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FeatureFinderMRM_1_output.txt
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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FeatureLinkerLabeled_2_parameters.ini
|
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|
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|
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4,050 |
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
 |
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|
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4,274 |
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|
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2,340 |
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|
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FileConverter_16_output.consensusXML
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78,655 |
FileInfo_4_input.mzXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
896 |
FileInfo_4_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
45,809 |
FileInfo_5_input.mzDat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,233 |
FileInfo_5_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,607 |
FileInfo_6_input.mzData
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,648 |
FileInfo_6_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,381 |
FileInfo_7_input.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,752 |
FileInfo_7_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,036 |
FileInfo_8_input.notype
|
 |
- |
rw-r--r-- |
956 |
FileInfo_8_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,473 |
FileInfo_9_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,979 |
FileInfo_9_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
28 |
FileMerger_1_input1.dta2d
|
 |
- |
rw-r--r-- |
29 |
FileMerger_1_input2.dta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
28 |
FileMerger_1_input3.dta2d
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,904 |
FileMerger_1_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
36 |
FileMerger_2_input1.dta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
37 |
FileMerger_2_input2.dta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,316 |
FileMerger_2_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
28 |
FileMerger_3_input1.dta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
29 |
FileMerger_3_input2.dta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,275 |
FileMerger_3_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
83 |
FileMerger_4_input1.dta2d
|
 |
- |
rw-r--r-- |
83 |
FileMerger_4_input2.dta2d
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,574 |
FileMerger_4_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
100 |
FileMerger_5_input1.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
29 |
FileMerger_5_input_rt1023.331.dta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
29 |
FileMerger_5_input_rt2044.334.dta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
29 |
FileMerger_5_input_rt889.32.dta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,455 |
FileMerger_5_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,016 |
FileMerger_6_input1.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,686 |
FileMerger_6_input2.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
16,703 |
FileMerger_6_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,513 |
FileMerger_7_input1.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,690 |
FileMerger_7_input2.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,575 |
FileMerger_7_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,113 |
FileMerger_8_input1.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,299 |
FileMerger_8_input2.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,930 |
FileMerger_8_output.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
16,615 |
FileMerger_9_input1.traML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,856 |
FileMerger_9_input2.traML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
21,057 |
FileMerger_9_output.traML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,484 |
FuzzyDiff.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19,051 |
IDConflictResolver_1_input.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,225 |
IDConflictResolver_1_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18,671 |
IDConflictResolver_2_input.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,982 |
IDConflictResolver_2_output.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,234 |
IDFileConverter_1_input1.mascotXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,219,974 |
IDFileConverter_1_input2.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,342 |
IDFileConverter_1_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,611 |
IDFileConverter_2_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,550 |
IDFileConverter_3_input.protXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,747 |
IDFileConverter_3_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,679 |
IDFileConverter_4_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,298 |
IDFileConverter_5_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,217 |
IDFileConverter_5_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,380 |
IDFileConverter_6_input1.pepXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,546 |
IDFileConverter_6_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
55 |
IDFilter_1_input.fas
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,571 |
IDFilter_1_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,116 |
IDFilter_1_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,707 |
IDFilter_2_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,332 |
IDFilter_2_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,184 |
IDFilter_3_2_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,415 |
IDFilter_3_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,330 |
IDFilter_3_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,180 |
IDFilter_4_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,395 |
IDFilter_4_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,693 |
IDFilter_5_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,332 |
IDFilter_5_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,707 |
IDFilter_6_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,332 |
IDFilter_6_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,035 |
IDFilter_7_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,228 |
IDFilter_7_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,563 |
IDMapper_1_input.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,327 |
IDMapper_1_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,531 |
IDMapper_1_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,860 |
IDMapper_2_input.consensusXML
|
 |
- |
