File: master_gtf.mat

package info (click to toggle)
python-deeptools 3.5.0-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bullseye
  • size: 34,624 kB
  • sloc: python: 14,765; xml: 4,090; sh: 38; makefile: 11
file content (3 lines) | stat: -rw-r--r-- 3,432 bytes parent folder | download | duplicates (3)
1
2
3
@{"verbose":false,"scale":1,"skip zeros":false,"nan after end":false,"sort using":"mean","unscaled 5 prime":[20],"body":[1000],"sample_labels":["test1.bw"],"downstream":[300],"unscaled 3 prime":[50],"group_labels":["genes"],"bin size":[10],"upstream":[500],"group_boundaries":[0,2],"sample_boundaries":[0,187],"missing data as zero":false,"ref point":[null],"min threshold":null,"sort regions":"keep","proc number":1,"bin avg type":"mean","max threshold":null}
3R	0	1000	first	.	+	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	4.000000	4.000000	5.644444	7.700000	7.700000	8.610000	9.000000	9.000000	12.000000	12.000000	12.833333	14.500000	14.500000	15.366667	15.800000	15.800000	21.700001	21.700001	24.550001	31.200001	31.200001	31.920001	32.400002	32.400002	32.400002	32.400002	33.044445	35.299999	35.299999	35.355556	35.400002	35.400002	35.311111	35.299999	35.233333	34.700001	34.700001	32.655556	30.100000	30.100000	25.900001	24.700001	24.711112	24.799999	24.799999	25.920000	27.600000	27.600000	28.790000	29.299999	29.299999	28.000000	28.000000	27.866667	27.600000	27.600000	28.333334	28.700001	28.700001	29.200001	29.200001	29.050001	28.700001	28.700001	29.977778	31.000000	31.000000	27.800000	27.400000	26.422222	23.000000	23.000000	22.222222	21.600000	21.600000	25.200000	26.100000	27.544445	39.099998	39.099998	40.211110	41.599998	41.599998	40.900000	40.700001	40.130001	35.000000	35.000000	34.920000	34.799999	34.799999	35.920001	36.400002	36.400002	42.200001	42.200001	40.800001	38.000000	38.000000	29.066667	24.600000	24.600000	20.400000	20.400000	18.700000	17.000000	17.000000	16.700001	16.700001	15.450000	14.200000	14.200000	11.000000	11.000000	7.850000	4.700000	4.700000	2.500000	2.500000	1.350000	0.200000	0.200000	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan
3R	99	1100	second	.	-	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	0.200000	0.200000	1.350000	2.500000	2.500000	4.700000	4.700000	7.850000	11.000000	11.000000	13.560000	14.200000	14.477778	16.700001	16.700001	16.833334	17.000000	17.000000	19.644444	20.400000	20.866666	24.600000	24.600000	29.960000	38.000000	38.000000	40.940001	42.200001	42.200001	36.400002	36.400002	35.866667	34.799999	34.799999	34.933333	35.000000	35.000000	40.700001	40.700001	40.970000	41.599998	41.599998	40.099998	39.099998	39.099998	27.400000	26.100000	25.100000	21.600000	21.600000	22.377778	23.000000	23.000000	26.911111	27.400000	28.120000	31.000000	31.000000	29.850000	28.700001	28.700001	29.100001	29.200001	29.144445	28.700001	28.700001	28.211112	27.600000	27.600000	27.911111	28.000000	28.130000	29.299999	29.299999	28.620000	27.600000	27.600000	25.640000	24.799999	24.799999	24.700001	24.700001	26.500001	30.100000	30.100000	33.166667	34.700001	34.700001	35.299999	35.299999	35.330000	35.400002	35.400002	35.344445	35.299999	35.299999	32.722223	32.400002	32.400002	32.400002	32.400002	31.733334	31.200001	31.200001	22.755556	21.700001	21.044445	15.800000	15.800000	15.020000	14.500000	14.250000	12.000000	12.000000	10.200000	9.000000	8.870000	7.700000	7.700000	5.480000	4.000000	4.000000	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan	nan