 |
|
|
|
.. (parent) |
 |
- |
rw-r--r-- |
12,617 |
AllClasses.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,892 |
AllGenerics.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,439 |
AllUtilities.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,395 |
methods-CollapsedVCF-class.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,770 |
methods-ExpandedVCF-class.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,066 |
methods-PROVEANDb.class.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,421 |
methods-PolyPhenDb-class.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,925 |
methods-SIFTDb-class.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,420 |
methods-ScanVcfParam-class.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,320 |
methods-VCF-class.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,419 |
methods-VCFHeader-class.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
20,468 |
methods-VRanges-class.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
504 |
methods-VRangesList-class.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,159 |
methods-VariantType-class.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,933 |
methods-expand.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,854 |
methods-filterVcf.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,536 |
methods-genotypeToSnpMatrix.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,758 |
methods-getTranscriptSeqs.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,073 |
methods-locateVariants.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,677 |
methods-predictCoding.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,184 |
methods-readVcf.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,871 |
methods-readVcfLongForm.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,411 |
methods-refLocsToLocalLocs.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,716 |
methods-scanVcf.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
306 |
methods-scanVcfHeader.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,020 |
methods-snpSummary.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,979 |
methods-summarizeVariants.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,960 |
methods-writeVcf.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
68 |
test_VariantAnnotation_package.R
|