package info (click to toggle)
r-bioc-cner 1.26.0%2Bdfsg-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bullseye
  • size: 18,216 kB
  • sloc: ansic: 23,458; makefile: 6

Folder: man

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 1,062 AssemblyStats.Rd
- - rw-r--r-- 4,331 Axt-class.Rd
- - rw-r--r-- 742 Axt-util.Rd
- - rw-r--r-- 5,306 CNE-class.Rd
- - rw-r--r-- 302 CNEDanRer10Hg38.Rd
- - rw-r--r-- 2,418 CNEDensity.Rd
- - rw-r--r-- 6,252 GRangePairs-class.Rd
- - rw-r--r-- 878 addAncestorGO.Rd
- - rw-r--r-- 455 axisTrack.Rd
- - rw-r--r-- 2,213 axtChain.Rd
- - rw-r--r-- 594 axtInfo.Rd
- - rw-r--r-- 2,092 binner.Rd
- - rw-r--r-- 1,707 blatCNE.Rd
- - rw-r--r-- 3,784 ceScan-methods.Rd
- - rw-r--r-- 2,580 chainMergeSort.Rd
- - rw-r--r-- 3,542 chainNetSyntenic.Rd
- - rw-r--r-- 2,734 chainPreNet.Rd
- - rw-r--r-- 345 cneFinalListDanRer10Hg38.Rd
- - rw-r--r-- 2,116 cneMerge.Rd
- - rw-r--r-- 690 fetchChromSizes.Rd
- - rw-r--r-- 1,616 fixCoordinates.Rd
- - rw-r--r-- 448 grangesPairsForDotplot.Rd
- - rw-r--r-- 2,343 last.Rd
- - rw-r--r-- 2,427 lastz.Rd
- - rw-r--r-- 1,395 lavToPsl.Rd
- - rw-r--r-- 1,109 makeAncoraFiles.Rd
- - rw-r--r-- 1,144 makeAxtTracks.Rd
- - rw-r--r-- 2,204 makeCNEDensity.Rd
- - rw-r--r-- 2,795 makeGRBs.Rd
- - rw-r--r-- 1,076 matchDistribution.Rd
- - rw-r--r-- 3,013 netToAxt.Rd
- - rw-r--r-- 607 orgKEGGIds2EntrezIDs.Rd
- - rw-r--r-- 1,779 plotCNEDistribution.Rd
- - rw-r--r-- 1,461 plotCNEWidth.Rd
- - rw-r--r-- 1,934 psubAxt.Rd
- - rw-r--r-- 792 queryCNEData.Rd
- - rw-r--r-- 703 read.rmMask.GRanges.Rd
- - rw-r--r-- 684 read.rmskFasta.Rd
- - rw-r--r-- 1,435 readAncora.Rd
- - rw-r--r-- 1,348 readAncoraIntoSQLite.Rd
- - rw-r--r-- 1,552 readAxt.Rd
- - rw-r--r-- 1,815 readBed.Rd
- - rw-r--r-- 3,229 readCNERangesFromSQLite.Rd
- - rw-r--r-- 640 reverseCigar.Rd
- - rw-r--r-- 1,327 saveCNEToSQLite.Rd
- - rw-r--r-- 919 scoringMatrix.Rd
- - rw-r--r-- 3,904 subAxt-methods.Rd
- - rw-r--r-- 2,633 syntenicDotplot.Rd
- - rw-r--r-- 550 writeAxt.Rd