package info (click to toggle)
sortmerna 4.3.7-3
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: forky, sid
  • size: 134,048 kB
  • sloc: cpp: 24,424; ansic: 15,923; python: 1,453; sh: 224; makefile: 31

Folder: include

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 4,186 ThreadPool.hpp
- - rw-r--r-- 4,722 alignment.hpp
- - rw-r--r-- 1,487 baserec.hpp
- - rw-r--r-- 3,025 bitvector.hpp
- - rw-r--r-- 1,476 build_version.h
- - rw-r--r-- 1,785 cmd.hpp
- - rw-r--r-- 7,175 common.hpp
- - rw-r--r-- 4,113 config.h
- - rw-r--r-- 2,649 index.hpp
- - rw-r--r-- 3,369 indexdb.hpp
- - rw-r--r-- 3,396 izlib.hpp
- - rw-r--r-- 8,080 kseq.h
- - rw-r--r-- 2,012 kseq_load.hpp
- - rw-r--r-- 1,683 kvdb.hpp
- - rw-r--r-- 2,583 loadgenome.hpp
- - rw-r--r-- 2,510 minoccur.hpp
- - rw-r--r-- 38,528 options.hpp
- - rw-r--r-- 2,292 otumap.h
- - rw-r--r-- 2,098 output.hpp
- - rw-r--r-- 2,793 paralleltraversal.hpp
- - rw-r--r-- 1,676 processor.hpp
- - rw-r--r-- 7,417 read.hpp
- - rw-r--r-- 6,486 readfeed.hpp
- - rw-r--r-- 1,651 readfile.h
- - rw-r--r-- 5,359 readsqueue.hpp
- - rw-r--r-- 1,893 readstate.h
- - rw-r--r-- 3,960 readstats.hpp
- - rw-r--r-- 3,034 references.hpp
- - rw-r--r-- 2,808 refstats.hpp
- - rw-r--r-- 3,256 report.h
- - rw-r--r-- 1,605 report_biom.h
- - rw-r--r-- 2,196 report_blast.h
- - rw-r--r-- 1,740 report_denovo.h
- - rw-r--r-- 1,999 report_fastx.h
- - rw-r--r-- 3,351 report_fx_base.h
- - rw-r--r-- 1,744 report_fx_other.h
- - rw-r--r-- 1,701 report_sam.h
- - rw-r--r-- 402,333 sse2neon.h
- - rw-r--r-- 7,284 ssw.h
- - rw-r--r-- 6,336 ssw.hpp
- - rw-r--r-- 2,313 summary.hpp
- - rw-r--r-- 4,477 traverse_bursttrie.hpp
- - rw-r--r-- 1,610 triestats.hpp
- - rw-r--r-- 1,341 version.h
- - rw-r--r-- 1,723 writer.hpp