 |
|
|
|
.. (parent) |
 |
d |
rwxr-xr-x |
155 |
benchmark
|
 |
d |
rwxr-xr-x |
91 |
data
|
 |
d |
rwxr-xr-x |
4,096 |
support
|
 |
- |
rw-r--r-- |
708 |
__init__.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,094 |
__main__.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,088 |
base_newick_test_cases.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,973 |
base_standard_trees_parsing_test_cases.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,536 |
test_asciitree.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,322 |
test_birthdeath.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,820 |
test_coalescent.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,790 |
test_container_frozen_ordered_dict.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,802 |
test_container_normalized_bitmask_dict.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,468 |
test_container_ordered_set.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18,854 |
test_continuous.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,756 |
test_dataio_basic_tree.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,072 |
test_dataio_fasta_reader.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,515 |
test_dataio_fasta_writer.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,063 |
test_dataio_newick_reader_rooting.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
45,882 |
test_dataio_newick_reader_tree.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,224 |
test_dataio_newick_reader_tree_iter.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,704 |
test_dataio_newick_reader_tree_list.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
20,546 |
test_dataio_newick_writer.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,306 |
test_dataio_nexml_reader_chars.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,842 |
test_dataio_nexml_reader_tree_list.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,013 |
test_dataio_nexml_writer_chars.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,426 |
test_dataio_nexml_writer_trees.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,149 |
test_dataio_nexus_reader_chars.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17,559 |
test_dataio_nexus_reader_dataset.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,666 |
test_dataio_nexus_reader_tree_list.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,735 |
test_dataio_nexus_taxon_handling.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,481 |
test_dataio_nexus_tree_yielder.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,767 |
test_dataio_nexus_writer_chars.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,326 |
test_dataio_nexus_writer_dataset.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19,074 |
test_dataio_nexus_writer_tree.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,239 |
test_dataio_nexus_writer_tree_list.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,996 |
test_dataio_phylip_reader_chars.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,408 |
test_dataio_phylip_writer_chars.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,065 |
test_dataio_tokenizer.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,866 |
test_datamodel_annotations.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,252 |
test_datamodel_bipartitions.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
48,672 |
test_datamodel_charmatrix.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,584 |
test_datamodel_dataset.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19,434 |
test_datamodel_split_bitmasks.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
27,732 |
test_datamodel_statealphabet.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
33,810 |
test_datamodel_taxon.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,499 |
test_datamodel_tree_construction_copying_and_identity.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,960 |
test_datamodel_tree_edge_fundamentals.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
52,287 |
test_datamodel_tree_list.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13,194 |
test_datamodel_tree_node_fundamentals.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
27,308 |
test_datamodel_tree_structure_and_iteration.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
20,148 |
test_datamodel_tree_taxon_management.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,401 |
test_datamodel_treearray.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,427 |
test_fitch.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,819 |
test_multispeciescoalescent.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
46,341 |
test_parsimony_scoring.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13,605 |
test_paup.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
50,165 |
test_phylogenetic_distance_matrix.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,091 |
test_popgenstat.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17,198 |
test_protractedspeciation.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
42,004 |
test_statistics.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
102,095 |
test_tree_calculations_and_metrics.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,227 |
test_tree_from_splits.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
49,867 |
test_tree_operations_and_manipulations.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,627 |
test_tree_reconciliation_and_discordance.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
20,980 |
test_tree_shape_kernel.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,417 |
test_tree_split_compatibility.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17,664 |
test_tree_summarization_and_consensus.py
|