.142857 0.000000 0.000000 0.857143
0.571429 0.071429 0.214286 0.142857
0.285714 0.285714 0.000000 0.428571
1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
0.285714 0.214286 0.000000 0.500000
0.428571 0.500000 0.000000 0.071429
0.000000 1.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
0.000000 0.000000 0.785714 0.214286
MOTIF IFXA_no_nsites_no_evalue
letter-probability matrix:
0.214286 0.000000 0.000000 0.785714
0.857143 0.000000 0.071429 0.071429
0.000000 1.000000 0.000000 0.000000
0.000000 0.000000 0.000000 1.000000
0.000000 0.000000 1.000000 0.000000
0.000000 0.000000 0.000000 1.000000
0.857143 0.000000 0.071429 0.071429
0.000000 0.071429 0.000000 0.928571
0.857143 0.000000 0.071429 0.071429
0.142857 0.000000 0.000000 0.857143
0.571429 0.071429 0.214286 0.142857
0.285714 0.285714 0.000000 0.428571
1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
0.285714 0.214286 0.000000 0.500000
0.428571 0.500000 0.000000 0.071429
0.000000 1.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
0.000000 0.000000 0.785714 0.214286
|
