 |
|
|
|
.. (parent) |
 |
- |
rw-r--r-- |
6,468 |
attractorsToLaTeX.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,698 |
binarizeTimeSeries.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,966 |
chooseNetwork.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,864 |
edgeDetector.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
892 |
fixGenes.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,322 |
generateRandomNKNetwork.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,535 |
generateRandomStartStates.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,003 |
generateState.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,918 |
generateTimeSeries.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,434 |
getAttractorSequence.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,255 |
getAttractors.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
525 |
getBasinOfAttraction.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,272 |
getPathToAttractor.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,850 |
getStateSummary.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,023 |
getTransitionProbabilities.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,291 |
getTransitionTable.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,156 |
helpers.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,147 |
loadBioTapestry.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,988 |
loadNetwork.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19,251 |
loadSBML.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,297 |
markovSimulation.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13,825 |
parseBooleanFunction.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,466 |
perturbNetwork.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,488 |
perturbTrajectories.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,988 |
plotAttractors.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,728 |
plotNetworkWiring.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,720 |
plotPBNTransitions.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,756 |
plotSequence.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,883 |
plotStateGraph.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,366 |
print.AttractorInfo.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
728 |
print.BooleanNetwork.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
327 |
print.BooleanStateInfo.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,098 |
print.MarkovSimulation.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,432 |
print.ProbabilisticBooleanNetwork.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
498 |
print.SymbolicBooleanNetwork.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,023 |
print.SymbolicSimulation.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,223 |
print.TransitionTable.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,713 |
reconstructNetwork.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,765 |
saveNetwork.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,735 |
scanStatistic.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,171 |
sequenceToLaTeX.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,624 |
simplifyNetwork.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,360 |
simulateSymbolicModel.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,248 |
stateTransition.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
636 |
symbolicToTruthTable.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,007 |
testNetworkProperties.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,180 |
toPajek.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,452 |
toSBML.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,377 |
truthTableToSymbolic.R
|
 |
- |
rw-r--r-- |
800 |
zeta.R
|