package info
(click to toggle)
Folder: bcftools
![]() |
.. (parent) | |||
![]() |
d | rwxr-xr-x | 45 | htslib-1.9 |
![]() |
d | rwxr-xr-x | 4,096 | plugins |
![]() |
d | rwxr-xr-x | 118 | test |
![]() |
- | rw-r--r-- | 18,249 | HMM.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 18,278 | HMM.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 5,022 | HMM.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 37,442 | LICENSE |
![]() |
- | rw-r--r-- | 246 | README |
![]() |
- | rw-r--r-- | 32,368 | bam2bcf.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 32,433 | bam2bcf.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 5,089 | bam2bcf.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 21,936 | bam2bcf_indel.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 22,064 | bam2bcf_indel.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 13,697 | bam_sample.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 13,726 | bam_sample.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 2,030 | bam_sample.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 3,155 | bcftools.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 1,505 | bcftools.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 1,021 | bcftools.pysam.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 3,381 | bin.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 3,410 | bin.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 2,188 | bin.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 4,689 | call.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 13,166 | ccall.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 13,195 | ccall.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 34,501 | consensus.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 34,881 | consensus.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 54,286 | convert.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 54,351 | convert.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 1,751 | convert.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 153,490 | csq.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 154,095 | csq.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 8,856 | em.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 8,957 | em.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 108,120 | filter.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 108,239 | filter.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 1,982 | filter.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 8,048 | gvcf.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 8,077 | gvcf.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 1,561 | gvcf.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 12,739 | hclust.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 12,840 | hclust.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 2,781 | hclust.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 3,163 | khash_str2str.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 7,726 | kheap.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 7,269 | kmin.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 7,298 | kmin.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 1,619 | kmin.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 8,867 | main.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 9,022 | main.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 59,057 | mcall.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 59,185 | mcall.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 48,680 | mpileup.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 49,033 | mpileup.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 62,247 | mw.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 8,135 | ploidy.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 8,164 | ploidy.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 4,409 | ploidy.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 20,479 | prob1.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 20,544 | prob1.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 3,551 | prob1.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 7,538 | rbuf.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 18,354 | regidx.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 18,455 | regidx.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 7,631 | regidx.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 18,553 | reheader.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 18,681 | reheader.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 3,519 | smpl_ilist.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 3,548 | smpl_ilist.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 1,719 | smpl_ilist.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 5,735 | tabix.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 5,917 | tabix.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 3,624 | tsv2vcf.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 3,653 | tsv2vcf.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 2,621 | tsv2vcf.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 99,638 | vcfannotate.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 99,901 | vcfannotate.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 13,174 | vcfbuf.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 13,203 | vcfbuf.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 2,795 | vcfbuf.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 35,286 | vcfcall.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 35,873 | vcfcall.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 57,906 | vcfcnv.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 58,331 | vcfcnv.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 36,430 | vcfconcat.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 36,720 | vcfconcat.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 61,487 | vcfconvert.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 62,380 | vcfconvert.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 23,098 | vcffilter.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 23,325 | vcffilter.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 33,847 | vcfgtcheck.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 34,110 | vcfgtcheck.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 8,634 | vcfindex.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 8,942 | vcfindex.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 25,334 | vcfisec.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 25,705 | vcfisec.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 97,260 | vcfmerge.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 97,766 | vcfmerge.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 80,193 | vcfnorm.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 80,510 | vcfnorm.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 21,509 | vcfplugin.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 21,997 | vcfplugin.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 15,534 | vcfquery.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 15,806 | vcfquery.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 49,622 | vcfroh.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 50,128 | vcfroh.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 23,895 | vcfsom.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 24,212 | vcfsom.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 9,492 | vcfsort.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 9,656 | vcfsort.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 72,416 | vcfstats.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 75,226 | vcfstats.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 35,764 | vcfview.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 36,243 | vcfview.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 4,526 | vcmp.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 4,555 | vcmp.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 2,438 | vcmp.h |
![]() |
- | rw-r--r-- | 1,918 | version.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 1,956 | version.c.pysam.c |
![]() |
- | rw-r--r-- | 31 | version.h |