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seqan2 2.3.1%2Bdfsg-4
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  • area: main
  • in suites: stretch
  • size: 222,320 kB
  • ctags: 40,872
  • sloc: cpp: 252,894; ansic: 86,805; python: 6,534; sh: 985; xml: 570; makefile: 236; awk: 51

Folder: mason2

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 4,096 example
d d rwxr-xr-x 4,096 tests
- - rw-r--r-- 6,681 CMakeLists.txt
- - rw-r--r-- 1,556 LICENSE
- - rw-r--r-- 3,699 README
- - rw-r--r-- 4,042 README.mason_frag_sequencing
- - rw-r--r-- 2,409 README.mason_genome
- - rw-r--r-- 3,534 README.mason_materializer
- - rw-r--r-- 4,396 README.mason_methylation
- - rw-r--r-- 5,376 README.mason_simulator
- - rw-r--r-- 3,661 README.mason_splicing
- - rw-r--r-- 8,287 README.mason_variator
- - rw-r--r-- 957 TODO
- - rw-r--r-- 982 breakpoint_contigs.awk
- - rw-r--r-- 8,356 external_split_merge.cpp
- - rw-r--r-- 13,034 external_split_merge.h
- - rw-r--r-- 15,019 fragment_generation.h
- - rw-r--r-- 45,375 genomic_variants.cpp
- - rw-r--r-- 21,528 genomic_variants.h
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- - rw-r--r-- 10,440 mason_materializer.cpp
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- - rw-r--r-- 88,972 mason_variator.cpp
- - rw-r--r-- 5,528 methylation_levels.cpp
- - rw-r--r-- 11,583 methylation_levels.h
- - rw-r--r-- 4,267 omp_wrapper.h
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- - rw-r--r-- 15,939 simulate_454.cpp
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- - rw-r--r-- 3,963 simulate_genome.h
- - rw-r--r-- 18,252 simulate_illumina.cpp
- - rw-r--r-- 11,426 simulate_sanger.cpp
- - rw-r--r-- 5,417 variation_size_tsv.h
- - rw-r--r-- 24,002 vcf_materialization.cpp
- - rw-r--r-- 7,946 vcf_materialization.h