package info (click to toggle)
python-pysam 0.7.7-1~bpo70%2B1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: wheezy-backports
  • size: 11,096 kB
  • sloc: ansic: 25,638; python: 3,882; makefile: 157; sh: 12

Folder: samtools

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 4,096 bcftools
d d rwxr-xr-x 78 misc
d d rwxr-xr-x 87 win32
- - rw-r--r-- 0 __init__.py
- - rw-r--r-- 16,005 bam.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 25,785 bam.h
- - rw-r--r-- 14,830 bam2bcf.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 1,889 bam2bcf.h
- - rw-r--r-- 18,393 bam2bcf_indel.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 5,884 bam2depth.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 5,107 bam_aux.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 5,837 bam_cat.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 3,353 bam_color.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 1,064 bam_endian.h
- - rw-r--r-- 16,503 bam_import.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 21,549 bam_index.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 5,006 bam_lpileup.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 4,579 bam_mate.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 12,992 bam_md.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 12,984 bam_pileup.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 22,299 bam_plcmd.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 1,532 bam_reheader.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 5,669 bam_rmdup.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 4,149 bam_rmdupse.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 18,775 bam_sort.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 3,226 bam_stat.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 11,435 bam_tview.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 1,880 bam_tview.h
- - rw-r--r-- 7,901 bam_tview_curses.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 8,430 bam_tview_html.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 3,810 bamshuf.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 3,169 bedcov.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 3,902 bedidx.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 21,147 bgzf.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 6,326 bgzf.h
- - rw-r--r-- 5,691 cut_target.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 3,505 errmod.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 442 errmod.h
- - rw-r--r-- 10,980 faidx.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 3,188 faidx.h
- - rw-r--r-- 15,250 kaln.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 2,072 kaln.h
- - rw-r--r-- 17,815 khash.h
- - rw-r--r-- 3,472 klist.h
- - rw-r--r-- 18,376 knetfile.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 1,611 knetfile.h
- - rw-r--r-- 10,705 kprobaln.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 1,568 kprobaln.h
- - rw-r--r-- 8,811 kseq.h
- - rw-r--r-- 10,125 ksort.h
- - rw-r--r-- 5,408 kstring.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 4,459 kstring.h
- - rw-r--r-- 17,246 padding.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 20,863 phase.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 82 pysam.h
- - rw-r--r-- 24,377 razf.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 4,137 razf.h
- - rw-r--r-- 6,083 sam.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 2,688 sam.h
- - rw-r--r-- 21,274 sam_header.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 1,597 sam_header.h
- - rw-r--r-- 14,979 sam_view.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 3,004 sample.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 396 sample.h