package info (click to toggle)
r-bioc-deseq2 1.30.1%2Bdfsg-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bullseye
  • size: 1,720 kB
  • sloc: cpp: 413; sh: 14; makefile: 2

Folder: man

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 9,058 DESeq.Rd
- - rw-r--r-- 1,775 DESeq2-package.Rd
- - rw-r--r-- 4,502 DESeqDataSet.Rd
- - rw-r--r-- 849 DESeqResults.Rd
- - rw-r--r-- 748 DESeqTransform.Rd
- - rw-r--r-- 1,254 coef.Rd
- - rw-r--r-- 2,337 collapseReplicates.Rd
- - rw-r--r-- 1,423 counts.Rd
- - rw-r--r-- 897 design.Rd
- - rw-r--r-- 1,546 dispersionFunction.Rd
- - rw-r--r-- 901 dispersions.Rd
- - rw-r--r-- 1,972 estimateBetaPriorVar.Rd
- - rw-r--r-- 5,847 estimateDispersions.Rd
- - rw-r--r-- 4,648 estimateDispersionsGeneEst.Rd
- - rw-r--r-- 4,677 estimateSizeFactors.Rd
- - rw-r--r-- 2,009 estimateSizeFactorsForMatrix.Rd
- - rw-r--r-- 2,999 fpkm.Rd
- - rw-r--r-- 1,885 fpm.Rd
- - rw-r--r-- 1,705 integrateWithSingleCell.Rd
- - rw-r--r-- 7,334 lfcShrink.Rd
- - rw-r--r-- 1,273 makeExampleDESeqDataSet.Rd
- - rw-r--r-- 2,694 nbinomLRT.Rd
- - rw-r--r-- 6,297 nbinomWaldTest.Rd
- - rw-r--r-- 602 normTransform.Rd
- - rw-r--r-- 2,424 normalizationFactors.Rd
- - rw-r--r-- 466 normalizeGeneLength.Rd
- - rw-r--r-- 1,335 plotCounts.Rd
- - rw-r--r-- 1,551 plotDispEsts.Rd
- - rw-r--r-- 2,958 plotMA.Rd
- - rw-r--r-- 1,933 plotPCA.Rd
- - rw-r--r-- 862 plotSparsity.Rd
- - rw-r--r-- 707 priorInfo.Rd
- - rw-r--r-- 3,387 replaceOutliers.Rd
- - rw-r--r-- 15,958 results.Rd
- - rw-r--r-- 6,112 rlog.Rd
- - rw-r--r-- 521 show.Rd
- - rw-r--r-- 1,101 sizeFactors.Rd
- - rw-r--r-- 806 summary.Rd
- - rw-r--r-- 3,209 unmix.Rd
- - rw-r--r-- 5,962 varianceStabilizingTransformation.Rd
- - rw-r--r-- 1,675 vst.Rd