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.. (parent) |
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- |
rw-r--r-- |
23,550 |
align_base.h
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- |
rw-r--r-- |
13,682 |
align_cols.h
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- |
rw-r--r-- |
14,554 |
align_config.h
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- |
rw-r--r-- |
8,976 |
align_interface_wrapper.h
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- |
rw-r--r-- |
17,285 |
align_iterator_base.h
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- |
rw-r--r-- |
4,648 |
align_metafunctions.h
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- |
rw-r--r-- |
5,964 |
align_traceback.h
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- |
rw-r--r-- |
3,109 |
aligned_sequence_concept.h
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- |
rw-r--r-- |
6,071 |
alignment_algorithm_tags.h
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- |
rw-r--r-- |
6,881 |
alignment_operations.h
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- |
rw-r--r-- |
73,747 |
dp_algorithm_impl.h
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- |
rw-r--r-- |
20,774 |
dp_align_simd_helper.h
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- |
rw-r--r-- |
12,788 |
dp_band.h
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- |
rw-r--r-- |
14,802 |
dp_cell.h
|
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- |
rw-r--r-- |
9,655 |
dp_cell_affine.h
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- |
rw-r--r-- |
9,036 |
dp_cell_dynamic.h
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- |
rw-r--r-- |
4,867 |
dp_cell_linear.h
|
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- |
rw-r--r-- |
5,965 |
dp_context.h
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- |
rw-r--r-- |
13,329 |
dp_formula.h
|
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- |
rw-r--r-- |
17,940 |
dp_formula_affine.h
|
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- |
rw-r--r-- |
36,370 |
dp_formula_dynamic.h
|
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- |
rw-r--r-- |
13,737 |
dp_formula_linear.h
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- |
rw-r--r-- |
24,109 |
dp_matrix.h
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- |
rw-r--r-- |
12,113 |
dp_matrix_navigator.h
|
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- |
rw-r--r-- |
18,963 |
dp_matrix_navigator_score_matrix.h
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- |
rw-r--r-- |
11,878 |
dp_matrix_navigator_score_matrix_sparse.h
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- |
rw-r--r-- |
28,961 |
dp_matrix_navigator_trace_matrix.h
|
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- |
rw-r--r-- |
6,030 |
dp_matrix_sparse.h
|
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- |
rw-r--r-- |
23,642 |
dp_meta_info.h
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- |
rw-r--r-- |
30,335 |
dp_profile.h
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- |
rw-r--r-- |
13,403 |
dp_scout.h
|
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- |
rw-r--r-- |
38,227 |
dp_scout_simd.h
|
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- |
rw-r--r-- |
16,107 |
dp_setup.h
|
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- |
rw-r--r-- |
14,352 |
dp_trace_segment.h
|
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- |
rw-r--r-- |
14,386 |
dp_traceback_adaptor.h
|
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- |
rw-r--r-- |
31,004 |
dp_traceback_impl.h
|
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- |
rw-r--r-- |
12,332 |
evaluate_alignment.h
|
|
- |
rw-r--r-- |
19,675 |
fragment.h
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- |
rw-r--r-- |
12,789 |
gap_anchor.h
|
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- |
rw-r--r-- |
3,845 |
gapped_value_type.h
|
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- |
rw-r--r-- |
36,463 |
gaps_anchor.h
|
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- |
rw-r--r-- |
32,469 |
gaps_array.h
|
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- |
rw-r--r-- |
44,171 |
gaps_base.h
|
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- |
rw-r--r-- |
29,645 |
gaps_iterator_anchor.h
|
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- |
rw-r--r-- |
28,501 |
gaps_iterator_array.h
|
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- |
rw-r--r-- |
17,591 |
gaps_iterator_base.h
|
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- |
rw-r--r-- |
41,093 |
global_alignment_banded.h
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- |
rw-r--r-- |
22,898 |
global_alignment_hirschberg_impl.h
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- |
rw-r--r-- |
27,830 |
global_alignment_myers_hirschberg_impl.h
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- |
rw-r--r-- |
7,857 |
global_alignment_myers_impl.h
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- |
rw-r--r-- |
9,421 |
global_alignment_specialized.h
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- |
rw-r--r-- |
52,700 |
global_alignment_unbanded.h
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- |
rw-r--r-- |
19,472 |
local_alignment_banded.h
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- |
rw-r--r-- |
25,878 |
local_alignment_banded_waterman_eggert_impl.h
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- |
rw-r--r-- |
8,631 |
local_alignment_enumeration.h
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- |
rw-r--r-- |
5,778 |
local_alignment_enumeration_banded.h
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- |
rw-r--r-- |
5,499 |
local_alignment_enumeration_unbanded.h
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- |
rw-r--r-- |
32,192 |
local_alignment_unbanded.h
|
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- |
rw-r--r-- |
26,855 |
local_alignment_waterman_eggert_impl.h
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- |
rw-r--r-- |
34,880 |
matrix_base.h
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