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121,930 |
IDMapper_2_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
137,505 |
IDMapper_2_output.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,690 |
IDMapper_3_input.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,459 |
IDMapper_3_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,410 |
IDMapper_3_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,533 |
IDMerger_1_input1.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,450 |
IDMerger_1_input2.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,542 |
IDMerger_1_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,653 |
IDMerger_2_input1.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,105 |
IDMerger_2_input2.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,334 |
IDMerger_2_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,725 |
IDMerger_3_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,241 |
IDMerger_4_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,147 |
IDPosteriorErrorProbability_Mascot_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,855 |
IDPosteriorErrorProbability_Mascot_input2.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,846 |
IDPosteriorErrorProbability_Mascot_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18,492 |
IDPosteriorErrorProbability_Mascot_output2.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,387 |
IDPosteriorErrorProbability_OMSSA_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,122 |
IDPosteriorErrorProbability_OMSSA_input2.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,956 |
IDPosteriorErrorProbability_OMSSA_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,587 |
IDPosteriorErrorProbability_OMSSA_output2.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
112,740 |
IDPosteriorErrorProbability_XTandem_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,704 |
IDPosteriorErrorProbability_XTandem_input2.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
114,703 |
IDPosteriorErrorProbability_XTandem_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
16,553 |
IDPosteriorErrorProbability_XTandem_output2.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,152 |
IDPosteriorErrorProbability_bad_data.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,958 |
IDRTCalibration_1_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,101 |
IDRTCalibration_1_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
967 |
IDRTCalibration_2_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,804 |
IDRipper_1_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,643 |
IDRipper_1_output1.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,833 |
IDRipper_1_output2.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,423 |
IDRipper_2_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,462 |
IDRipper_2_output1.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,771 |
IDRipper_2_output2.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,462 |
IDRipper_3_input1.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,771 |
IDRipper_3_input2.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,722 |
IDRipper_3_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,413 |
IDSplitter_1_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,295 |
IDSplitter_1_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
28,439 |
INIUpdater_1_noupdate.toppas
|
 |
- |
rw-r--r-- |
23,824 |
INIUpdater_2_broken.toppas
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,673 |
INIUpdater_3_old.toppas
|
 |
- |
rw-r--r-- |
27,812 |
INIUpdater_3_old_out.toppas
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,719 |
ITRAQAnalyzer.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,330 |
ITRAQAnalyzer_input_1.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,330 |
ITRAQAnalyzer_input_2.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,932 |
ITRAQAnalyzer_output_1.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,054 |
ITRAQAnalyzer_output_2.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
52,081 |
ImageCreator_1_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
954 |
ImageCreator_1_output.bmp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13,070 |
ImageCreator_2_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
954 |
ImageCreator_2_output.bmp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
262 |
InclusionExclusionListCreator.fasta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
42,041 |
InclusionExclusionListCreator.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,275 |
InclusionExclusionListCreator.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
142 |
InclusionExclusionListCreator_1_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,452 |
InclusionExclusionListCreator_2.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
141 |
InclusionExclusionListCreator_2_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,172 |
InclusionExclusionListCreator_3_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,453 |
InclusionExclusionListCreator_4.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,379 |
InclusionExclusionListCreator_4_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
491 |
InclusionExclusionListCreator_5_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,453 |
InclusionExclusionListCreator_6.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
392 |
InclusionExclusionListCreator_6_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,350 |
InclusionExclusionListCreator_rt.model
|
 |
- |
rw-r--r-- |
645 |
InclusionExclusionListCreator_rt.model_additional_parameters
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13,694 |
InclusionExclusionListCreator_rt.model_samples
|
 |
- |
rw-r--r-- |
89,165 |
Inspect.mzData
|
 |
- |
rw-r--r-- |
78,655 |
Inspect.mzXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
268 |
InspectAdapter.out
|
 |
- |
rw-r--r-- |
81 |
InspectAdapter_1_output.modification_list.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,842 |
InspectAdapter_1_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
238 |
InspectAdapter_2_output.inspect_in
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,110 |
InspectAdapter_2_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,151 |
InspectAdapter_4_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
541 |
Inspect_FASTAFile_test.fasta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
368 |
Inspect_FASTAFile_test.index
|
 |
- |
rw-r--r-- |
836 |
Inspect_FASTAFile_test.trie
|
 |
- |
rw-r--r-- |
184 |
Inspect_FASTAFile_test2.index
|
 |
- |
rw-r--r-- |
344 |
Inspect_FASTAFile_test2.trie
|
 |
- |
rw-r--r-- |
368 |
Inspect_FASTAFile_test4.index
|
 |
- |
rw-r--r-- |
836 |
Inspect_FASTAFile_test4.trie
|
 |
- |
rw-r--r-- |
184 |
Inspect_FASTAFile_test5.index
|
 |
- |
rw-r--r-- |
492 |
Inspect_FASTAFile_test5.trie
|
 |
- |
rw-r--r-- |
149 |
