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Folder: modules
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.. (parent) | |||
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- | rw-r--r-- | 1,139 | adapterRemoval.md |
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- | rw-r--r-- | 454 | afterqc.md |
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- | rw-r--r-- | 513 | anglerfish.md |
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- | rw-r--r-- | 393 | bamtools.md |
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- | rw-r--r-- | 993 | bbduk.md |
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- | rw-r--r-- | 1,737 | bbmap.md |
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- | rw-r--r-- | 961 | bcftools.md |
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- | rw-r--r-- | 533 | bcl2fastq.md |
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- | rw-r--r-- | 1,755 | bclconvert.md |
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- | rw-r--r-- | 623 | biobambam2.md |
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- | rw-r--r-- | 710 | biobloomtools.md |
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- | rw-r--r-- | 782 | biscuit.md |
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- | rw-r--r-- | 416 | bismark.md |
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- | rw-r--r-- | 289 | bowtie1.md |
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- | rw-r--r-- | 1,626 | bowtie2.md |
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- | rw-r--r-- | 606 | busco.md |
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- | rw-r--r-- | 619 | bustools.md |
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- | rw-r--r-- | 648 | ccs.md |
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- | rw-r--r-- | 907 | cellranger.md |
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- | rw-r--r-- | 481 | checkqc.md |
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- | rw-r--r-- | 413 | clipandmerge.md |
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- | rw-r--r-- | 782 | clusterflow.md |
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- | rw-r--r-- | 468 | conpair.md |
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- | rw-r--r-- | 960 | cutadapt.md |
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- | rw-r--r-- | 252 | damageprofiler.md |
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- | rw-r--r-- | 476 | dedup.md |
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- | rw-r--r-- | 1,983 | deeptools.md |
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- | rw-r--r-- | 875 | diamond.md |
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- | rw-r--r-- | 493 | disambiguate.md |
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- | rw-r--r-- | 2,590 | dragen.md |
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- | rw-r--r-- | 2,020 | dragen_fastqc.md |
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- | rw-r--r-- | 395 | eigenstratdatabasetools.md |
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- | rw-r--r-- | 635 | fastp.md |
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- | rw-r--r-- | 1,090 | fastq_screen.md |
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- | rw-r--r-- | 3,954 | fastqc.md |
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- | rw-r--r-- | 1,091 | featureCounts.md |
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- | rw-r--r-- | 444 | fgbio.md |
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- | rw-r--r-- | 913 | filtlong.md |
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- | rw-r--r-- | 1,213 | flash.md |
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- | rw-r--r-- | 425 | flexbar.md |
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- | rw-r--r-- | 1,460 | gatk.md |
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- | rw-r--r-- | 1,025 | gffcompare.md |
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- | rw-r--r-- | 1,005 | goleft_indexcov.md |
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- | rw-r--r-- | 672 | gopeaks.md |
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- | rw-r--r-- | 228 | happy.md |
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- | rw-r--r-- | 321 | hicexplorer.md |
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- | rw-r--r-- | 509 | hicpro.md |
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- | rw-r--r-- | 394 | hicup.md |
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- | rw-r--r-- | 132 | hifiasm.md |
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- | rw-r--r-- | 1,284 | hisat2.md |
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- | rw-r--r-- | 1,134 | homer.md |
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- | rw-r--r-- | 569 | hops.md |
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- | rw-r--r-- | 662 | htseq.md |
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- | rw-r--r-- | 208 | humid.md |
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- | rw-r--r-- | 998 | interop.md |
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- | rw-r--r-- | 393 | ivar.md |
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- | rw-r--r-- | 1,034 | jcvi.md |
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- | rw-r--r-- | 1,193 | jellyfish.md |
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- | rw-r--r-- | 537 | kaiju.md |
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- | rw-r--r-- | 653 | kallisto.md |
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- | rw-r--r-- | 369 | kat.md |
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- | rw-r--r-- | 787 | kraken.md |
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- | rw-r--r-- | 372 | leehom.md |
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- | rw-r--r-- | 1,083 | lima.md |
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- | rw-r--r-- | 793 | longranger.md |
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- | rw-r--r-- | 590 | macs2.md |
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- | rw-r--r-- | 295 | methylQA.md |
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- | rw-r--r-- | 550 | minionqc.md |
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- | rw-r--r-- | 1,007 | prokka.md |
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- | rw-r--r-- | 2,067 | quast.md |
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- | rw-r--r-- | 411 | skewer.md |
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- | rw-r--r-- | 745 | snpeff.md |
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- | rw-r--r-- | 728 | theta2.md |
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- | rw-r--r-- | 706 | trimmomatic.md |
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- | rw-r--r-- | 879 | varscan2.md |
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- | rw-r--r-- | 1,466 | vcftools.md |
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- | rwxr-xr-x | 1,007 | vep.md |
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- | rw-r--r-- | 1,557 | verifybamid.md |
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- | rw-r--r-- | 465 | whatshap.md |