1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32
|
import pysam.utils
annotate = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'annotate')
call = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'call')
cnv = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'cnv')
concat = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'concat')
consensus = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'consensus')
convert = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'convert')
csq = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'csq')
filter = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'filter')
gtcheck = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'gtcheck')
head = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'head')
index = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'index')
isec = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'isec')
merge = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'merge')
mpileup = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'mpileup')
norm = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'norm')
plugin = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'plugin')
query = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'query')
reheader = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'reheader')
roh = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'roh')
sort = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'sort')
stats = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'stats')
view = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'view')
__all__ = [
'annotate', 'call', 'cnv', 'concat', 'consensus',
'convert', 'csq', 'filter', 'gtcheck', 'head',
'index', 'isec', 'merge', 'mpileup', 'norm',
'plugin', 'query', 'reheader', 'roh', 'sort',
'stats', 'view',
]
|