Inspect_PTMs.xml
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,834,797 |
InternalCalibration_1_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,835,282 |
InternalCalibration_1_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,418 |
InternalCalibration_2_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,903 |
InternalCalibration_2_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
27 |
InternalCalibration_ref_masses
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,513 |
IsobaricAnalyzer.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,330 |
IsobaricAnalyzer_input_1.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,330 |
IsobaricAnalyzer_input_2.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,614 |
IsobaricAnalyzer_output_1.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,742 |
IsobaricAnalyzer_output_2.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
423,436 |
MRMMapping_input.TraML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,082,796 |
MRMMapping_input.chrom.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,942,920 |
MRMMapping_output.chrom.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,559 |
MapAlignerIdentification_1_input1.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,557 |
MapAlignerIdentification_1_input2.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,054 |
MapAlignerIdentification_1_output1.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,052 |
MapAlignerIdentification_1_output2.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,054 |
MapAlignerIdentification_2_output1.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,829 |
MapAlignerIdentification_3_output1.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,994 |
MapAlignerIdentification_5_input1.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,991 |
MapAlignerIdentification_5_input2.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,567 |
MapAlignerIdentification_5_output1.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,564 |
MapAlignerIdentification_5_output2.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,734 |
MapAlignerIdentification_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
341,656 |
MapAlignerPoseClustering_1_input1.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
39,968 |
MapAlignerPoseClustering_1_input2.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
341,656 |
MapAlignerPoseClustering_1_input3.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
247,930 |
MapAlignerPoseClustering_1_output1.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
41,551 |
MapAlignerPoseClustering_1_output2.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
247,930 |
MapAlignerPoseClustering_1_output3.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,159 |
MapAlignerPoseClustering_1_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
271 |
MapAlignerPoseClustering_1_trafo1.trafoXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,366 |
MapAlignerPoseClustering_1_trafo2.trafoXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,954 |
MapAlignerPoseClustering_1_trafo3.trafoXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
207,715 |
MapAlignerPoseClustering_2_input1.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
207,732 |
MapAlignerPoseClustering_2_input2.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
207,715 |
MapAlignerPoseClustering_2_input3.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
208,790 |
MapAlignerPoseClustering_2_output1.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
210,089 |
MapAlignerPoseClustering_2_output2.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
208,790 |
MapAlignerPoseClustering_2_output3.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,161 |
MapAlignerPoseClustering_2_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,789 |
MapAlignerPoseClustering_4_trafo1.trafoXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
210,478 |
MapAlignerSpectrum_1_input1.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
210,499 |
MapAlignerSpectrum_1_input2.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
210,491 |
MapAlignerSpectrum_1_input3.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
211,417 |
MapAlignerSpectrum_1_output1.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
211,541 |
MapAlignerSpectrum_1_output2.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
211,541 |
MapAlignerSpectrum_1_output3.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,618 |
MapAlignerSpectrum_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
153,096 |
MapNormalizer_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
153,162 |
MapNormalizer_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,255 |
MapRTTransformer_1_input.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,591 |
MapRTTransformer_1_output1.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,625 |
MapRTTransformer_1_output2.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
269 |
MapRTTransformer_1_trafo1.trafoXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
381 |
MapRTTransformer_1_trafo2.trafoXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
69,538 |
MapRTTransformer_2_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
70,514 |
MapRTTransformer_2_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
381 |
MapRTTransformer_2_trafo.trafoXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,366 |
MapRTTransformer_3_trafo.trafoXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,706 |
MapRTTransformer_4_input.chrom.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,200 |
MapRTTransformer_4_output.chrom.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
381 |
MapRTTransformer_4_trafo.trafoXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,615 |
MascotAdapter_1_input.mzData
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,003 |
MascotAdapter_1_output.mascot_in
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,425 |
MascotAdapter_1_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,923 |
MascotAdapter_2_input.mascotXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,827 |
MascotAdapter_2_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
127 |
MassCalculator_1_input.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
757 |
MassCalculator_1_output.csv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
418 |
MassCalculator_2_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,285 |
MassTraceExtractor.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,137,598 |
MassTraceExtractor_1_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
434,441 |
MassTraceExtractor_1_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,231 |
NoiseFilterGaussian_1_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,135 |
NoiseFilterGaussian_1_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,701 |
NoiseFilterGaussian_1_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,706 |
NoiseFilterGaussian_2_input.chrom.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,148 |
NoiseFilterGaussian_2_output.chrom.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,280 |
NoiseFilterGaussian_2_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,231 |
NoiseFilterSGolay_1_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,147 |
NoiseFilterSGolay_1_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
308 |
NoiseFilterSGolay_1_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,706 |
NoiseFilterSGolay_2_input.chrom.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,146 |
NoiseFilterSGolay_2_output.chrom.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,995 |
NoiseFilterSGolay_2_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,826 |
OpenSwathAnalyzer_1_input.TraML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,706 |
OpenSwathAnalyzer_1_input_chrom.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,748 |
OpenSwathAnalyzer_1_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,029 |
OpenSwathAnalyzer_2_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,591,101 |
OpenSwathAnalyzer_2_swathfile.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,885 |
OpenSwathAnalyzer_5.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,029 |
OpenSwathAnalyzer_5_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,029 |
OpenSwathAnalyzer_6_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,208 |
OpenSwathAnalyzer_7_backgroundSubtraction.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,739 |
OpenSwathAnalyzer_7_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,217 |
OpenSwathAnalyzer_mod_input.TraML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,427 |
OpenSwathChromatogramExtractor_input.TraML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,591,277 |
OpenSwathChromatogramExtractor_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
359 |
OpenSwathChromatogramExtractor_input.trafoXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
28,386 |
OpenSwathChromatogramExtractor_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
26,149 |
OpenSwathChromatogramExtractor_output_2.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
365 |
OpenSwathConfidenceScoring_1_input.trafoXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18,533 |
OpenSwathConfidenceScoring_1_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
27,564 |
OpenSwathDecoyGenerator_input.TraML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
27,557 |
OpenSwathDecoyGenerator_input_2.TraML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
27,564 |
OpenSwathDecoyGenerator_input_3.TraML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
28,748 |
OpenSwathDecoyGenerator_output.TraML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
54,617 |
OpenSwathDecoyGenerator_output_2.TraML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
26,080 |
OpenSwathDecoyGenerator_output_3.TraML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,298 |
OpenSwathFeatureXMLToTSV_3_output.short.csv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,826 |
OpenSwathFeatureXMLToTSV_input.TraML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17,664 |
OpenSwathFeatureXMLToTSV_input.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,109 |
OpenSwathFeatureXMLToTSV_output.long.csv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,574 |
OpenSwathFeatureXMLToTSV_output.short.csv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,605 |
OpenSwathFeatureXMLToTSV_output.tsv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,706 |
OpenSwathMzMLFileCacher_input.chrom.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,591,279 |
OpenSwathMzMLFileCacher_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
23,131 |
OpenSwathMzMLFileCacher_output.chrom.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,576,293 |
OpenSwathMzMLFileCacher_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,110 |
OpenSwathRTNormalizer_1_input.TraML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
407,506 |
OpenSwathRTNormalizer_1_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
771 |
OpenSwathRTNormalizer_1_output.trafoXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,533 |
PTModel_1_input_negative.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,030 |
PTModel_1_input_positive.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
630 |
PTModel_1_output.additional_parameters
|
 |
- |
rw-r--r-- |
432 |
PTModel_1_output.model
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,395 |
PTModel_1_output.samples
|
 |
- |
rw-r--r-- |
743 |
PTModel_1_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,992 |
PTPredict_1_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,500 |
PTPredict_1_input.model
|
 |
- |
rw-r--r-- |
571 |
PTPredict_1_input.model_additional_parameters
|
 |
- |
rw-r--r-- |
80,235 |
PTPredict_1_input.model_samples
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,291 |
PTPredict_1_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,706 |
PeakPickerHiRes_2_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17,599 |
PeakPickerHiRes_2_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
432,225 |
PeakPickerHiRes_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
55,903 |
PeakPickerHiRes_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,965 |
PeakPickerHiRes_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,231 |
PeakPickerWavelet_2Dopt_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18,541 |
PeakPickerWavelet_2Dopt_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
941 |
PeakPickerWavelet_2Dopt_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,141 |
PeakPickerWavelet_deconv_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,724 |
PeakPickerWavelet_deconv_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,711 |
PeakPickerWavelet_deconv_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,231 |
PeakPickerWavelet_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18,541 |
PeakPickerWavelet_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,172 |
PeakPickerWavelet_output_noMetaData.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
828 |
PeakPickerWavelet_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
516 |
PeakPickerWavelet_parameters_noMetaData.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
89,165 |
PepNovo.mzData
|
 |
- |
rw-r--r-- |
78,655 |
PepNovo.mzXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
81 |
PepNovoAdapter_1_output.modification_list.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,582 |
PepNovoAdapter_1_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
76 |
PepNovoAdapter_2_output.model_list.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,814 |
PepNovoAdapter_5_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,035 |
PepNovoAdapter_5_output.pepnovo_out
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,508 |
PepNovoAdapter_5_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
149 |
PepNovo_PTMs.xml
|
 |
- |
rw-r--r-- |
807 |
PeptideIndexer_1.fasta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,991 |
PeptideIndexer_1.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,720 |
PeptideIndexer_1_out.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,369 |
PeptideIndexer_2.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,242 |
PeptideIndexer_2_out.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,331 |
PeptideIndexer_3.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,965 |
PeptideIndexer_3_out.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,885 |
PeptideIndexer_4_out.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,431 |
PeptideIndexer_5_out.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,373 |
PeptideIndexer_6_out.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,105 |
PeptideIndexer_7_out.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,220 |
PeptideIndexer_8_out.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,243 |
PeptideIndexer_9_out.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
112 |
PrecursorIonSelector_1_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,361 |
PrecursorIonSelector_1_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,249 |
PrecursorIonSelector_2_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,338 |
PrecursorIonSelector_2_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,480 |
PrecursorIonSelector_db.fasta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,147 |
PrecursorIonSelector_features.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,272 |
PrecursorIonSelector_ids.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,051 |
PrecursorMassCorrector_1.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
947,444 |
PrecursorMassCorrector_1_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
946,220 |
PrecursorMassCorrector_1_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
56,798 |
ProteinInference.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
50,911 |
ProteinInference_proteins.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,784 |
ProteinQuantifier_10_output.mzTab
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,467 |
ProteinQuantifier_11_output.mzTab
|
 |
- |
rw-r--r-- |
491 |
ProteinQuantifier_12_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
518 |
ProteinQuantifier_13_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
578 |
ProteinQuantifier_14_output1.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
975 |
ProteinQuantifier_14_output2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
232 |
ProteinQuantifier_1_output1.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
334 |
ProteinQuantifier_1_output2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
289 |
ProteinQuantifier_2_output1.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
374 |
ProteinQuantifier_2_output2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,492 |
ProteinQuantifier_3_input.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
248 |
ProteinQuantifier_3_output1.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
258 |
ProteinQuantifier_3_output2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
382 |
ProteinQuantifier_4_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
379 |
ProteinQuantifier_5_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
400 |
ProteinQuantifier_6_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
406 |
ProteinQuantifier_7_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
406 |
ProteinQuantifier_8_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
429 |
ProteinQuantifier_9_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,590 |
ProteinQuantifier_input.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,557 |
ProteinQuantifier_input.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,813 |
ProteinQuantifier_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,099 |
ProteinResolver_1_input.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,950 |
ProteinResolver_1_input.fasta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
154 |
ProteinResolver_1_input.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
734 |
ProteinResolver_1_output1.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
894 |
ProteinResolver_1_output2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
854 |
ProteinResolver_1_output3.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,842 |
QuantIDMapper_1_input.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,164 |
QuantIDMapper_1_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,291 |
RTModel_1_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,084 |
RTModel_1_output.model
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,245 |
RTModel_1_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,533 |
RTModel_2_input_negative.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,030 |
RTModel_2_input_positive.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
630 |
RTModel_2_output.additional_parameters
|
 |
- |
rw-r--r-- |
410 |
RTModel_2_output.model
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,334 |
RTModel_2_output.samples
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,232 |
RTModel_2_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,544 |
RTModel_3_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
732 |
RTModel_3_output.additional_parameters
|
 |
- |
rw-r--r-- |
418 |
RTModel_3_output.model
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,028 |
RTModel_3_output.samples
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,620 |
RTModel_3_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
783 |
RTModel_4_input.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
732 |
RTModel_4_output.additional_parameters
|
 |
- |
rw-r--r-- |
418 |
RTModel_4_output.model
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,028 |
RTModel_4_output.samples
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,270 |
RTModel_4_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,291 |
RTPredict_1_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,100 |
RTPredict_1_input.model
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,935 |
RTPredict_1_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,992 |
RTPredict_2_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
410 |
RTPredict_2_input.model
|
 |
- |
rw-r--r-- |
557 |
RTPredict_2_input.model_additional_parameters
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,334 |
RTPredict_2_input.model_samples
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,507 |
RTPredict_2_output_negative.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,454 |
RTPredict_2_output_positive.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,544 |
RTPredict_3_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
418 |
RTPredict_3_input.model
|
 |
- |
rw-r--r-- |
732 |
RTPredict_3_input.model_additional_parameters
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,028 |
RTPredict_3_input.model_samples
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,722 |
RTPredict_3_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
418 |
RTPredict_4_input.model
|
 |
- |
rw-r--r-- |
732 |
RTPredict_4_input.model_additional_parameters
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,028 |
RTPredict_4_input.model_samples
|
 |
- |
rw-r--r-- |
607 |
RTPredict_4_input.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
841 |
RTPredict_4_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,544 |
RTPredict_5_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
418 |
RTPredict_5_input.model
|
 |
- |
rw-r--r-- |
732 |
RTPredict_5_input.model_additional_parameters
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,028 |
RTPredict_5_input.model_samples
|
 |
- |
rw-r--r-- |
841 |
RTPredict_5_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13,070 |
Resampler_1_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,832 |
Resampler_1_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,248 |
SILACAnalyzer.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,228 |
SILACAnalyzer.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,235 |
SILACAnalyzer.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,107,469 |
SILACAnalyzer.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
32,263 |
SILACAnalyzer_empty.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
873 |
SILACAnalyzer_negativ.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
43,518 |
SILACAnalyzer_negativ.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,918 |
SeedListGenerator_1_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,048 |
SeedListGenerator_2_output.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
533 |
SeedListGenerator_3_output1.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,064 |
SeedListGenerator_3_output2.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
89,165 |
Sequest.mzData
|
 |
- |
rw-r--r-- |
78,655 |
Sequest.mzXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
81 |
SequestAdapter_1_output.modification_list.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,695 |
SequestAdapter_1_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,668 |
SequestAdapter_2_output.sequest_in
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,823 |
SequestAdapter_2_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,295 |
SequestAdapter_4_output.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
541 |
Sequest_FASTAFile_test.fasta
|
 |
- |
rw-r--r-- |
149 |
Sequest_PTMs.xml
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,818 |
SpecLibSearcher_1.MzData
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,274 |
SpecLibSearcher_1.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,083 |
SpecLibSearcher_1.msp
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,232 |
SpecLibSearcher_1_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,993 |
SpectraFilterSqrtMower_1_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,932 |
SpectraFilterSqrtMower_1_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,993 |
SpectraFilterWindowMower_1_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,874 |
SpectraFilterWindowMower_1_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,993 |
SpectraFilterWindowMower_2_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,934 |
SpectraFilterWindowMower_2_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
527 |
SpectraFilterWindowMower_2_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,671 |
TMTAnalyzer.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
168,765 |
TMTAnalyzer_input_1.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,386 |
TMTAnalyzer_output_1.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,211,916 |
TOFCalibration_1_calibrants.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,211,916 |
TOFCalibration_1_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,212,395 |
TOFCalibration_1_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
31,493 |
TOFCalibration_2_calibrants.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
50,030 |
TOFCalibration_2_input.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
51,041 |
TOFCalibration_2_output.mzML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
53 |
TOFCalibration_const
|
 |
- |
rw-r--r-- |
497 |
TOFCalibration_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
390 |
TOFCalibration_ref_masses
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,090 |
TextExporter_1_input.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,645 |
TextExporter_1_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,908 |
TextExporter_2_consensus_centroids.wsv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
35,326 |
TextExporter_2_consensus_elements.wsv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18,727 |
TextExporter_2_consensus_features.wsv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
20,729 |
TextExporter_2_consensus_tsv.tsv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
54,595 |
TextExporter_2_input.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,856 |
TextExporter_2_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,694 |
TextExporter_2_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,442 |
TextExporter_3_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,361 |
TextExporter_3_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
876 |
TextExporter_4_output_proteins.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,825 |
TextExporter_5_input.idXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
774 |
TextExporter_5_output_peptides.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,088 |
TextExporter_6_input.featureXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
512 |
TextExporter_6_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
108,215 |
TextExporter_7_consensus_tsv.tsv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
136,370 |
TextExporter_7_input.consensusXML
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,808 |
TextExporter_7_parameters.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
512 |
TextExporter_8_output.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,951 |
WRITE_INI_IN.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13,366 |
WRITE_INI_OUT.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,612 |
WSDL_out.wsdl
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,609 |
anonymize_xml_stylesheet_paths.sh
|
 |
- |
rw-r--r-- |
296 |
check_ini.cmake
|